RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P YRF1-5P0CX21 1796 aa4.19□□□□□ -1.74
tW(CCA)PtW(CCA)P YRF1-8P0CX22 1796 aa4.19□□□□□ -1.74
tW(CCA)PtW(CCA)P STH1P32597 1359 aa4.18□□□□□ -1.74
tW(CCA)PtW(CCA)P VTH1P40438 1549 aa4.18□□□□□ -1.74
tW(CCA)PtW(CCA)P VTH2P40890 1549 aa4.18□□□□□ -1.74
tW(CCA)PtW(CCA)P YTA7P40340 1379 aa4.17□□□□□ -1.74
tW(CCA)PtW(CCA)P MYO4P32492 1471 aa4.16□□□□□ -1.74
tW(CCA)PtW(CCA)P SNT2P53127 1403 aa4.15□□□□□ -1.74
tW(CCA)PtW(CCA)P TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P TY1B-ER2Q03619 1755 aa4.14□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P TY1B-MR1Q04214 1755 aa4.14□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P TY1B-NL1Q12112 1755 aa4.14□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P TY1B-GR1Q12141 1755 aa4.14□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P TY1B-BLQ12490 1755 aa4.14□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P NUP157P40064 1391 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P NUP170P38181 1502 aa4.12□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P NTE1Q04958 1679 aa4.12□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P CKB1P43639 278 aa4.11□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P RPO21P04050 1733 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P TAF7Q05021 590 aa4.09□□□□□ -1.75
tW(CCA)PtW(CCA)P SPO14P36126 1683 aa4.08□□□□□ -1.76
tW(CCA)PtW(CCA)P ULS1Q08562 1619 aa4.08□□□□□ -1.76
tW(CCA)PtW(CCA)P IQG1Q12280 1495 aa4.08□□□□□ -1.76
tW(CCA)PtW(CCA)P DNF2Q12675 1612 aa4.07□□□□□ -1.76
tW(CCA)PtW(CCA)P PDR10P51533 1564 aa4.07□□□□□ -1.76
tW(CCA)PtW(CCA)P IRC20Q06554 1556 aa4.07□□□□□ -1.76
tW(CCA)PtW(CCA)P YAP3P38749 330 aa4.06□□□□□ -1.76
tW(CCA)PtW(CCA)P PDR12Q02785 1511 aa4.05□□□□□ -1.76
tW(CCA)PtW(CCA)P DOP1Q03921 1698 aa4.04□□□□□ -1.76
tW(CCA)PtW(CCA)P MAK10Q02197 733 aa4.03□□□□□ -1.76
tW(CCA)PtW(CCA)P PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
tW(CCA)PtW(CCA)P GDB1Q06625 1536 aa4.03□□□□□ -1.76
tW(CCA)PtW(CCA)P TRM3Q07527 1436 aa4.02□□□□□ -1.77
tW(CCA)PtW(CCA)P URN1Q06525 465 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
tW(CCA)PtW(CCA)P BUD3P25558 1636 aa4.01□□□□□ -1.77
tW(CCA)PtW(CCA)P BNR1P40450 1375 aa4.01□□□□□ -1.77
tW(CCA)PtW(CCA)P GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR093CQ12275 1648 aa3.99□□□□□ -1.77
tW(CCA)PtW(CCA)P MLP2P40457 1679 aa3.98□□□□□ -1.77
tW(CCA)PtW(CCA)P TYS1P36421 394 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
tW(CCA)PtW(CCA)P BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
tW(CCA)PtW(CCA)P ARO1P08566 1588 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
tW(CCA)PtW(CCA)P YSP2Q06681 1438 aa3.97□□□□□ -1.77
tW(CCA)PtW(CCA)P IPL1P38991 367 aa3.96□□□□□ -1.78
tW(CCA)PtW(CCA)P THI12P42883 340 aa3.96□□□□□ -1.78
tW(CCA)PtW(CCA)P THI5P43534 340 aa3.96□□□□□ -1.78
tW(CCA)PtW(CCA)P THI11P47183 340 aa3.96□□□□□ -1.78
tW(CCA)PtW(CCA)P THI13Q07748 340 aa3.96□□□□□ -1.78
tW(CCA)PtW(CCA)P CAT8P39113 1433 aa3.95□□□□□ -1.78
tW(CCA)PtW(CCA)P TY3B-GQ99315 1547 aa3.92□□□□□ -1.78
tW(CCA)PtW(CCA)P DNF3Q12674 1656 aa3.91□□□□□ -1.78
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR196WQ04336 1088 aa3.91□□□□□ -1.78
tW(CCA)PtW(CCA)P SRB8P25648 1427 aa3.9□□□□□ -1.78
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC7P11075 2009 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
tW(CCA)PtW(CCA)P CHC1P22137 1653 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
tW(CCA)PtW(CCA)P APP1P53933 587 aa3.88□□□□□ -1.79
tW(CCA)PtW(CCA)P YBT1P32386 1661 aa3.87□□□□□ -1.79
tW(CCA)PtW(CCA)P MRX12P47084 519 aa3.87□□□□□ -1.79
tW(CCA)PtW(CCA)P RIA1P53893 1110 aa3.87□□□□□ -1.79
tW(CCA)PtW(CCA)P PDR5P33302 1511 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
tW(CCA)PtW(CCA)P GLN1P32288 370 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
tW(CCA)PtW(CCA)P KRE5P22023 1365 aa3.84□□□□□ -1.79
tW(CCA)PtW(CCA)P USO1P25386 1790 aa3.83□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P VMR1P38735 1592 aa3.82□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P YIL055CP40523 627 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P CAB1Q04430 367 aa3.82□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P YAH1Q12184 172 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P SSM4P40318 1319 aa3.81□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P YNR029CP53729 429 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P ENT1Q12518 454 aa3.81□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P PTP3P40048 928 aa3.8□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P IML1P47170 1584 aa3.8□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P PDR11P40550 1411 aa3.79□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P PAF1P38351 445 aa3.79□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P NUP188P52593 1655 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P REB1P21538 810 aa3.78□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P ALD4P46367 519 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P ENV9Q08651 330 aa3.78□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P HAP1P0CE41 1502 aa3.78□□□□□ -1.8
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD9P14737 1309 aa3.77□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P PRI1P10363 409 aa3.77□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P BFR2Q06631 534 aaKnown RBP3.76□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P PRP45P28004 379 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P TAF5P38129 798 aa3.75□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P LEU3P08638 886 aa3.74□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P NOP7P53261 605 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR074CQ04773 145 aa3.74□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P IMH1Q06704 911 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P RCM1P53972 490 aa3.73□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P TAF8Q03750 510 aa3.73□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P ORC1P54784 914 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
tW(CCA)PtW(CCA)P NAP1P25293 417 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
tW(CCA)PtW(CCA)P RTC1Q08281 1341 aa3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.8 ms