RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A CAR1P00812 333 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A MRP2P10663 115 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A SPE2P21182 396 aa0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A FMP46P36141 133 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A EXO84P38261 753 aa0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A MAM1P40065 302 aa0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A COP1P53622 1201 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A TIM50Q02776 476 aa0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A ATP25Q03153 612 aa0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A PFA4Q12006 378 aa0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A LYS21Q12122 440 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YMR085WP0CF18 432 aa0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RPS7AP26786 190 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A MSN2P33748 704 aa0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RRP14P36080 434 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data0.68□□□□□ -2.3not detected
YPL060C-AYPL060C-A YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RSC9Q03124 581 aa0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A EFR3Q03653 782 aaKnown RBP0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A GSC2P40989 1895 aa0.68□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A SIR3P06701 978 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A SFL1P20134 766 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A TIM23P32897 222 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A SDS22P36047 338 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RSM22P36056 628 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A TAF5P38129 798 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A KTR3P38130 404 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A GET2P40056 285 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A PSP1P50896 841 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A PHO2P07269 559 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A FTH1P38310 465 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A WWM1P43582 211 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A ZDS2P54786 942 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YBR182C-AQ8TGU6 64 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A HBS1P32769 611 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A DUT1P33317 147 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A NDT80P38830 627 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A VPS27P40343 622 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A ADD37Q03233 198 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YDR109CQ04585 715 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YLR352WQ06479 807 aa0.67□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A REV3P14284 1504 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A TUF1P02992 437 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YCR006CP25350 157 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RKM3P38222 552 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A MIP6P38760 659 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A MKT1P40850 830 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A APJ1P53940 528 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A MOT3P54785 490 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A SLU7Q02775 382 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A THI22Q06490 572 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A THI3Q07471 609 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A KOG1P38873 1557 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A XRN1P22147 1528 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A ERR1P0CX10 437 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A ERR2P0CX11 437 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A PPZ1P26570 692 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A CDC15P27636 974 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YFL015CP43578 164 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RTA1P53047 317 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YGR054WP53235 642 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A ERG5P54781 538 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A UBP16Q02863 499 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A ATG21Q02887 496 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A ARA2Q04212 335 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A PLM2Q04383 521 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A POS5Q06892 414 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A GSH2Q08220 491 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A THI21Q08975 551 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A PPT2Q12036 173 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RMP1Q12530 201 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A MDS3P53094 1487 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A DEG1P31115 442 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A AKL1P38080 1108 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A KHA1P40309 873 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A ZAP1P47043 880 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A ECI1Q05871 280 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RDL1Q12305 139 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YRF1-1P0CX20 1796 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YRF1-5P0CX21 1796 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A YRF1-8P0CX22 1796 aa0.66□□□□□ -2.3
YPL060C-AYPL060C-A RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A PDE1P22434 369 aa0.65□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A RFC1P38630 861 aaKnown RBP0.65□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A VFA1P40080 203 aa0.65□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A ASG1P40467 964 aa0.65□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A BAP3P41815 604 aa0.65□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YKE2P52553 114 aa0.65□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A CRF1Q04930 467 aa0.65□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YDR338CQ05497 695 aa0.65□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A HNM1P19807 563 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A CNE1P27825 502 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A STE5P32917 917 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YIL161WP40449 235 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A NSE5Q03718 556 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A VPS64Q03944 604 aa0.64□□□□□ -2.31
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