RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W MND2P40577 368 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W MAF1P41910 395 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YJR079WP47126 109 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W VPS25P47142 202 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W INA17Q02888 182 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W ARA2Q04212 335 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W FRA1Q07825 749 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YLL056CQ12177 298 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W GPM3Q12326 303 aa9.18□□□□□ -0.94
DDI1YER143W IMA3P0CW40 589 aa9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W IMA4P0CW41 589 aa9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W MAS1P10507 462 aa9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YIH1P25637 258 aa9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W MSH1P25846 959 aa9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W TSA1P34760 196 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W MAC1P35192 417 aa9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YBR225WP38321 900 aa9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W CCT2P39076 527 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W PRM9P39551 298 aa9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W USA1Q03714 838 aa9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W AAD4Q07747 329 aa9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W IMA2Q08295 589 aa9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W ARP7Q12406 477 aa9.17□□□□□ -0.94
DDI1YER143W POL3P15436 1097 aa9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W URK1P27515 501 aa9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W DAL1P32375 460 aa9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W RGD1P38339 666 aa9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W MSR1P38714 643 aa9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W VTC4P47075 721 aa9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W URB2P47108 1174 aa9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W BFA1P47113 574 aa9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W CPR6P53691 371 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W SHR3Q02774 210 aa9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W PMT7Q06644 662 aa9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YDL073WQ07454 984 aa9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W SEY1Q99287 776 aa9.16□□□□□ -0.94
DDI1YER143W CMD1P06787 147 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W MET16P18408 261 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W TSR4P25040 408 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W CDC20P26309 610 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W RAD16P31244 790 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W PPE1P38796 400 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W LAM1P38851 1228 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W CKB2P38930 258 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W MMF1P40185 145 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W ALA1P40825 983 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W SAE2P46946 345 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W SNG1P46950 547 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W TAH11P47112 604 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YPR003CP53394 754 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YNL034WP53963 612 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YNL018CP53976 612 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W HEH2Q03281 663 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W GCN5Q03330 439 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W YMR027WQ04371 470 aa9.15□□□□□ -0.94
DDI1YER143W ILV6P25605 309 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ISF1P32488 338 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W RPC37P36121 282 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ECM13P38195 257 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W BIT2P38346 545 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W SAF1P38352 637 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W EDC3P39998 551 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W SCC4P40090 624 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ATM1P40416 690 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W MNN11P46985 422 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W YGR127WP53275 312 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W VPS9P54787 451 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W PIR3Q03180 325 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W GRX8Q05926 109 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W NDJ1Q12366 352 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W AHC1Q12433 566 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W YEL077CQ3E7X8 1277 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa9.14□□□□□ -0.95
DDI1YER143W QCR6P00127 147 aa9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W ILV2P07342 687 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W SPE1P08432 466 aa9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W PEX1P24004 1043 aa9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W OAF3P36023 863 aa9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W STL1P39932 569 aa9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W KTR7P40504 517 aa9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W COG6P53959 839 aa9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W RNT1Q02555 471 aa9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W YMR160WQ03823 816 aa9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W BSP1Q06604 576 aa9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data9.13□□□□□ -0.95not detected
DDI1YER143W MNL2Q12205 849 aa9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W RUD3Q12234 484 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-DR4O74302 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-AP0CX57 440 aa9.12□□□□□ -0.95
DDI1YER143W TY1A-PR1P0CX58 440 aa9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.9 ms