RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614476.4

MTERF4-222, Transcript of mitochondrial transcription termination factor 4, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MTERF4, Length 4,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTERF4-222	ENST00000614476	ARID3C	A6NKF2	412 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MTERF4-222	ENST00000614476	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MTERF4-222	ENST00000614476	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		11.78	□□□□□ -0.52
MTERF4-222	ENST00000614476	SYNJ1	O43426	1573 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MTERF4-222	ENST00000614476	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MTERF4-222	ENST00000614476	TONSL	Q96HA7	1378 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MTERF4-222	ENST00000614476	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		11.74	□□□□□ -0.53
MTERF4-222	ENST00000614476	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MTERF4-222	ENST00000614476	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
MTERF4-222	ENST00000614476	HMGXB3	Q12766	1538 aa		11.73	□□□□□ -0.53
MTERF4-222	ENST00000614476	KIF21B	O75037	1637 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MTERF4-222	ENST00000614476	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
MTERF4-222	ENST00000614476	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
MTERF4-222	ENST00000614476	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MTERF4-222	ENST00000614476	NBR1	Q14596	966 aa		11.72	□□□□□ -0.53
MTERF4-222	ENST00000614476	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		11.71	□□□□□ -0.53
MTERF4-222	ENST00000614476	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		11.71	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	KCNH8	Q96L42	1107 aa		11.7	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	CFTR	P13569	1480 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		11.69	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	TOP2B	Q02880	1626 aa		11.67	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		11.66	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		11.65	□□□□□ -0.54
MTERF4-222	ENST00000614476	IGF1R	P08069	1367 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	FMN1	Q68DA7	1419 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	PRX	Q9BXM0	1461 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	CUX1	P39880	1505 aa		11.6	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	MRS2	Q9HD23	443 aa		11.59	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		11.59	□□□□□ -0.55
MTERF4-222	ENST00000614476	ERCC6	Q03468	1493 aa		11.58	□□□□□ -0.56
MTERF4-222	ENST00000614476	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	11.57	□□□□□ -0.56
MTERF4-222	ENST00000614476	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		11.57	□□□□□ -0.56
MTERF4-222	ENST00000614476	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
MTERF4-222	ENST00000614476	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.56	□□□□□ -0.56
MTERF4-222	ENST00000614476	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	11.55	□□□□□ -0.56
MTERF4-222	ENST00000614476	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		11.54	□□□□□ -0.56
MTERF4-222	ENST00000614476	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		11.54	□□□□□ -0.56
MTERF4-222	ENST00000614476	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		11.53	□□□□□ -0.56
MTERF4-222	ENST00000614476	TSPY4	P0CV99	314 aa		11.53	□□□□□ -0.56
MTERF4-222	ENST00000614476	TSPY10	P0CW01	314 aa		11.53	□□□□□ -0.56
MTERF4-222	ENST00000614476	ARAP1	Q96P48	1450 aa		11.52	□□□□□ -0.57
MTERF4-222	ENST00000614476	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
MTERF4-222	ENST00000614476	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
MTERF4-222	ENST00000614476	MSH5	O43196	834 aa		11.51	□□□□□ -0.57
MTERF4-222	ENST00000614476	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
MTERF4-222	ENST00000614476	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
MTERF4-222	ENST00000614476	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
MTERF4-222	ENST00000614476	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MTERF4-222	ENST00000614476	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57
MTERF4-222	ENST00000614476	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		11.49	□□□□□ -0.57
MTERF4-222	ENST00000614476	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
MTERF4-222	ENST00000614476	TOPBP1	Q92547	1522 aa		11.46	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	NES	P48681	1621 aa		11.45	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.45	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	NEFM	P07197	916 aa		11.45	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		11.44	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		11.43	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		11.42	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	TMC1	Q8TDI8	760 aa		11.42	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		11.41	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		11.4	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
MTERF4-222	ENST00000614476	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		11.39	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		11.39	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	USP35	Q9P2H5	1018 aa		11.39	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		11.39	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		11.39	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		11.38	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	11.38	□□□□□ -0.59	8e-7	■■■□□ 18.5
MTERF4-222	ENST00000614476	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		11.38	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	WDR97	A6NE52	1622 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	TIAM1	Q13009	1591 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		11.36	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	NUDC	Q9Y266	331 aa		11.35	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		11.34	□□□□□ -0.59
MTERF4-222	ENST00000614476	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		11.33	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms