RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629304.1

PCBP1-AS1-342, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 397 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CEP162Q5TB80 1403 aa11.52□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CUX2O14529 1486 aa11.51□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.5□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa11.49□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 IGF1RP08069 1367 aa11.47□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.44□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.44□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CAPN15O75808 1086 aa11.44□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CLIP1P30622 1438 aa11.43□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.42□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa11.41□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 WDR97A6NE52 1622 aa11.39□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 PCGF6Q9BYE7 350 aa11.38□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CUL7Q14999 1698 aa11.38□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 WDR62O43379 1518 aa11.37□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.36□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.35□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 FKBP8Q14318 412 aa11.35□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.35□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 ERCC6Q03468 1493 aa11.34□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 IFT140Q96RY7 1462 aa11.34□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 POLA2Q14181 598 aa11.29□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 GRIN2BQ13224 1484 aa11.27□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 ARAP1Q96P48 1450 aa11.27□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa11.26□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.25□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 ABCB7O75027 752 aa11.22□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 FBLN2P98095 1184 aa11.22□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 PBRM1Q86U86 1689 aa11.22□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 ADAMTS12P58397 1594 aa11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 MAP3K1Q13233 1512 aa11.19□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 HRCP23327 699 aa11.19□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 FMN1Q68DA7 1419 aa11.15□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.13□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 SAMD9Q5K651 1589 aa11.13□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.12□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.12□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 DSG3P32926 999 aa11.12□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 SYNJ2O15056 1496 aa11.12□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 IQGAP2Q13576 1575 aa11.11□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.11□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 GRIN2AQ12879 1464 aa11.11□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 FHOD3Q2V2M9 1422 aa11.1□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.09□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.09□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 TIAM1Q13009 1591 aa11.08□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.05□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 NUP160Q12769 1436 aa11.05□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 P3H3Q8IVL6 736 aa11.05□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.05□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.01□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CEP170Q5SW79 1584 aa10.99□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.99□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa10.99□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 DISP1Q96F81 1524 aa10.99□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 KIAA0556O60303 1618 aa10.98□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 HECW1Q76N89 1606 aa10.98□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 MTUS2Q5JR59 1369 aa10.96□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.96□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 JPH4Q96JJ6 628 aa10.95□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.94□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.92□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 OSCARQ8IYS5 282 aa10.9□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa10.89□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 FBXO3Q9UK99 471 aa10.89□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 ARHGEF11O15085 1522 aa10.89□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 NCOA2Q15596 1464 aa10.88□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-342ENST00000629304 FGD6Q6ZV73 1430 aa10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms