RNA–Protein interactions for RNA: YHR217C

YHR217C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YHR217C, Length 462 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHR217C	YHR217C	HNM1	P19807	563 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	HOP1	P20050	605 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	MCD4	P36051	919 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	FDC1	Q03034	503 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	0.55	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	ARA2	Q04212	335 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	PPT2	Q12036	173 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	PIN2	Q12057	282 aa		0.55	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	AAC1	P04710	309 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	MIH1	P23748	554 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	YJR061W	P40355	935 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	MAL11	P53048	616 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	IZH1	Q03419	316 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	USA1	Q03714	838 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	RAD33	Q04231	177 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	DAP1	Q12091	152 aa		0.54	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	EFM2	P38347	419 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	ASG1	P40467	964 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	YJL107C	P42947	387 aa		0.53	□□□□□ -2.32
YHR217C	YHR217C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	MNN4	P36044	1178 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	YGL242C	P53066	181 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	YMR254C	Q04838	102 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	DIN7	Q12086	430 aa		0.52	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	PCK1	P10963	549 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	0.51	□□□□□ -2.33	not detected
YHR217C	YHR217C	ERV46	P39727	415 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	YEL025C	P39991	1188 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	CIR1	P42940	261 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	COG8	Q04632	607 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	RTC1	Q08281	1341 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	YLR112W	Q12130	139 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	OSH2	Q12451	1283 aa		0.51	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	MSN2	P33748	704 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	MTC2	P34246	357 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	ESBP6	P53918	673 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	ACS1	Q01574	713 aa		0.5	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	YEL045C	P32616	141 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	GDA1	P32621	518 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	NUG1	P40010	520 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	FTR1	P40088	404 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	VPS25	P47142	202 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	TAF8	Q03750	510 aa		0.49	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	CIT2	P08679	460 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	MSH1	P25846	959 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	RAD24	P32641	659 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	BET3	P36149	193 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	BUD8	P41698	603 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	PXA1	P41909	870 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	ATG27	P46989	271 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	ARP9	Q05123	467 aa		0.48	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	GAL11	P19659	1081 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	IME1	P21190	360 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	YJR039W	P47107	1121 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	NHX1	Q04121	633 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	RAD34	Q06665	692 aa		0.47	□□□□□ -2.33
YHR217C	YHR217C	BAR1	P12630	587 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	PPG1	P32838	368 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	RIM2	P38127	377 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	ORC5	P50874	479 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	YNL092W	P53934	400 aa		0.46	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	0.46	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	CIT1	P00890	479 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	PRE4	P30657	266 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	0.45	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.45	□□□□□ -2.34	not detected
YHR217C	YHR217C	CDS1	P38221	457 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	ARN1	P38731	627 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	HLR1	Q04429	423 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	ARR3	Q06598	404 aa		0.45	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	RAD4	P14736	754 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	SFP1	P32432	683 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	ASF1	P32447	279 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	TRS65	P32893	560 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	TIS11	P47977	285 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	YML020W	Q03722	664 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		0.44	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	YKU70	P32807	602 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	EHT1	P38295	451 aa		0.43	□□□□□ -2.34
YHR217C	YHR217C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.5 ms