RNA–Protein interactions for RNA: YOR032C

HMS1, Transcript of bHLH protein with similarity to myc-family transcription factors, yeast

Gene HMS1, Length 1,305 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS1	YOR032C	SET3	P36124	751 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS1	YOR032C	MRPL7	P36519	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS1	YOR032C	STB5	P38699	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS1	YOR032C	NPR3	P38742	1146 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS1	YOR032C	PCL5	P38794	229 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS1	YOR032C	ARG2	P40360	574 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS1	YOR032C	NDC80	P40460	691 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS1	YOR032C	IDS2	P46958	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS1	YOR032C	COS12	P53053	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS1	YOR032C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS1	YOR032C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HMS1	YOR032C	SSP2	Q08646	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HMS1	YOR032C	MTF2	P10849	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	BET2	P20133	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	RER1	P25560	188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	NMA2	P53204	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	MFM1	Q02783	413 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	UFO1	Q04511	668 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	OPY2	Q06810	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	ACF2	Q12168	779 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	RKI1	Q12189	258 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	VPS34	P22543	875 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	RRN3	P36070	627 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	YBR138C	P38277	524 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	IMA1	P53051	589 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	HOF1	Q05080	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	BIK1	P11709	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
HMS1	YOR032C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	SWC3	P31376	625 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	GMH1	P36125	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	GLG1	P36143	616 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	UME6	P39001	836 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	TIM44	Q01852	431 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	AIM6	Q07716	390 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	ICL2	Q12031	575 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	SLC1	P33333	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	SNF12	P53628	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	TGS1	Q12052	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	RAD16	P31244	790 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	MCM10	P32354	571 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	BST1	P43571	1029 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	SAP4	P53036	818 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	YIP4	P53093	235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	SPC98	P53540	846 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	MUK1	Q02866	612 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	USA1	Q03714	838 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	CNE1	P27825	502 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	LOT5	P34234	306 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	CCL1	P37366	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	SDH8	P38345	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	PIH1	P38768	344 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	LAM4	P38800	1345 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	CTF18	P49956	741 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	STB4	P50104	949 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	BUD17	P53727	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HMS1	YOR032C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	PET122	P10355	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	IFA38	P38286	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	UBS1	P38290	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	SKP2	P42843	763 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	BNA1	P47096	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	TRS23	Q03784	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	VID22	Q05934	901 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	SUL2	Q12325	893 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	TPK1	P06244	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	STE4	P18851	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	YCR061W	P25639	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	CHS3	P29465	1165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	NUP120	P35729	1037 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	LNP1	P38878	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	YJL206C	P39529	758 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	BDH2	P39713	417 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HMS1	YOR032C	PMT6	P42934	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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