RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623297.1

CU639417.6-201, humanhuman

TSL 2

Gene CU639417.6, Length 3,013 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU639417.6-201ENST00000623297 IGF1RP08069 1367 aa21.77■■□□□ 1.07
CU639417.6-201ENST00000623297 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
CU639417.6-201ENST00000623297 WDR62O43379 1518 aa21.71■■□□□ 1.07
CU639417.6-201ENST00000623297 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CU639417.6-201ENST00000623297 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CU639417.6-201ENST00000623297 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.68■■□□□ 1.06
CU639417.6-201ENST00000623297 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.67■■□□□ 1.06
CU639417.6-201ENST00000623297 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CU639417.6-201ENST00000623297 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CU639417.6-201ENST00000623297 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CU639417.6-201ENST00000623297 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.63■■□□□ 1.05
CU639417.6-201ENST00000623297 BCANQ96GW7 911 aa21.6■■□□□ 1.05
CU639417.6-201ENST00000623297 KCNH8Q96L42 1107 aa21.59■■□□□ 1.05
CU639417.6-201ENST00000623297 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.59■■□□□ 1.05
CU639417.6-201ENST00000623297 CUL7Q14999 1698 aa21.59■■□□□ 1.05
CU639417.6-201ENST00000623297 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
CU639417.6-201ENST00000623297 IFT140Q96RY7 1462 aa21.56■■□□□ 1.04
CU639417.6-201ENST00000623297 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.54■■□□□ 1.04
CU639417.6-201ENST00000623297 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CU639417.6-201ENST00000623297 PBRM1Q86U86 1689 aa21.53■■□□□ 1.04
CU639417.6-201ENST00000623297 P3H3Q8IVL6 736 aa21.52■■□□□ 1.04
CU639417.6-201ENST00000623297 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CU639417.6-201ENST00000623297 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
CU639417.6-201ENST00000623297 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CU639417.6-201ENST00000623297 GRIN2BQ13224 1484 aa21.43■■□□□ 1.02
CU639417.6-201ENST00000623297 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.43■■□□□ 1.02
CU639417.6-201ENST00000623297 ARAP1Q96P48 1450 aa21.42■■□□□ 1.02
CU639417.6-201ENST00000623297 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.41■■□□□ 1.02
CU639417.6-201ENST00000623297 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.4■■□□□ 1.02
CU639417.6-201ENST00000623297 ADAMTS12P58397 1594 aa21.4■■□□□ 1.02
CU639417.6-201ENST00000623297 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
CU639417.6-201ENST00000623297 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.36■■□□□ 1.01
CU639417.6-201ENST00000623297 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.36■■□□□ 1.01
CU639417.6-201ENST00000623297 FKBP8Q14318 412 aa21.36■■□□□ 1.01
CU639417.6-201ENST00000623297 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.35■■□□□ 1.01
CU639417.6-201ENST00000623297 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.3■■□□□ 1
CU639417.6-201ENST00000623297 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CU639417.6-201ENST00000623297 BCL11AQ9H165 835 aa21.25■□□□□ 0.99
CU639417.6-201ENST00000623297 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.23■□□□□ 0.99
CU639417.6-201ENST00000623297 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CU639417.6-201ENST00000623297 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.22■□□□□ 0.99
CU639417.6-201ENST00000623297 TRIM52Q96A61 297 aa21.21■□□□□ 0.99
CU639417.6-201ENST00000623297 GRIN2AQ12879 1464 aa21.2■□□□□ 0.98
CU639417.6-201ENST00000623297 FBLN2P98095 1184 aa21.18■□□□□ 0.98
CU639417.6-201ENST00000623297 IQGAP2Q13576 1575 aa21.18■□□□□ 0.98
CU639417.6-201ENST00000623297 SYNJ2O15056 1496 aa21.17■□□□□ 0.98
CU639417.6-201ENST00000623297 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.16■□□□□ 0.98
CU639417.6-201ENST00000623297 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CU639417.6-201ENST00000623297 SAMD9Q5K651 1589 aa21.15■□□□□ 0.98
CU639417.6-201ENST00000623297 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CU639417.6-201ENST00000623297 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CU639417.6-201ENST00000623297 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.11■□□□□ 0.97
CU639417.6-201ENST00000623297 NEFLP07196 543 aa21.09■□□□□ 0.97
CU639417.6-201ENST00000623297 CEP170Q5SW79 1584 aa21.09■□□□□ 0.97
CU639417.6-201ENST00000623297 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.07■□□□□ 0.96
CU639417.6-201ENST00000623297 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
CU639417.6-201ENST00000623297 FMN1Q68DA7 1419 aa21.04■□□□□ 0.96
CU639417.6-201ENST00000623297 ARID3CA6NKF2 412 aa21.04■□□□□ 0.96
CU639417.6-201ENST00000623297 TIAM1Q13009 1591 aa21.03■□□□□ 0.96
CU639417.6-201ENST00000623297 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.02■□□□□ 0.96
CU639417.6-201ENST00000623297 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.02■□□□□ 0.96
CU639417.6-201ENST00000623297 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.01■□□□□ 0.95
CU639417.6-201ENST00000623297 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
CU639417.6-201ENST00000623297 NUP160Q12769 1436 aa21■□□□□ 0.95
CU639417.6-201ENST00000623297 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
CU639417.6-201ENST00000623297 CHD1O14646 1710 aa20.99■□□□□ 0.95
CU639417.6-201ENST00000623297 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.98■□□□□ 0.95
CU639417.6-201ENST00000623297 MAPKBP1O60336 1514 aa20.98■□□□□ 0.95
CU639417.6-201ENST00000623297 KIAA0556O60303 1618 aa20.97■□□□□ 0.95
CU639417.6-201ENST00000623297 DISP1Q96F81 1524 aa20.96■□□□□ 0.95
CU639417.6-201ENST00000623297 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CU639417.6-201ENST00000623297 MAP3K1Q13233 1512 aa20.95■□□□□ 0.94
CU639417.6-201ENST00000623297 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.94■□□□□ 0.94
CU639417.6-201ENST00000623297 MSH5O43196 834 aa20.94■□□□□ 0.94
CU639417.6-201ENST00000623297 ANP32CO43423 234 aa20.93■□□□□ 0.94
CU639417.6-201ENST00000623297 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.92■□□□□ 0.94
CU639417.6-201ENST00000623297 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.92■□□□□ 0.94
CU639417.6-201ENST00000623297 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.9■□□□□ 0.94
CU639417.6-201ENST00000623297 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.88■□□□□ 0.93
CU639417.6-201ENST00000623297 JPH4Q96JJ6 628 aa20.87■□□□□ 0.93
CU639417.6-201ENST00000623297 HECW1Q76N89 1606 aa20.85■□□□□ 0.93
CU639417.6-201ENST00000623297 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.82■□□□□ 0.92
CU639417.6-201ENST00000623297 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
CU639417.6-201ENST00000623297 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa20.8■□□□□ 0.92
CU639417.6-201ENST00000623297 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.79■□□□□ 0.92
CU639417.6-201ENST00000623297 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CU639417.6-201ENST00000623297 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.78■□□□□ 0.92
CU639417.6-201ENST00000623297 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.78■□□□□ 0.92
CU639417.6-201ENST00000623297 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
CU639417.6-201ENST00000623297 CCER2I3L3R5 266 aa20.77■□□□□ 0.92
CU639417.6-201ENST00000623297 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.77■□□□□ 0.92
CU639417.6-201ENST00000623297 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
CU639417.6-201ENST00000623297 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.76■□□□□ 0.91
CU639417.6-201ENST00000623297 TONSLQ96HA7 1378 aa20.76■□□□□ 0.91
CU639417.6-201ENST00000623297 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.74■□□□□ 0.91
CU639417.6-201ENST00000623297 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.73■□□□□ 0.91
CU639417.6-201ENST00000623297 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CU639417.6-201ENST00000623297 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.72■□□□□ 0.91
CU639417.6-201ENST00000623297 FOXD1Q16676 465 aa20.72■□□□□ 0.91
CU639417.6-201ENST00000623297 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.7 ms