RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C SEC3P33332 1336 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YPT1P01123 206 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C SRP68P38687 599 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C SNO3P43544 222 aa2.26□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C HRD3Q05787 833 aa2.26□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C NGL1Q08213 363 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YPR027CQ12079 277 aa2.26□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C PRS5Q12265 496 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C DGR2P32330 852 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C CDC5P32562 705 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C TFC4P33339 1025 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C MEP2P41948 499 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C IRC8P47046 822 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C PEX14P53112 341 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C IDP3P53982 420 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C SKY1Q03656 742 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C CWH43P25618 953 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C PLC1P32383 869 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C DSS4P32601 143 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YJL043WP47053 257 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C RNR4P49723 345 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C SPC105P53148 917 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C ERG13P54839 491 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C WAR1Q03631 944 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C VPS5Q92331 675 aa2.25□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YEL076C-AP0CX16 216 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YLR464WP0CX17 216 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YER190C-BP0CX94 160 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YEL077W-AP0CX95 160 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YGR296C-BP0CX96 160 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YPL283W-BP0CX97 160 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YPR204C-AP0CX98 160 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C COX11P19516 300 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C MAK32P23060 363 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C GRX7P38068 203 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C SPC97P38863 823 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YEL076CP39971 216 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C RAD26P40352 1085 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C MNT2P53059 558 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C SLD3P53135 668 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C Q0010Q9ZZX9 128 aa2.24□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C KAR1P11927 433 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C CBP3P21560 335 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C HEM12P32347 362 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C ASK1P35734 292 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C SDH8P38345 138 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C MNT3P40549 630 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C PEX8P53248 589 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C CET1O13297 549 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C MRPL9P31334 269 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C EMP65P40085 556 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C PCI8P40512 444 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C SQS1P53866 767 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C MTD1Q02046 320 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C SND1Q04007 877 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C RAD33Q04231 177 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C PHM6Q05637 104 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C CYK3Q07533 885 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YOR378WQ08902 515 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C DIN7Q12086 430 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C CRC1Q12289 327 aa2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YPK1P12688 680 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C ARG1P22768 420 aa2.22□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C PEA2P40091 420 aa2.22□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C MAD2P40958 196 aa2.22□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YNL034WP53963 612 aa2.22□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C PEX15Q08215 383 aa2.22□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C CRT10Q08226 957 aa2.22□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C MPD2Q99316 277 aa2.22□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C CHO2P05374 869 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C YMR085WP0CF18 432 aa2.21□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C PCK1P10963 549 aa2.21□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C URE2P23202 354 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C VPS8P39702 1274 aa2.21□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C CFD1P40558 293 aa2.21□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C COS12P53053 380 aa2.21□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C TGL2P54857 326 aa2.21□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.05
HDA3YPR179C AMD2P22580 549 aa2.21□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C GDA1P32621 518 aa2.21□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C PXL1P36166 706 aa2.21□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C EAF5P39995 279 aa2.21□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YJR008WP47085 338 aa2.21□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C SCW4P53334 386 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C HOL1P53389 586 aa2.21□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YNR071CP53757 342 aa2.21□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C LCB4Q12246 624 aa2.21□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C AHA1Q12449 350 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C PNO1Q99216 274 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YPR089WO13585 888 aa2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C URA3P03962 267 aa2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C SEC12P11655 471 aa2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C KGD2P19262 463 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YAP1P19880 650 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C BET2P20133 325 aa2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YCP4P25349 247 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
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