RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463423.5

CTPS1-204, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 457 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-204ENST00000463423 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 CNTNAP1P78357 1384 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 ATRNL1Q5VV63 1379 aa7.32□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 ATAD5Q96QE3 1844 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 TBC1D12O60347 775 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 CHMLP26374 656 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 ALX1Q15699 326 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 SULF1Q8IWU6 871 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 RUFY2Q8WXA3 655 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 HOOK2Q96ED9 719 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 GGA3Q9NZ52 723 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 TMOD2Q9NZR1 351 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa7.31□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 LAMA4Q16363 1823 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 GSG1L2A8MUP6 293 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 CHGBP05060 677 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 RGS3P49796 1198 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 FKBP1BP68106 108 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 NFIAQ12857 509 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 RASA3Q14644 834 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 MAP3K11Q16584 847 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 SBK1Q52WX2 424 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 KRT26Q7Z3Y9 468 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 USP48Q86UV5 1035 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 TEX11Q8IYF3 940 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 AIDAQ96BJ3 306 aa7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 ZMYM6O95789 1325 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 RAD50Q92878 1312 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 PHIPQ8WWQ0 1821 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 CLRN2A0PK11 232 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 M0R2C6 588 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 SGSM2O43147 1006 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 GPAA1O43292 621 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 CST9Q5W186 159 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 SKAP1Q86WV1 359 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 LCORLQ8N3X6 602 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 FAM227BQ96M60 508 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 EHD4Q9H223 541 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 ARMT1Q9H993 441 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 PI4KBQ9UBF8 816 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 ZNF112Q9UJU3 913 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 OTOFQ9HC10 1997 aa7.29□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 FLT1P17948 1338 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 A0A0D9SFI3 127 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 FOXP2O15409 715 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 MBD4O95243 580 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 NF2P35240 595 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 USP5P45974 858 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 CACNB3P54284 484 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 C12orf60Q5U649 245 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 TTC6Q86TZ1 520 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 IFNL3Q8IZI9 196 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 CDCA5Q96FF9 252 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 TMEM39BQ9GZU3 492 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 VEZTQ9HBM0 779 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 PTPRFP10586 1907 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 DOCK1Q14185 1865 aa7.28□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 CCDC171Q6TFL3 1326 aa7.27□□□□□ -1.24
CTPS1-204ENST00000463423 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-204ENST00000463423 ADM5C9JUS6 153 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-204ENST00000463423 PRKAB2O43741 272 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-204ENST00000463423 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-204ENST00000463423 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-204ENST00000463423 CDC45O75419 566 aa7.27□□□□□ -1.25
CTPS1-204ENST00000463423 FGAP02671 866 aa7.27□□□□□ -1.25
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