RNA–Protein interactions for RNA: YFR032C

RRT5, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene RRT5, Length 870 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT5YFR032C TY1B-ER2Q03619 1755 aa17.58■□□□□ 0.4
RRT5YFR032C TY1B-MR1Q04214 1755 aa17.58■□□□□ 0.4
RRT5YFR032C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
RRT5YFR032C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
RRT5YFR032C TY1B-NL1Q12112 1755 aa17.58■□□□□ 0.4
RRT5YFR032C TY1B-GR1Q12141 1755 aa17.58■□□□□ 0.4
RRT5YFR032C TY1B-BLQ12490 1755 aa17.58■□□□□ 0.4
RRT5YFR032C NTE1Q04958 1679 aa17.56■□□□□ 0.4
RRT5YFR032C MYO4P32492 1471 aa17.5■□□□□ 0.39
RRT5YFR032C RPO21P04050 1733 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
RRT5YFR032C YTA7P40340 1379 aa17.4■□□□□ 0.38
RRT5YFR032C SNT2P53127 1403 aa17.38■□□□□ 0.37
RRT5YFR032C YFR006WP43590 535 aa17.34■□□□□ 0.37
RRT5YFR032C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
RRT5YFR032C MET10P39692 1035 aa17.32■□□□□ 0.36
RRT5YFR032C STH1P32597 1359 aa17.31■□□□□ 0.36
RRT5YFR032C IRC20Q06554 1556 aa17.3■□□□□ 0.36
RRT5YFR032C NUP170P38181 1502 aa17.28■□□□□ 0.36
RRT5YFR032C DNF2Q12675 1612 aa17.23■□□□□ 0.35
RRT5YFR032C RTT106P40161 455 aa17.21■□□□□ 0.35
RRT5YFR032C ULS1Q08562 1619 aa17.17■□□□□ 0.34
RRT5YFR032C SPO14P36126 1683 aa17.16■□□□□ 0.34
RRT5YFR032C PDR12Q02785 1511 aa17.15■□□□□ 0.34
RRT5YFR032C TRM3Q07527 1436 aa17.06■□□□□ 0.32
RRT5YFR032C IQG1Q12280 1495 aa17.04■□□□□ 0.32
RRT5YFR032C MLP2P40457 1679 aa17.03■□□□□ 0.32
RRT5YFR032C GDB1Q06625 1536 aa17.01■□□□□ 0.31
RRT5YFR032C DOP1Q03921 1698 aa16.99■□□□□ 0.31
RRT5YFR032C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
RRT5YFR032C PDR10P51533 1564 aa16.98■□□□□ 0.31
RRT5YFR032C BUD3P25558 1636 aa16.96■□□□□ 0.3
RRT5YFR032C YOR093CQ12275 1648 aa16.87■□□□□ 0.29
RRT5YFR032C PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
RRT5YFR032C TAF7Q05021 590 aa16.85■□□□□ 0.29
RRT5YFR032C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
RRT5YFR032C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
RRT5YFR032C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RRT5YFR032C IFH1P39520 1085 aa16.66■□□□□ 0.26
RRT5YFR032C CAT8P39113 1433 aa16.65■□□□□ 0.26
RRT5YFR032C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RRT5YFR032C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
RRT5YFR032C YAP3P38749 330 aa16.56■□□□□ 0.24
RRT5YFR032C DNF3Q12674 1656 aa16.56■□□□□ 0.24
RRT5YFR032C BNR1P40450 1375 aa16.49■□□□□ 0.23
RRT5YFR032C CKB1P43639 278 aa16.48■□□□□ 0.23
RRT5YFR032C YSP2Q06681 1438 aa16.47■□□□□ 0.23
RRT5YFR032C YBT1P32386 1661 aa16.45■□□□□ 0.22
RRT5YFR032C TY3B-GQ99315 1547 aa16.44■□□□□ 0.22
RRT5YFR032C URN1Q06525 465 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
RRT5YFR032C MAK10Q02197 733 aa16.39■□□□□ 0.21
RRT5YFR032C SRB8P25648 1427 aa16.21■□□□□ 0.19
RRT5YFR032C IPL1P38991 367 aa16.13■□□□□ 0.17
RRT5YFR032C HAP1P0CE41 1502 aa16.13■□□□□ 0.17
RRT5YFR032C USO1P25386 1790 aa16.1■□□□□ 0.17
RRT5YFR032C YMR196WQ04336 1088 aa16.09■□□□□ 0.17
RRT5YFR032C BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RRT5YFR032C IML1P47170 1584 aa16.01■□□□□ 0.15
RRT5YFR032C TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RRT5YFR032C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
RRT5YFR032C THI12P42883 340 aa15.97■□□□□ 0.15
RRT5YFR032C THI5P43534 340 aa15.97■□□□□ 0.15
RRT5YFR032C THI11P47183 340 aa15.97■□□□□ 0.15
RRT5YFR032C THI13Q07748 340 aa15.97■□□□□ 0.15
RRT5YFR032C TYS1P36421 394 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
RRT5YFR032C VMR1P38735 1592 aa15.94■□□□□ 0.14
RRT5YFR032C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
RRT5YFR032C IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
RRT5YFR032C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
RRT5YFR032C MRX12P47084 519 aa15.6■□□□□ 0.09
RRT5YFR032C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RRT5YFR032C RIA1P53893 1110 aa15.57■□□□□ 0.08
RRT5YFR032C KRE5P22023 1365 aa15.57■□□□□ 0.08
RRT5YFR032C PDR11P40550 1411 aa15.57■□□□□ 0.08
RRT5YFR032C GLN1P32288 370 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
RRT5YFR032C PTP3P40048 928 aa15.55■□□□□ 0.08
RRT5YFR032C SSM4P40318 1319 aa15.53■□□□□ 0.08
RRT5YFR032C GCN2P15442 1659 aa15.52■□□□□ 0.08
RRT5YFR032C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
RRT5YFR032C APP1P53933 587 aa15.51■□□□□ 0.07
RRT5YFR032C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
RRT5YFR032C BCK1Q01389 1478 aa15.46■□□□□ 0.07
RRT5YFR032C PAF1P38351 445 aa15.42■□□□□ 0.06
RRT5YFR032C RAV1P47104 1357 aa15.4■□□□□ 0.06
RRT5YFR032C CAB1Q04430 367 aa15.35■□□□□ 0.05
RRT5YFR032C REB1P21538 810 aa15.33■□□□□ 0.04
RRT5YFR032C ALD4P46367 519 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
RRT5YFR032C NUP192P47054 1683 aa15.32■□□□□ 0.04
RRT5YFR032C RAD9P14737 1309 aa15.29■□□□□ 0.04
RRT5YFR032C YMR074CQ04773 145 aa15.29■□□□□ 0.04
RRT5YFR032C ENT1Q12518 454 aa15.29■□□□□ 0.04
RRT5YFR032C RTC1Q08281 1341 aa15.28■□□□□ 0.04
RRT5YFR032C PRI1P10363 409 aa15.28■□□□□ 0.04
RRT5YFR032C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
RRT5YFR032C ENV9Q08651 330 aa15.24■□□□□ 0.03
RRT5YFR032C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
RRT5YFR032C NAP1P25293 417 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RRT5YFR032C IMH1Q06704 911 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
RRT5YFR032C NOP7P53261 605 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
RRT5YFR032C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
RRT5YFR032C TAF5P38129 798 aa15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14 ms