RNA–Protein interactions for RNA: YKL036C

YKL036C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL036C, Length 393 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL036CYKL036C YRF1-8P0CX22 1796 aa29.76■■■□□ 2.35
YKL036CYKL036C YTA7P40340 1379 aa29.73■■■□□ 2.35
YKL036CYKL036C BNI1P41832 1953 aa29.69■■■□□ 2.34
YKL036CYKL036C MYO4P32492 1471 aa29.68■■■□□ 2.34
YKL036CYKL036C RPO21P04050 1733 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
YKL036CYKL036C VPS15P22219 1454 aa29.61■■■□□ 2.33
YKL036CYKL036C ITT1Q04638 464 aa29.54■■■□□ 2.32
YKL036CYKL036C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
YKL036CYKL036C DRS2P39524 1355 aa29.39■■■□□ 2.29
YKL036CYKL036C STH1P32597 1359 aa29.36■■■□□ 2.29
YKL036CYKL036C SNT2P53127 1403 aa29.33■■■□□ 2.29
YKL036CYKL036C MMS1Q06211 1407 aa29.28■■■□□ 2.28
YKL036CYKL036C MIF2P35201 549 aa29.27■■■□□ 2.28
YKL036CYKL036C MET10P39692 1035 aa29.15■■■□□ 2.26
YKL036CYKL036C RTT106P40161 455 aa29.11■■■□□ 2.25
YKL036CYKL036C NUP170P38181 1502 aa29.1■■■□□ 2.25
YKL036CYKL036C MLP2P40457 1679 aa29.08■■■□□ 2.25
YKL036CYKL036C ABP1P15891 592 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
YKL036CYKL036C SPO14P36126 1683 aa29.05■■■□□ 2.24
YKL036CYKL036C ULS1Q08562 1619 aa29.05■■■□□ 2.24
YKL036CYKL036C PDR12Q02785 1511 aa29■■■□□ 2.23
YKL036CYKL036C PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
YKL036CYKL036C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
YKL036CYKL036C GDB1Q06625 1536 aa28.84■■■□□ 2.21
YKL036CYKL036C DNF2Q12675 1612 aa28.82■■■□□ 2.2
YKL036CYKL036C IRC20Q06554 1556 aa28.81■■■□□ 2.2
YKL036CYKL036C TAF7Q05021 590 aa28.76■■■□□ 2.19
YKL036CYKL036C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
YKL036CYKL036C IQG1Q12280 1495 aa28.74■■■□□ 2.19
YKL036CYKL036C DOP1Q03921 1698 aa28.68■■■□□ 2.18
YKL036CYKL036C TRM3Q07527 1436 aa28.64■■■□□ 2.18
YKL036CYKL036C PDR10P51533 1564 aa28.63■■■□□ 2.17
YKL036CYKL036C BUD3P25558 1636 aa28.61■■■□□ 2.17
YKL036CYKL036C IFH1P39520 1085 aa28.54■■■□□ 2.16
YKL036CYKL036C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
YKL036CYKL036C CAT8P39113 1433 aa28.35■■■□□ 2.13
YKL036CYKL036C YFR006WP43590 535 aa28.31■■■□□ 2.12
YKL036CYKL036C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
YKL036CYKL036C YBT1P32386 1661 aa28.26■■■□□ 2.12
YKL036CYKL036C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
YKL036CYKL036C TY3B-GQ99315 1547 aa28.24■■■□□ 2.11
YKL036CYKL036C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
YKL036CYKL036C YOR093CQ12275 1648 aa28.1■■■□□ 2.09
YKL036CYKL036C CKB1P43639 278 aa28.04■■■□□ 2.08
YKL036CYKL036C YSP2Q06681 1438 aa28■■■□□ 2.07
YKL036CYKL036C BNR1P40450 1375 aa27.93■■■□□ 2.06
YKL036CYKL036C DNF3Q12674 1656 aa27.85■■■□□ 2.05
YKL036CYKL036C YAP3P38749 330 aa27.75■■■□□ 2.03
YKL036CYKL036C SRB8P25648 1427 aa27.7■■■□□ 2.03
YKL036CYKL036C URN1Q06525 465 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
