RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251968.3

TSG101-201, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSG101, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101-201ENST00000251968 MRIQ9BWK5 157 aa22.79■■□□□ 1.24
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TSG101-201ENST00000251968 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TSG101-201ENST00000251968 CHST3Q7LGC8 479 aa22.78■■□□□ 1.24
TSG101-201ENST00000251968 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.78■■□□□ 1.24
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TSG101-201ENST00000251968 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.76■■□□□ 1.23
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TSG101-201ENST00000251968 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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TSG101-201ENST00000251968 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.75■■□□□ 1.23
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TSG101-201ENST00000251968 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.236e-6■□□□□ 10.9
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TSG101-201ENST00000251968 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TSG101-201ENST00000251968 TOMM22Q9NS69 142 aa22.74■■□□□ 1.23
TSG101-201ENST00000251968 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TSG101-201ENST00000251968 ANTXR2P58335 489 aa22.73■■□□□ 1.23
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TSG101-201ENST00000251968 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.73■■□□□ 1.23
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TSG101-201ENST00000251968 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
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TSG101-201ENST00000251968 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.69■■□□□ 1.22
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TSG101-201ENST00000251968 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.68■■□□□ 1.22
TSG101-201ENST00000251968 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TSG101-201ENST00000251968 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.68■■□□□ 1.22
TSG101-201ENST00000251968 SHTN1A0MZ66 631 aa22.68■■□□□ 1.22
TSG101-201ENST00000251968 SPDYE2BA6NHP3 402 aa22.68■■□□□ 1.22
TSG101-201ENST00000251968 SPDYE6P0CI01 402 aa22.68■■□□□ 1.22
TSG101-201ENST00000251968 APOBRQ0VD83 1088 aa22.68■■□□□ 1.22
TSG101-201ENST00000251968 DLGAP5Q15398 846 aa22.68■■□□□ 1.22
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TSG101-201ENST00000251968 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.67■■□□□ 1.22
TSG101-201ENST00000251968 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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