RNA–Protein interactions for RNA: YDR093W

DNF2, Transcript of Aminophospholipid translocase (flippase), yeastyeast

Gene DNF2, Length 4,839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF2YDR093W LEO1P38439 464 aa6.18□□□□□ -1.42
DNF2YDR093W TAF5P38129 798 aa6.18□□□□□ -1.42
DNF2YDR093W EAF7P53911 425 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
DNF2YDR093W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
DNF2YDR093W CDC25P04821 1589 aa6.15□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W AIM44Q99299 758 aa6.13□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W ESL2P36168 1195 aa6.13□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W SVF1Q05515 481 aa6.13□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W DRS2P39524 1355 aa6.12□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data6.1□□□□□ -1.43not detected
DNF2YDR093W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W POL1P13382 1468 aa6.1□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W TY1B-ER2Q03619 1755 aa6.09□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W TY1B-MR1Q04214 1755 aa6.09□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W TY1B-NL1Q12112 1755 aa6.09□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W TY1B-GR1Q12141 1755 aa6.09□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W TY1B-BLQ12490 1755 aa6.09□□□□□ -1.43
DNF2YDR093W SUP35P05453 685 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W KAR2P16474 682 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W MIF2P35201 549 aa6.08□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W MET5P47169 1442 aa6.07□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W RKR1Q04781 1562 aa6.07□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W STU1P38198 1513 aa6.07□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W BNR1P40450 1375 aa6.06□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W ENP2P48234 707 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W UFD4P33202 1483 aa6.05□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W RIA1P53893 1110 aa6.05□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W PKH1Q03407 766 aa6.04□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W RRT14P40470 206 aa6.04□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W NTE1Q04958 1679 aa6.03□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W UBP1P25037 809 aa6.03□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W COG8Q04632 607 aa6.03□□□□□ -1.44
DNF2YDR093W YOR1P53049 1477 aa6.02□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W KIP3P53086 805 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W CHD1P32657 1468 aa6.02□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W DNF1P32660 1571 aa6.01□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W TPM1P17536 199 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W YRF1-1P0CX20 1796 aa6□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W YRF1-5P0CX21 1796 aa6□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W YRF1-8P0CX22 1796 aa6□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W JIP3O13555 125 aa5.99□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W PRP40P33203 583 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W RAD2P07276 1031 aa5.99□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W CSE4P36012 229 aa5.99□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W YMR196WQ04336 1088 aa5.99□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W CLB5P30283 435 aa5.98□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W YAP3P38749 330 aa5.98□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W PDI1P17967 522 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W NOP2P40991 618 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W PDS5Q04264 1277 aa5.97□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W LAM6Q08001 693 aa5.96□□□□□ -1.45
DNF2YDR093W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W MYO4P32492 1471 aa5.96□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W BNI1P41832 1953 aa5.96□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W TAF8Q03750 510 aa5.96□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W MLP2P40457 1679 aa5.95□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W SPP41P38904 1435 aa5.95□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W SPE2P21182 396 aa5.95□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W MMS1Q06211 1407 aa5.95□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W YGL081WP53156 320 aa5.95□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W MEC3Q02574 474 aa5.95□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W RRP8P38961 392 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W NCB2Q92317 146 aa5.94□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W BDP1P46678 594 aa5.94□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W ATG13Q06628 738 aa5.93□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W LTE1P07866 1435 aa5.93□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W MMS22Q06164 1454 aa5.93□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W YBR287WP38355 427 aa5.92□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W ARP5P53946 755 aa5.91□□□□□ -1.46
DNF2YDR093W ESC2Q06340 456 aa5.9□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W NSE3Q05541 303 aa5.89□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W NUP159P40477 1460 aa5.89□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W SPO14P36126 1683 aa5.89□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W HUL5P53119 910 aa5.89□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W HPC2Q01448 625 aa5.89□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W ESF1Q06344 628 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W SRB8P25648 1427 aa5.89□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W SNT2P53127 1403 aa5.89□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W PDR12Q02785 1511 aa5.88□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W DPS1P04802 557 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data5.88□□□□□ -1.47not detected
DNF2YDR093W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W VTH1P40438 1549 aa5.88□□□□□ -1.47
DNF2YDR093W VTH2P40890 1549 aa5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15 ms