RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609041.1

TAF4-208, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 4, human

Gene TAF4, Length 2,487 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF4-208	ENST00000609041	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TAF4-208	ENST00000609041	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TAF4-208	ENST00000609041	MIER1	Q8N108	512 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TAF4-208	ENST00000609041	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
TAF4-208	ENST00000609041	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TAF4-208	ENST00000609041	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TAF4-208	ENST00000609041	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		28.5	■■■□□ 2.15
TAF4-208	ENST00000609041	CUL7	Q14999	1698 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TAF4-208	ENST00000609041	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
TAF4-208	ENST00000609041	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		28.48	■■■□□ 2.15
TAF4-208	ENST00000609041	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TAF4-208	ENST00000609041	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
TAF4-208	ENST00000609041	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		28.46	■■■□□ 2.15
TAF4-208	ENST00000609041	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
TAF4-208	ENST00000609041	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TAF4-208	ENST00000609041	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.41	■■■□□ 2.14
TAF4-208	ENST00000609041	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		28.4	■■■□□ 2.14
TAF4-208	ENST00000609041	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.39	■■■□□ 2.14
TAF4-208	ENST00000609041	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.37	■■■□□ 2.13
TAF4-208	ENST00000609041	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
TAF4-208	ENST00000609041	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
TAF4-208	ENST00000609041	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.35	■■■□□ 2.13
TAF4-208	ENST00000609041	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		28.35	■■■□□ 2.13
TAF4-208	ENST00000609041	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.34	■■■□□ 2.13	7e-8	■■■■□ 22.3
TAF4-208	ENST00000609041	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TAF4-208	ENST00000609041	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TAF4-208	ENST00000609041	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.32	■■■□□ 2.12
TAF4-208	ENST00000609041	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.29	■■■□□ 2.12
TAF4-208	ENST00000609041	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.28	■■■□□ 2.12
TAF4-208	ENST00000609041	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.24	■■■□□ 2.11
TAF4-208	ENST00000609041	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		28.21	■■■□□ 2.11
TAF4-208	ENST00000609041	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	28.19	■■■□□ 2.1
TAF4-208	ENST00000609041	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.18	■■■□□ 2.1
TAF4-208	ENST00000609041	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.17	■■■□□ 2.1
TAF4-208	ENST00000609041	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TAF4-208	ENST00000609041	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.12	■■■□□ 2.09
TAF4-208	ENST00000609041	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
TAF4-208	ENST00000609041	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.1	■■■□□ 2.09
TAF4-208	ENST00000609041	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TAF4-208	ENST00000609041	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TAF4-208	ENST00000609041	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
TAF4-208	ENST00000609041	NCOA2	Q15596	1464 aa		28	■■■□□ 2.07
TAF4-208	ENST00000609041	PTPRK	Q15262	1439 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TAF4-208	ENST00000609041	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TAF4-208	ENST00000609041	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.95	■■■□□ 2.07
TAF4-208	ENST00000609041	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TAF4-208	ENST00000609041	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TAF4-208	ENST00000609041	HFM1	A2PYH4	1435 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TAF4-208	ENST00000609041	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
TAF4-208	ENST00000609041	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		27.91	■■■□□ 2.06
TAF4-208	ENST00000609041	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TAF4-208	ENST00000609041	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TAF4-208	ENST00000609041	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TAF4-208	ENST00000609041	IQGAP2	Q13576	1575 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TAF4-208	ENST00000609041	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TAF4-208	ENST00000609041	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TAF4-208	ENST00000609041	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TAF4-208	ENST00000609041	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TAF4-208	ENST00000609041	NAIP	Q13075	1403 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TAF4-208	ENST00000609041	UACA	Q9BZF9	1416 aa		27.84	■■■□□ 2.05
TAF4-208	ENST00000609041	HECW1	Q76N89	1606 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TAF4-208	ENST00000609041	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
TAF4-208	ENST00000609041	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TAF4-208	ENST00000609041	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
TAF4-208	ENST00000609041	TONSL	Q96HA7	1378 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TAF4-208	ENST00000609041	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
TAF4-208	ENST00000609041	KCNH8	Q96L42	1107 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TAF4-208	ENST00000609041	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TAF4-208	ENST00000609041	IFT140	Q96RY7	1462 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TAF4-208	ENST00000609041	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TAF4-208	ENST00000609041	WDR62	O43379	1518 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TAF4-208	ENST00000609041	ARID3C	A6NKF2	412 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TAF4-208	ENST00000609041	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TAF4-208	ENST00000609041	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TAF4-208	ENST00000609041	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TAF4-208	ENST00000609041	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TAF4-208	ENST00000609041	DISP1	Q96F81	1524 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TAF4-208	ENST00000609041	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		27.59	■■■□□ 2.01
TAF4-208	ENST00000609041	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TAF4-208	ENST00000609041	KIAA0556	O60303	1618 aa		27.57	■■■□□ 2
TAF4-208	ENST00000609041	KDM6B	O15054	1643 aa		27.54	■■■□□ 2
TAF4-208	ENST00000609041	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.54	■■■□□ 2
TAF4-208	ENST00000609041	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		27.54	■■■□□ 2
TAF4-208	ENST00000609041	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.54	■■■□□ 2
TAF4-208	ENST00000609041	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
TAF4-208	ENST00000609041	TRIM52	Q96A61	297 aa		27.53	■■■□□ 2
TAF4-208	ENST00000609041	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
TAF4-208	ENST00000609041	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
TAF4-208	ENST00000609041	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		27.45	■■□□□ 1.99
TAF4-208	ENST00000609041	ANP32C	O43423	234 aa		27.45	■■□□□ 1.98
TAF4-208	ENST00000609041	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		27.44	■■□□□ 1.98
TAF4-208	ENST00000609041	ERCC6	Q03468	1493 aa		27.44	■■□□□ 1.98
TAF4-208	ENST00000609041	DAPK1	P53355	1430 aa		27.43	■■□□□ 1.98
TAF4-208	ENST00000609041	CCER2	I3L3R5	266 aa		27.41	■■□□□ 1.98
TAF4-208	ENST00000609041	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	27.41	■■□□□ 1.98
TAF4-208	ENST00000609041	ABCC5	O15440	1437 aa		27.39	■■□□□ 1.98
TAF4-208	ENST00000609041	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
TAF4-208	ENST00000609041	ROCK1	Q13464	1354 aa		27.39	■■□□□ 1.98
TAF4-208	ENST00000609041	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
TAF4-208	ENST00000609041	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.97

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