RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420964.1

FAAP20-208, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 314 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-208ENST00000420964 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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FAAP20-208ENST00000420964 SPDYE6P0CI01 402 aa14.64□□□□□ -0.07
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FAAP20-208ENST00000420964 MMP14P50281 582 aa14.64□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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FAAP20-208ENST00000420964 USP17L21D6R901 530 aa14.63□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 PICALMQ13492 652 aa14.63□□□□□ -0.07
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FAAP20-208ENST00000420964 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 ST18O60284 1047 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 CYP2D6P10635 497 aa14.62□□□□□ -0.07
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FAAP20-208ENST00000420964 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 NEK1Q96PY6 1258 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 NEDD4P46934 1319 aa14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 CPA1P15085 419 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 CACNB3P54284 484 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 NFIAQ12857 509 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.61□□□□□ -0.07
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FAAP20-208ENST00000420964 IL27Q8NEV9 243 aa14.61□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.61□□□□□ -0.07
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FAAP20-208ENST00000420964 SMIM22K7EJ46 135 aa14.6□□□□□ -0.07
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FAAP20-208ENST00000420964 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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FAAP20-208ENST00000420964 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 C12orf60Q5U649 245 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 HSCBQ8IWL3 235 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 NCOA7Q8NI08 942 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 SNX21Q969T3 373 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.6□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.6□□□□□ -0.07
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FAAP20-208ENST00000420964 SIPA1L1O43166 1804 aa14.59□□□□□ -0.07
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FAAP20-208ENST00000420964 MYO1BO43795 1136 aa14.59□□□□□ -0.07
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FAAP20-208ENST00000420964 APLP1P51693 650 aa14.59□□□□□ -0.07
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FAAP20-208ENST00000420964 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.59□□□□□ -0.07
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FAAP20-208ENST00000420964 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 TTC14Q96N46 770 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.59□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 MYH8P13535 1937 aa14.58□□□□□ -0.07
FAAP20-208ENST00000420964 WNT10BO00744 389 aa14.58□□□□□ -0.08
FAAP20-208ENST00000420964 ENTPD3O75355 529 aa14.58□□□□□ -0.08
FAAP20-208ENST00000420964 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
FAAP20-208ENST00000420964 EGFRP00533 1210 aa14.58□□□□□ -0.08
FAAP20-208ENST00000420964 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
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