RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C MRM1P25270 412 aa9.03□□□□□ -0.96
SHO1YER118C BRN1P38170 754 aa9.02□□□□□ -0.97
SHO1YER118C ATG32P40458 529 aa9.02□□□□□ -0.97
SHO1YER118C YJL007CP47080 104 aa9.02□□□□□ -0.97
SHO1YER118C HEM3P28789 327 aa9.01□□□□□ -0.97
SHO1YER118C YGL015CP33199 130 aa9.01□□□□□ -0.97
SHO1YER118C CDC3P32457 520 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SHO1YER118C SSF1P38789 453 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SHO1YER118C SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SHO1YER118C SSA2P10592 639 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SHO1YER118C COQ8P27697 501 aa8.99□□□□□ -0.97
SHO1YER118C RTG3P38165 486 aa8.99□□□□□ -0.97
SHO1YER118C YRB30P53107 440 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SHO1YER118C RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SHO1YER118C COX6P00427 148 aa8.97□□□□□ -0.97
SHO1YER118C DCD1P06773 312 aa8.96□□□□□ -0.98
SHO1YER118C DOS2P54858 310 aa8.96□□□□□ -0.98
SHO1YER118C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SHO1YER118C CPS1P27614 576 aa8.95□□□□□ -0.98
SHO1YER118C RPL34BP40525 121 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SHO1YER118C SPC42P36094 363 aa8.93□□□□□ -0.98
SHO1YER118C OCA5P38738 679 aa8.92□□□□□ -0.98
SHO1YER118C FAR11P53917 953 aa8.92□□□□□ -0.98
SHO1YER118C ERG12P07277 443 aa8.91□□□□□ -0.98
SHO1YER118C TIF1P10081 395 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
SHO1YER118C CSN12P47130 423 aa8.91□□□□□ -0.98
SHO1YER118C NOB1Q08444 459 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
SHO1YER118C TTI1P36097 1038 aa8.9□□□□□ -0.98
SHO1YER118C BCH2P36122 765 aa8.86□□□□□ -0.99
SHO1YER118C NUG1P40010 520 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
SHO1YER118C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
SHO1YER118C YPR204WQ08995 1032 aa8.86□□□□□ -0.99
SHO1YER118C ATG36P46983 293 aa8.85□□□□□ -0.99
SHO1YER118C ITT1Q04638 464 aa8.85□□□□□ -0.99
SHO1YER118C HAT1Q12341 374 aa8.85□□□□□ -0.99
SHO1YER118C ASF1P32447 279 aa8.84□□□□□ -0.99
SHO1YER118C UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
SHO1YER118C FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
SHO1YER118C LAM6Q08001 693 aa8.83□□□□□ -1
SHO1YER118C EPS1P40557 701 aa8.82□□□□□ -1
SHO1YER118C RTS3P53289 263 aa8.81□□□□□ -1
SHO1YER118C RTG2P32608 588 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
SHO1YER118C BIO2P32451 375 aa8.79□□□□□ -1
SHO1YER118C SWE1P32944 819 aa8.79□□□□□ -1
SHO1YER118C EDS1P38073 919 aa8.79□□□□□ -1
SHO1YER118C MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
SHO1YER118C YBL036CP38197 257 aa8.79□□□□□ -1
SHO1YER118C VPS29P38759 282 aa8.79□□□□□ -1
SHO1YER118C YML083CQ04526 418 aa8.79□□□□□ -1
SHO1YER118C MIF2P35201 549 aa8.78□□□□□ -1
SHO1YER118C ALD4P46367 519 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
SHO1YER118C YAF9P53930 226 aa8.78□□□□□ -1
SHO1YER118C PUP1P25043 261 aa8.76□□□□□ -1.01
SHO1YER118C KTR1P27810 393 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SHO1YER118C NMD2P38798 1089 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SHO1YER118C IPL1P38991 367 aa8.76□□□□□ -1.01
SHO1YER118C STM1P39015 273 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SHO1YER118C NNF1P47149 201 aa8.76□□□□□ -1.01
SHO1YER118C SUB1P54000 292 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SHO1YER118C KEX1P09620 729 aa8.74□□□□□ -1.01
SHO1YER118C ALD2P47771 506 aa8.74□□□□□ -1.01
SHO1YER118C YDR090CQ03193 310 aa8.74□□□□□ -1.01
SHO1YER118C SEC20P28791 383 aa8.73□□□□□ -1.01
SHO1YER118C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
SHO1YER118C YJR008WP47085 338 aa8.73□□□□□ -1.01
SHO1YER118C BDF1P35817 686 aa8.72□□□□□ -1.01
SHO1YER118C SCY1P53009 804 aa8.71□□□□□ -1.02
SHO1YER118C YNL108CP53929 270 aa8.7□□□□□ -1.02
SHO1YER118C SIS2P36024 562 aa8.69□□□□□ -1.02
SHO1YER118C CST6P40535 587 aa8.69□□□□□ -1.02
SHO1YER118C VPS72Q03388 795 aa8.69□□□□□ -1.02
SHO1YER118C RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SHO1YER118C VHR2P40041 505 aa8.68□□□□□ -1.02
SHO1YER118C SVF1Q05515 481 aa8.68□□□□□ -1.02
SHO1YER118C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SHO1YER118C CSE4P36012 229 aa8.66□□□□□ -1.02
SHO1YER118C YBL113CQ7M4S9 792 aa8.66□□□□□ -1.02
SHO1YER118C SUP45P12385 437 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SHO1YER118C OSW7P43611 510 aa8.65□□□□□ -1.02
SHO1YER118C PTC3P34221 468 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SHO1YER118C TEA1P47988 759 aa8.64□□□□□ -1.03
SHO1YER118C MSC6Q08818 692 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SHO1YER118C ENO1P00924 437 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SHO1YER118C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.63□□□□□ -1.03not detected
SHO1YER118C TGL4P36165 910 aa8.62□□□□□ -1.03
SHO1YER118C STS1P38637 319 aa8.62□□□□□ -1.03
SHO1YER118C RNH70P53331 553 aa8.62□□□□□ -1.03
SHO1YER118C UBX5Q06682 500 aa8.62□□□□□ -1.03
SHO1YER118C KIC1P38692 1080 aa8.61□□□□□ -1.03
SHO1YER118C ERP5P38819 212 aa8.61□□□□□ -1.03
SHO1YER118C POL32P47110 350 aa8.61□□□□□ -1.03
SHO1YER118C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SHO1YER118C ATE1P16639 503 aa8.6□□□□□ -1.03
SHO1YER118C MRX10Q05648 414 aa8.6□□□□□ -1.03
SHO1YER118C RAD59Q12223 238 aa8.6□□□□□ -1.03
SHO1YER118C YOL098CQ12496 1037 aa8.6□□□□□ -1.03
SHO1YER118C ENO2P00925 437 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SHO1YER118C SLX5P32828 619 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SHO1YER118C MAK16P10962 306 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SHO1YER118C TOM20P35180 183 aa8.57□□□□□ -1.04
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