RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 K7ERU9 68 aa13.23□□□□□ -0.29
CLN8-211ENST00000636934 GAGE7O76087 117 aa13.23□□□□□ -0.29
CLN8-211ENST00000636934 GAGE12FP0CL80 117 aa13.23□□□□□ -0.29
CLN8-211ENST00000636934 GAGE12GP0CL81 117 aa13.23□□□□□ -0.29
CLN8-211ENST00000636934 GAGE12IP0CL82 117 aa13.23□□□□□ -0.29
CLN8-211ENST00000636934 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
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CLN8-211ENST00000636934 CFC1P0CG37 223 aa13.15□□□□□ -0.3
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CLN8-211ENST00000636934 MUSTN1Q8IVN3 82 aa13.14□□□□□ -0.31
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CLN8-211ENST00000636934 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa13.14□□□□□ -0.31
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CLN8-211ENST00000636934 LITAFQ99732 161 aa13.11□□□□□ -0.31
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CLN8-211ENST00000636934 SCGB1C2P0DMR2 95 aa13.05□□□□□ -0.32
CLN8-211ENST00000636934 COPS9Q8WXC6 57 aa13.05□□□□□ -0.32
CLN8-211ENST00000636934 SMIM1B2RUZ4 78 aa13.04□□□□□ -0.32
CLN8-211ENST00000636934 J3QR89 54 aa13.04□□□□□ -0.32
CLN8-211ENST00000636934 WFDC2Q14508 124 aa13.04□□□□□ -0.32
CLN8-211ENST00000636934 PRO0461Q9UI25 63 aa13.04□□□□□ -0.32
CLN8-211ENST00000636934 GAGE6Q13070 117 aa13.04□□□□□ -0.32
CLN8-211ENST00000636934 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa13.04□□□□□ -0.32
CLN8-211ENST00000636934 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.04□□□□□ -0.32
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