RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514654.5

ATP2C1-222, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, human

TSL 1 (best)

Gene ATP2C1, Length 4,730 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2C1-222	ENST00000514654	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654		A8MZ25	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	KLLN	B2CW77	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	NRAC	Q8N912	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	PTH2	Q96A98	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654		U3KQK5	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	F8	P00451	2351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	NDUFA1	O15239	70 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	CRYGD	P07320	174 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654		A0A0J9YXY3	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	UBL5	Q9BZL1	73 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	LINC00310	P59036	64 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	LECT2	O14960	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	REG3A	Q06141	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	COL4A2	P08572	1712 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	CRYBA4	P53673	196 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ATP2C1-222	ENST00000514654	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.53	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TSHB	P01222	138 aa		4.53	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TIRAP	P58753	221 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654		H0YGX0	51 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	MIA	Q16674	131 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	RBX1	P62877	108 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	AGRN	O00468	2067 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TCL1B	O95988	128 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	MIF	P14174	115 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	BPTF	Q12830	3046 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRANK1	O15050	2925 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	NDUFA7	O95182	113 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	CXCL5	P42830	114 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRIO	O75962	3097 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	ATR	Q13535	2644 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	MGA	Q8IWI9	3026 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	RETN	Q9HD89	108 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	TRAC	P01848	142 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	FOXI1	Q12951	378 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	MAST4	O15021	2626 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATP2C1-222	ENST00000514654	SLPI	P03973	132 aa		4.47	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms