RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617710.4

LPCAT4-209, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LPCAT4, Length 1,719 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT4-209ENST00000617710 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.76■■□□□ 1.23
LPCAT4-209ENST00000617710 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.76■■□□□ 1.23
LPCAT4-209ENST00000617710 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.72■■□□□ 1.23
LPCAT4-209ENST00000617710 SHROOM2Q13796 1616 aa22.71■■□□□ 1.23
LPCAT4-209ENST00000617710 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.67■■□□□ 1.22
LPCAT4-209ENST00000617710 JPH4Q96JJ6 628 aa22.66■■□□□ 1.22
LPCAT4-209ENST00000617710 IQGAP2Q13576 1575 aa22.63■■□□□ 1.21
LPCAT4-209ENST00000617710 KIF21BO75037 1637 aa22.62■■□□□ 1.21
LPCAT4-209ENST00000617710 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
LPCAT4-209ENST00000617710 ARAP1Q96P48 1450 aa22.62■■□□□ 1.21
LPCAT4-209ENST00000617710 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.61■■□□□ 1.21
LPCAT4-209ENST00000617710 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.57■■□□□ 1.2
LPCAT4-209ENST00000617710 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.55■■□□□ 1.2
LPCAT4-209ENST00000617710 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.5■■□□□ 1.19
LPCAT4-209ENST00000617710 GOLGA3Q08378 1498 aa22.49■■□□□ 1.19
LPCAT4-209ENST00000617710 DISP1Q96F81 1524 aa22.48■■□□□ 1.19
LPCAT4-209ENST00000617710 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.44■■□□□ 1.18
LPCAT4-209ENST00000617710 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
LPCAT4-209ENST00000617710 KIAA0556O60303 1618 aa22.42■■□□□ 1.18
LPCAT4-209ENST00000617710 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LPCAT4-209ENST00000617710 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.37■■□□□ 1.17
LPCAT4-209ENST00000617710 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LPCAT4-209ENST00000617710 PTPRGP23470 1445 aa22.35■■□□□ 1.17
LPCAT4-209ENST00000617710 SAMD9Q5K651 1589 aa22.34■■□□□ 1.17
LPCAT4-209ENST00000617710 P3H3Q8IVL6 736 aa22.31■■□□□ 1.16
LPCAT4-209ENST00000617710 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.27■■□□□ 1.16
LPCAT4-209ENST00000617710 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.23■■□□□ 1.15
LPCAT4-209ENST00000617710 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.23■■□□□ 1.15
LPCAT4-209ENST00000617710 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.23■■□□□ 1.15
LPCAT4-209ENST00000617710 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.21■■□□□ 1.15
LPCAT4-209ENST00000617710 UACAQ9BZF9 1416 aa22.21■■□□□ 1.15
LPCAT4-209ENST00000617710 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.2■■□□□ 1.14
LPCAT4-209ENST00000617710 ABCC2Q92887 1545 aa22.18■■□□□ 1.14
LPCAT4-209ENST00000617710 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.16■■□□□ 1.14
LPCAT4-209ENST00000617710 ABCA8O94911 1581 aa22.16■■□□□ 1.14
LPCAT4-209ENST00000617710 CLIP1P30622 1438 aa22.11■■□□□ 1.13
LPCAT4-209ENST00000617710 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
LPCAT4-209ENST00000617710 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.09■■□□□ 1.13
LPCAT4-209ENST00000617710 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4-209ENST00000617710 CEP162Q5TB80 1403 aa22.07■■□□□ 1.12
LPCAT4-209ENST00000617710 MAPKBP1O60336 1514 aa22.06■■□□□ 1.12
LPCAT4-209ENST00000617710 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LPCAT4-209ENST00000617710 ARID3CA6NKF2 412 aa22.03■■□□□ 1.12
LPCAT4-209ENST00000617710 FMN1Q68DA7 1419 aa22.03■■□□□ 1.12
LPCAT4-209ENST00000617710 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
LPCAT4-209ENST00000617710 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LPCAT4-209ENST00000617710 ASXL2Q76L83 1435 aa21.99■■□□□ 1.11
LPCAT4-209ENST00000617710 ATP10BO94823 1461 aa21.98■■□□□ 1.11
LPCAT4-209ENST00000617710 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.94■■□□□ 1.1
LPCAT4-209ENST00000617710 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.94■■□□□ 1.1
