RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603043.1

CDCA3-211, Transcript of cell division cycle associated 3, humanhuman

TSL 2

Gene CDCA3, Length 1,995 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3-211ENST00000603043 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.77■■□□□ 1.72
CDCA3-211ENST00000603043 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.77■■□□□ 1.72
CDCA3-211ENST00000603043 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.77■■□□□ 1.72
CDCA3-211ENST00000603043 SHROOM2Q13796 1616 aa25.77■■□□□ 1.72
CDCA3-211ENST00000603043 KIF21BO75037 1637 aa25.75■■□□□ 1.71
CDCA3-211ENST00000603043 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.73■■□□□ 1.71
CDCA3-211ENST00000603043 IQGAP2Q13576 1575 aa25.72■■□□□ 1.71
CDCA3-211ENST00000603043 JPH4Q96JJ6 628 aa25.68■■□□□ 1.7
CDCA3-211ENST00000603043 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CDCA3-211ENST00000603043 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.64■■□□□ 1.69
CDCA3-211ENST00000603043 GOLGA3Q08378 1498 aa25.6■■□□□ 1.69
CDCA3-211ENST00000603043 ARAP1Q96P48 1450 aa25.59■■□□□ 1.69
CDCA3-211ENST00000603043 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.56■■□□□ 1.68
CDCA3-211ENST00000603043 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.55■■□□□ 1.68
CDCA3-211ENST00000603043 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.51■■□□□ 1.67
CDCA3-211ENST00000603043 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.5■■□□□ 1.67
CDCA3-211ENST00000603043 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CDCA3-211ENST00000603043 DISP1Q96F81 1524 aa25.49■■□□□ 1.67
CDCA3-211ENST00000603043 KIAA0556O60303 1618 aa25.46■■□□□ 1.67
CDCA3-211ENST00000603043 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.39■■□□□ 1.66
CDCA3-211ENST00000603043 SAMD9Q5K651 1589 aa25.38■■□□□ 1.65
CDCA3-211ENST00000603043 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CDCA3-211ENST00000603043 PTPRGP23470 1445 aa25.35■■□□□ 1.65
CDCA3-211ENST00000603043 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CDCA3-211ENST00000603043 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.31■■□□□ 1.64
CDCA3-211ENST00000603043 P3H3Q8IVL6 736 aa25.29■■□□□ 1.64
CDCA3-211ENST00000603043 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.25■■□□□ 1.63
CDCA3-211ENST00000603043 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.23■■□□□ 1.63
CDCA3-211ENST00000603043 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.22■■□□□ 1.63
CDCA3-211ENST00000603043 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.21■■□□□ 1.63
CDCA3-211ENST00000603043 UACAQ9BZF9 1416 aa25.2■■□□□ 1.62
CDCA3-211ENST00000603043 ABCC2Q92887 1545 aa25.17■■□□□ 1.62
CDCA3-211ENST00000603043 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.17■■□□□ 1.62
CDCA3-211ENST00000603043 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.16■■□□□ 1.62
CDCA3-211ENST00000603043 ABCA8O94911 1581 aa25.15■■□□□ 1.62
CDCA3-211ENST00000603043 CLIP1P30622 1438 aa25.14■■□□□ 1.62
CDCA3-211ENST00000603043 CEP162Q5TB80 1403 aa25.1■■□□□ 1.61
CDCA3-211ENST00000603043 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
CDCA3-211ENST00000603043 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.09■■□□□ 1.61
CDCA3-211ENST00000603043 FMN1Q68DA7 1419 aa25.06■■□□□ 1.6
CDCA3-211ENST00000603043 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.05■■□□□ 1.6
CDCA3-211ENST00000603043 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CDCA3-211ENST00000603043 MAPKBP1O60336 1514 aa25.02■■□□□ 1.6
CDCA3-211ENST00000603043 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CDCA3-211ENST00000603043 ARID3CA6NKF2 412 aa24.94■■□□□ 1.58
CDCA3-211ENST00000603043 HECW1Q76N89 1606 aa24.94■■□□□ 1.58
CDCA3-211ENST00000603043 ATP10BO94823 1461 aa24.93■■□□□ 1.58
CDCA3-211ENST00000603043 ASXL2Q76L83 1435 aa24.92■■□□□ 1.58
CDCA3-211ENST00000603043 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CDCA3-211ENST00000603043 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CDCA3-211ENST00000603043 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.88■■□□□ 1.57
