RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	TGL1	P34163	548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	YAP3	P38749	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	SDS3	P40505	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	MAD2	P40958	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	HOS1	Q12214	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	HAP1	P0CE41	1502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	ELF1	P36053	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	TAF5	P38129	798 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	RIM4	P38741	713 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	YNR071C	P53757	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	MAK10	Q02197	733 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	DIN7	Q12086	430 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	URA3	P03962	267 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	ARG1	P22768	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	GLG1	P36143	616 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	APL3	P38065	1025 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	PPE1	P38796	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	NMA2	P53204	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	RKI1	Q12189	258 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	ARP7	Q12406	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MTD1	YKR080W	SEC12	P11655	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	CBP3	P21560	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	UBS1	P38290	277 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	YJL206C	P39529	758 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	BDH2	P39713	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	LRO1	P40345	661 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	HIS6	P40545	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	UBA2	P52488	636 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	GND2	P53319	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	DIP5	P53388	608 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	UFO1	Q04511	668 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	TMN2	Q04562	672 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	ADH4	P10127	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	GMH1	P36125	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	MRPL7	P36519	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	YJL193W	P39542	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	SWD1	P39706	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	QRI7	P43122	407 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	UBX4	P54730	416 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	TRI1	Q05024	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	PCK1	P10963	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	CDC43	P18898	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	VPS33	P20795	691 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	KIN3	P22209	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	MTH1	P35198	433 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	IMA5	P40884	581 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	SNF12	P53628	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	TEP1	P53916	434 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	MFM1	Q02783	413 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	ARR3	Q06598	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	TAF3	Q12297	353 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	LAM4	P38800	1345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	MSS18	P08593	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	DMC1	P25453	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	YHL041W	P38730	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	YLF2	P38746	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	THI6	P41835	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	SPC98	P53540	846 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	PIF1	P07271	859 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	DSS4	P32601	143 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	PMT6	P42934	759 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	GSM1	P42950	618 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	MAD3	P47074	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	TRS23	Q03784	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	HIM1	Q06674	414 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	IRC10	Q08118	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	SRB8	P25648	1427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	PHO81	P17442	1178 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	STE4	P18851	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	MSH1	P25846	959 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MTD1	YKR080W	APM3	P38153	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22 ms