LPCAT4-209ENST00000617710 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
LPCAT4-209ENST00000617710 DIP2BQ9P265 1576 aa21.93■■□□□ 1.1
LPCAT4-209ENST00000617710 HECW1Q76N89 1606 aa21.91■■□□□ 1.1
LPCAT4-209ENST00000617710 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
LPCAT4-209ENST00000617710 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.9■■□□□ 1.1
LPCAT4-209ENST00000617710 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
LPCAT4-209ENST00000617710 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.89■■□□□ 1.09
LPCAT4-209ENST00000617710 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
LPCAT4-209ENST00000617710 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.89■■□□□ 1.09
LPCAT4-209ENST00000617710 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
LPCAT4-209ENST00000617710 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.89■■□□□ 1.09
LPCAT4-209ENST00000617710 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
LPCAT4-209ENST00000617710 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.85■■□□□ 1.09
LPCAT4-209ENST00000617710 KCNH8Q96L42 1107 aa21.82■■□□□ 1.08
LPCAT4-209ENST00000617710 GLI2P10070 1586 aa21.8■■□□□ 1.08
LPCAT4-209ENST00000617710 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT4-209ENST00000617710 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.77■■□□□ 1.08
LPCAT4-209ENST00000617710 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.76■■□□□ 1.07
LPCAT4-209ENST00000617710 TSPOAP1O95153 1857 aa21.76■■□□□ 1.07
LPCAT4-209ENST00000617710 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.74■■□□□ 1.07
LPCAT4-209ENST00000617710 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.71■■□□□ 1.07
LPCAT4-209ENST00000617710 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
LPCAT4-209ENST00000617710 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
LPCAT4-209ENST00000617710 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.7■■□□□ 1.06
LPCAT4-209ENST00000617710 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.69■■□□□ 1.06
LPCAT4-209ENST00000617710 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
LPCAT4-209ENST00000617710 CD109Q6YHK3 1445 aa21.67■■□□□ 1.06
LPCAT4-209ENST00000617710 KIF14Q15058 1648 aa21.66■■□□□ 1.06
LPCAT4-209ENST00000617710 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.66■■□□□ 1.06
LPCAT4-209ENST00000617710 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.65■■□□□ 1.06
LPCAT4-209ENST00000617710 TIAM1Q13009 1591 aa21.61■■□□□ 1.05
LPCAT4-209ENST00000617710 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.58■■□□□ 1.05
LPCAT4-209ENST00000617710 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.58■■□□□ 1.04
LPCAT4-209ENST00000617710 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.54■■□□□ 1.04
LPCAT4-209ENST00000617710 MAP3K1Q13233 1512 aa21.53■■□□□ 1.04
LPCAT4-209ENST00000617710 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.52■■□□□ 1.04
LPCAT4-209ENST00000617710 KDM6BO15054 1643 aa21.52■■□□□ 1.03
LPCAT4-209ENST00000617710 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LPCAT4-209ENST00000617710 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
LPCAT4-209ENST00000617710 PLCH2O75038 1416 aa21.51■■□□□ 1.03
LPCAT4-209ENST00000617710 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.51■■□□□ 1.03
LPCAT4-209ENST00000617710 FANCAO15360 1455 aa21.49■■□□□ 1.03
LPCAT4-209ENST00000617710 NEO1Q92859 1461 aa21.47■■□□□ 1.03
LPCAT4-209ENST00000617710 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.46■■□□□ 1.03
LPCAT4-209ENST00000617710 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.46■■□□□ 1.03
LPCAT4-209ENST00000617710 PREX2Q70Z35 1606 aa21.46■■□□□ 1.03
LPCAT4-209ENST00000617710 APLP2Q06481 763 aa21.46■■□□□ 1.03
LPCAT4-209ENST00000617710 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.46■■□□□ 1.03
LPCAT4-209ENST00000617710 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
LPCAT4-209ENST00000617710 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms