RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557130.1

UBE2CP1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP1, Length 554 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP1-201ENST00000557130 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 DDB1Q16531 1140 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 KRT40Q6A162 431 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAGEB6Q8N7X4 407 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 LY9Q9HBG7 655 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF652Q9Y2D9 606 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC12A7Q9Y666 1083 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 NWD2Q9ULI1 1742 aa8.91□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 NUP98P52948 1817 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCDC69A6NI79 296 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 IKBKBO14920 756 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 TUBB4AP04350 444 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 CRKLP46109 303 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 FOSBP53539 338 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SIK1P57059 783 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 RASGRF1Q13972 1273 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 UBE4AQ14139 1066 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 PTPAQ15257 358 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 BARGINQ6ZT62 677 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 LRRC8AQ8IWT6 810 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIF12Q96FN5 646 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 HPSEQ9Y251 543 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.9□□□□□ -0.98
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYH7P12883 1935 aa8.9□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 ERICH2A1L162 156 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIF28PB7ZC32 967 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAP3K13O43283 966 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 MBD4O95243 580 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 NTSR2O95665 410 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 CDC27P30260 824 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 SYKP43405 635 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 NT5C2P49902 561 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 SYCP1Q15431 976 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 RESP18Q5W5W9 173 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 VPS37DQ86XT2 251 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAP3K14Q99558 947 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 LRP2BPQ9P2M1 347 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 STK24Q9Y6E0 443 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYH3P11055 1940 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYH15Q9Y2K3 1946 aa8.89□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 SEMA3EO15041 775 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 DEXIO95424 95 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 FGRP09769 529 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 PFKFB1P16118 471 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 KCNJ6P48051 423 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 BCAMP50895 628 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 CHRNDQ07001 517 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 WTAPQ15007 396 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 KANK3Q6NY19 840 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 IFNL1Q8IU54 200 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 FANCBQ8NB91 859 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 ARMT1Q9H993 441 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 DENND2AQ9ULE3 1009 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF804BA4D1E1 1349 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms