RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W CAD1P24813 409 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SSA4YER103W YBR285WP38354 144 aa13.01□□□□□ -0.33
SSA4YER103W PHO89P38361 574 aa13.01□□□□□ -0.33
SSA4YER103W INP51P40559 946 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SSA4YER103W YML108WQ03759 105 aa13.01□□□□□ -0.33
SSA4YER103W GGA1Q06336 557 aa13.01□□□□□ -0.33
SSA4YER103W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SSA4YER103W SLY1P22213 666 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data13□□□□□ -0.33not detected
SSA4YER103W CNM67P53865 581 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W THI7Q05998 598 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W KAP95Q06142 861 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W PCL8Q08966 492 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W PTP2P29461 750 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W TMT1P32643 299 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W BCS1P32839 456 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W PIK1P39104 1066 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W SEO1P39709 593 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W FLC2P39719 783 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W RTA1P53047 317 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W TAM41P53230 385 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W YNL115CP53925 644 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W SWP1Q02795 286 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W COA4Q05809 96 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W THI20Q08224 551 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W SGO1Q08490 590 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W GLE1Q12315 538 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W AVL9Q12500 764 aa13□□□□□ -0.33
SSA4YER103W PAB1P04147 577 aaKnown RBP RIP-Chip data12.99□□□□□ -0.33not detected
SSA4YER103W IMA3P0CW40 589 aa12.99□□□□□ -0.33
SSA4YER103W IMA4P0CW41 589 aa12.99□□□□□ -0.33
SSA4YER103W MAE1P36013 669 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SSA4YER103W TBS1P38114 1094 aa12.99□□□□□ -0.33
SSA4YER103W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SSA4YER103W SET4P42948 560 aa12.99□□□□□ -0.33
SSA4YER103W TRF5P48561 642 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SSA4YER103W TBF1Q02457 562 aa12.99□□□□□ -0.33
SSA4YER103W YMR209CQ03648 457 aa12.99□□□□□ -0.33
SSA4YER103W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SSA4YER103W IMA2Q08295 589 aa12.99□□□□□ -0.33
SSA4YER103W TCP1P12612 559 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W EST1P17214 699 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W TRX1P22217 103 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W HSP78P33416 811 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W MDJ1P35191 511 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W SHU2P38957 223 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W SHC1P39000 512 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W AVT6P40074 448 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W RRN7P40992 514 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W TAH11P47112 604 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W ARP9Q05123 467 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W SAM3Q08986 587 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W EMP46Q12396 444 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W STE2D6VTK4 431 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W REP1P03871 373 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W CDC42P19073 191 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W RME1P32338 300 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W UGP1P32861 499 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W CYM1P32898 989 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W UBP11P36026 717 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W CBR1P38626 284 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W YHR112CP38716 378 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W SSZ1P38788 538 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W YJR054WP47114 497 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W PSY3Q12318 242 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W BBP1Q12365 385 aa12.98□□□□□ -0.33
SSA4YER103W GPA2P10823 449 aa12.97□□□□□ -0.33
SSA4YER103W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data12.97□□□□□ -0.33not detected
SSA4YER103W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
SSA4YER103W HBS1P32769 611 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
SSA4YER103W UGA4P32837 571 aa12.97□□□□□ -0.33
SSA4YER103W FIS1P40515 155 aa12.97□□□□□ -0.33
SSA4YER103W FIN1Q03898 291 aa12.97□□□□□ -0.33
SSA4YER103W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SSA4YER103W CUE5Q08412 411 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
SSA4YER103W APC9Q12107 265 aa12.97□□□□□ -0.33
SSA4YER103W MF(ALPHA)1P01149 165 aa12.96□□□□□ -0.33
SSA4YER103W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
SSA4YER103W CCT7P42943 550 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
SSA4YER103W HSH155P49955 971 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
SSA4YER103W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
SSA4YER103W PSP1P50896 841 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
SSA4YER103W PUS2P53167 370 aa12.96□□□□□ -0.33
SSA4YER103W GET1P53192 235 aa12.96□□□□□ -0.33
SSA4YER103W ORC3P54790 616 aa12.96□□□□□ -0.33
SSA4YER103W APM4Q99186 491 aa12.96□□□□□ -0.33
SSA4YER103W AI5_ALPHAQ9ZZX1 630 aa12.96□□□□□ -0.33
SSA4YER103W CLN1P20437 546 aa12.96□□□□□ -0.34
SSA4YER103W SIT4P20604 311 aa12.96□□□□□ -0.34
SSA4YER103W GDA1P32621 518 aa12.96□□□□□ -0.34
SSA4YER103W STV1P37296 890 aa12.96□□□□□ -0.34
SSA4YER103W YBR139WP38109 508 aa12.96□□□□□ -0.34
SSA4YER103W FAA2P39518 744 aa12.96□□□□□ -0.34
SSA4YER103W MSS2P40990 351 aa12.96□□□□□ -0.34
SSA4YER103W LEM3P42838 414 aa12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.3 ms