YKL036CYKL036C BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
YKL036CYKL036C MAK10Q02197 733 aa27.42■■□□□ 1.98
YKL036CYKL036C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
YKL036CYKL036C IPL1P38991 367 aa27.24■■□□□ 1.95
YKL036CYKL036C IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
YKL036CYKL036C USO1P25386 1790 aa27.19■■□□□ 1.94
YKL036CYKL036C HAP1P0CE41 1502 aa27.16■■□□□ 1.94
YKL036CYKL036C IML1P47170 1584 aa27.15■■□□□ 1.94
YKL036CYKL036C VMR1P38735 1592 aa27.12■■□□□ 1.93
YKL036CYKL036C TYS1P36421 394 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
YKL036CYKL036C SSM4P40318 1319 aa26.94■■□□□ 1.9
YKL036CYKL036C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
YKL036CYKL036C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
YKL036CYKL036C YMR196WQ04336 1088 aa26.86■■□□□ 1.89
YKL036CYKL036C GCN2P15442 1659 aa26.81■■□□□ 1.88
YKL036CYKL036C THI12P42883 340 aa26.74■■□□□ 1.87
YKL036CYKL036C THI5P43534 340 aa26.74■■□□□ 1.87
YKL036CYKL036C THI11P47183 340 aa26.74■■□□□ 1.87
YKL036CYKL036C THI13Q07748 340 aa26.74■■□□□ 1.87
YKL036CYKL036C PDR11P40550 1411 aa26.65■■□□□ 1.86
YKL036CYKL036C KRE5P22023 1365 aa26.41■■□□□ 1.82
YKL036CYKL036C PAF1P38351 445 aa26.4■■□□□ 1.82
YKL036CYKL036C MRX12P47084 519 aa26.4■■□□□ 1.82
YKL036CYKL036C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
YKL036CYKL036C RAV1P47104 1357 aa26.35■■□□□ 1.81
YKL036CYKL036C RIA1P53893 1110 aa26.35■■□□□ 1.81
YKL036CYKL036C BCK1Q01389 1478 aa26.32■■□□□ 1.8
YKL036CYKL036C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
YKL036CYKL036C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
YKL036CYKL036C NUP192P47054 1683 aa26.19■■□□□ 1.78
YKL036CYKL036C RTC1Q08281 1341 aa26.17■■□□□ 1.78
YKL036CYKL036C CAB1Q04430 367 aa26.12■■□□□ 1.77
YKL036CYKL036C ALD4P46367 519 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
YKL036CYKL036C NOP7P53261 605 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
YKL036CYKL036C RAD9P14737 1309 aa26.1■■□□□ 1.77
YKL036CYKL036C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
YKL036CYKL036C PTP3P40048 928 aa26.03■■□□□ 1.76
YKL036CYKL036C APP1P53933 587 aa25.9■■□□□ 1.74
YKL036CYKL036C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
YKL036CYKL036C NAP1P25293 417 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
YKL036CYKL036C ESL2P36168 1195 aa25.77■■□□□ 1.72
YKL036CYKL036C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
YKL036CYKL036C REB1P21538 810 aa25.72■■□□□ 1.71
YKL036CYKL036C GLN1P32288 370 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
YKL036CYKL036C TAF5P38129 798 aa25.71■■□□□ 1.71
YKL036CYKL036C TAF8Q03750 510 aa25.71■■□□□ 1.71
YKL036CYKL036C ENT1Q12518 454 aa25.65■■□□□ 1.7
YKL036CYKL036C CPS1P27614 576 aa25.59■■□□□ 1.69
YKL036CYKL036C RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
YKL036CYKL036C RCM1P53972 490 aa25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.9 ms