RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-214ENST00000530727 PDZD3Q86UT5 571 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-214ENST00000530727 STK35Q8TDR2 534 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-214ENST00000530727 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-214ENST00000530727 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-214ENST00000530727 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-214ENST00000530727 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-214ENST00000530727 GOLGA3Q08378 1498 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-214ENST00000530727 SLFN14P0C7P3 912 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRC-214ENST00000530727 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-214ENST00000530727 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.17□□□□□ -1.42
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PTPRC-214ENST00000530727 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-214ENST00000530727 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
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PTPRC-214ENST00000530727 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-214ENST00000530727 MRS2Q9HD23 443 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-214ENST00000530727 BMP6P22004 513 aa6.15□□□□□ -1.43
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PTPRC-214ENST00000530727 CRIM1Q9NZV1 1036 aa6.15□□□□□ -1.43
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 MAP7Q14244 749 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRC-214ENST00000530727 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.13□□□□□ -1.43
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PTPRC-214ENST00000530727 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.13□□□□□ -1.43
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PTPRC-214ENST00000530727 RASIP1Q5U651 963 aa6.12□□□□□ -1.43
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PTPRC-214ENST00000530727 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 LGR6Q9HBX8 967 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 WDR64B1ANS9 1081 aa6.11□□□□□ -1.43
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 Q8N3U1 123 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 GIPC2Q8TF65 315 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 DISC1Q9NRI5 854 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 ATG3Q9NT62 314 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 CEP162Q5TB80 1403 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRC-214ENST00000530727 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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