CDCA3-211ENST00000603043 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
CDCA3-211ENST00000603043 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.87■■□□□ 1.57
CDCA3-211ENST00000603043 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.86■■□□□ 1.57
CDCA3-211ENST00000603043 DIP2BQ9P265 1576 aa24.86■■□□□ 1.57
CDCA3-211ENST00000603043 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.85■■□□□ 1.57
CDCA3-211ENST00000603043 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CDCA3-211ENST00000603043 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CDCA3-211ENST00000603043 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.85■■□□□ 1.57
CDCA3-211ENST00000603043 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.85■■□□□ 1.57
CDCA3-211ENST00000603043 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CDCA3-211ENST00000603043 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CDCA3-211ENST00000603043 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.78■■□□□ 1.56
CDCA3-211ENST00000603043 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.78■■□□□ 1.56
CDCA3-211ENST00000603043 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.78■■□□□ 1.56
CDCA3-211ENST00000603043 GLI2P10070 1586 aa24.75■■□□□ 1.55
CDCA3-211ENST00000603043 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.73■■□□□ 1.55
CDCA3-211ENST00000603043 KCNH8Q96L42 1107 aa24.73■■□□□ 1.55
CDCA3-211ENST00000603043 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CDCA3-211ENST00000603043 TSPOAP1O95153 1857 aa24.68■■□□□ 1.54
CDCA3-211ENST00000603043 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.67■■□□□ 1.54
CDCA3-211ENST00000603043 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.65■■□□□ 1.54
CDCA3-211ENST00000603043 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.63■■□□□ 1.53
CDCA3-211ENST00000603043 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CDCA3-211ENST00000603043 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.61■■□□□ 1.53
CDCA3-211ENST00000603043 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CDCA3-211ENST00000603043 KIF14Q15058 1648 aa24.59■■□□□ 1.53
CDCA3-211ENST00000603043 TIAM1Q13009 1591 aa24.58■■□□□ 1.53
CDCA3-211ENST00000603043 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
CDCA3-211ENST00000603043 CD109Q6YHK3 1445 aa24.58■■□□□ 1.53
CDCA3-211ENST00000603043 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.56■■□□□ 1.52
CDCA3-211ENST00000603043 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.53■■□□□ 1.52
CDCA3-211ENST00000603043 MAP3K1Q13233 1512 aa24.53■■□□□ 1.52
CDCA3-211ENST00000603043 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.52■■□□□ 1.52
CDCA3-211ENST00000603043 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.52■■□□□ 1.52
CDCA3-211ENST00000603043 APLP2Q06481 763 aa24.48■■□□□ 1.51
CDCA3-211ENST00000603043 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.48■■□□□ 1.51
CDCA3-211ENST00000603043 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.45■■□□□ 1.51
CDCA3-211ENST00000603043 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CDCA3-211ENST00000603043 PLCH2O75038 1416 aa24.41■■□□□ 1.5
CDCA3-211ENST00000603043 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.4■■□□□ 1.5
CDCA3-211ENST00000603043 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CDCA3-211ENST00000603043 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.39■■□□□ 1.5
CDCA3-211ENST00000603043 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.39■■□□□ 1.49
CDCA3-211ENST00000603043 KDM6BO15054 1643 aa24.39■■□□□ 1.49
CDCA3-211ENST00000603043 PREX2Q70Z35 1606 aa24.39■■□□□ 1.49
CDCA3-211ENST00000603043 FANCAO15360 1455 aa24.39■■□□□ 1.49
CDCA3-211ENST00000603043 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.38■■□□□ 1.49
CDCA3-211ENST00000603043 NEO1Q92859 1461 aa24.38■■□□□ 1.49
CDCA3-211ENST00000603043 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.36■■□□□ 1.49
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