RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636481.1

CHRNA4-215, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, human

TSL 5

Gene CHRNA4, Length 126 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHRNA4-215	ENST00000636481	DIP2B	Q9P265	1576 aa		5.22	□□□□□ -1.57
CHRNA4-215	ENST00000636481	HSPA2	P54652	639 aa		5.21	□□□□□ -1.58
CHRNA4-215	ENST00000636481	GRIN2A	Q12879	1464 aa		5.2	□□□□□ -1.58
CHRNA4-215	ENST00000636481	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CHRNA4-215	ENST00000636481	MAPKBP1	O60336	1514 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHRNA4-215	ENST00000636481	NUP160	Q12769	1436 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHRNA4-215	ENST00000636481	TSPOAP1	O95153	1857 aa		5.19	□□□□□ -1.58
CHRNA4-215	ENST00000636481	WDR97	A6NE52	1622 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CHRNA4-215	ENST00000636481	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
CHRNA4-215	ENST00000636481	TOP2B	Q02880	1626 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CHRNA4-215	ENST00000636481	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CHRNA4-215	ENST00000636481	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CHRNA4-215	ENST00000636481	PRDM2	Q13029	1718 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CHRNA4-215	ENST00000636481	PTPRG	P23470	1445 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	ASXL2	Q76L83	1435 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	CUX1	P39880	1505 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	PTPRM	P28827	1452 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	KCNH8	Q96L42	1107 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	SHROOM2	Q13796	1616 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	PBRM1	Q86U86	1689 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	ADAMTS12	P58397	1594 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	ABCC2	Q92887	1545 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	5.09	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CHRNA4-215	ENST00000636481	GLI2	P10070	1586 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	RAPGEF3	O95398	923 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	MLEC	Q14165	292 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	CD109	Q6YHK3	1445 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	UACA	Q9BZF9	1416 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	KIF21B	O75037	1637 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	ARID3C	A6NKF2	412 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	HSPA1L	P34931	641 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	PIP4K2B	P78356	416 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CHRNA4-215	ENST00000636481	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	MADD	Q8WXG6	1647 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		5	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		5	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	CUL7	Q14999	1698 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	IGF1R	P08069	1367 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	PTPRT	O14522	1441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CHRNA4-215	ENST00000636481	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	TOM1	O60784	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	AKNA	Q7Z591	1439 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	FANCA	O15360	1455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	DISP1	Q96F81	1524 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	POTEA	Q6S8J7	498 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	P3H3	Q8IVL6	736 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	NEO1	Q92859	1461 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CHRNA4-215	ENST00000636481	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CHRNA4-215	ENST00000636481	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHRNA4-215	ENST00000636481	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHRNA4-215	ENST00000636481	PKD2	Q13563	968 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-215	ENST00000636481	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-215	ENST00000636481	STRC	Q7RTU9	1775 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHRNA4-215	ENST00000636481	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-215	ENST00000636481	NCOA1	Q15788	1441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHRNA4-215	ENST00000636481	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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