RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591598.5

CTDP1-207, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTDP1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-207ENST00000591598 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.4■■□□□ 1.5
CTDP1-207ENST00000591598 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CTDP1-207ENST00000591598 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.39■■□□□ 1.49
CTDP1-207ENST00000591598 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CTDP1-207ENST00000591598 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.38■■□□□ 1.49
CTDP1-207ENST00000591598 TOPBP1Q92547 1522 aa24.36■■□□□ 1.49
CTDP1-207ENST00000591598 TIAM1Q13009 1591 aa24.34■■□□□ 1.49
CTDP1-207ENST00000591598 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.33■■□□□ 1.48
CTDP1-207ENST00000591598 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.32■■□□□ 1.48
CTDP1-207ENST00000591598 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.31■■□□□ 1.48
CTDP1-207ENST00000591598 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.29■■□□□ 1.48
CTDP1-207ENST00000591598 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CTDP1-207ENST00000591598 ARID3CA6NKF2 412 aa24.25■■□□□ 1.47
CTDP1-207ENST00000591598 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.24■■□□□ 1.47
CTDP1-207ENST00000591598 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.23■■□□□ 1.47
CTDP1-207ENST00000591598 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CTDP1-207ENST00000591598 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CTDP1-207ENST00000591598 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CTDP1-207ENST00000591598 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.17■■□□□ 1.46
CTDP1-207ENST00000591598 MAP3K1Q13233 1512 aa24.11■■□□□ 1.45
CTDP1-207ENST00000591598 MAPKBP1O60336 1514 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDP1-207ENST00000591598 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.09■■□□□ 1.45
CTDP1-207ENST00000591598 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDP1-207ENST00000591598 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CTDP1-207ENST00000591598 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.08■■□□□ 1.45
CTDP1-207ENST00000591598 KCNH8Q96L42 1107 aa24.07■■□□□ 1.44
CTDP1-207ENST00000591598 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.06■■□□□ 1.44
CTDP1-207ENST00000591598 FMN1Q68DA7 1419 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDP1-207ENST00000591598 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.05■■□□□ 1.44
CTDP1-207ENST00000591598 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.02■■□□□ 1.44
CTDP1-207ENST00000591598 CUL7Q14999 1698 aa24.01■■□□□ 1.43
CTDP1-207ENST00000591598 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.01■■□□□ 1.43
CTDP1-207ENST00000591598 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24■■□□□ 1.43
CTDP1-207ENST00000591598 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDP1-207ENST00000591598 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.98■■□□□ 1.43
CTDP1-207ENST00000591598 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.97■■□□□ 1.43
CTDP1-207ENST00000591598 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
CTDP1-207ENST00000591598 WDR97A6NE52 1622 aa23.95■■□□□ 1.43
CTDP1-207ENST00000591598 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.92■■□□□ 1.42
CTDP1-207ENST00000591598 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.9■■□□□ 1.42
CTDP1-207ENST00000591598 TRIM52Q96A61 297 aa23.9■■□□□ 1.42
CTDP1-207ENST00000591598 PTPRKQ15262 1439 aa23.9■■□□□ 1.42
CTDP1-207ENST00000591598 TONSLQ96HA7 1378 aa23.89■■□□□ 1.42
CTDP1-207ENST00000591598 NCOA2Q15596 1464 aa23.88■■□□□ 1.41
CTDP1-207ENST00000591598 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CTDP1-207ENST00000591598 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.87■■□□□ 1.41
CTDP1-207ENST00000591598 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.85■■□□□ 1.41
CTDP1-207ENST00000591598 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.81■■□□□ 1.4
CTDP1-207ENST00000591598 FBLN2P98095 1184 aa23.8■■□□□ 1.4
CTDP1-207ENST00000591598 GRIN2BQ13224 1484 aa23.78■■□□□ 1.4
CTDP1-207ENST00000591598 FOXD1Q16676 465 aa23.76■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 SAMD9Q5K651 1589 aa23.76■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.74■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 HFM1A2PYH4 1435 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 NAIPQ13075 1403 aa23.73■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 BCANQ96GW7 911 aa23.72■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 ANP32CO43423 234 aa23.71■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 UACAQ9BZF9 1416 aa23.7■■□□□ 1.39
CTDP1-207ENST00000591598 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CTDP1-207ENST00000591598 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.67■■□□□ 1.38
CTDP1-207ENST00000591598 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.67■■□□□ 1.38
CTDP1-207ENST00000591598 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CTDP1-207ENST00000591598 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.65■■□□□ 1.38
CTDP1-207ENST00000591598 IQGAP2Q13576 1575 aa23.64■■□□□ 1.38
CTDP1-207ENST00000591598 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CTDP1-207ENST00000591598 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
CTDP1-207ENST00000591598 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDP1-207ENST00000591598 PBRM1Q86U86 1689 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDP1-207ENST00000591598 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CTDP1-207ENST00000591598 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.58■■□□□ 1.37
CTDP1-207ENST00000591598 ADAMTS12P58397 1594 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-207ENST00000591598 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-207ENST00000591598 HECW1Q76N89 1606 aa23.56■■□□□ 1.36
CTDP1-207ENST00000591598 FKBP8Q14318 412 aa23.54■■□□□ 1.36
CTDP1-207ENST00000591598 ERCC6Q03468 1493 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDP1-207ENST00000591598 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CTDP1-207ENST00000591598 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTDP1-207ENST00000591598 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDP1-207ENST00000591598 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CTDP1-207ENST00000591598 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CTDP1-207ENST00000591598 KDM6BO15054 1643 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDP1-207ENST00000591598 IFT140Q96RY7 1462 aa23.47■■□□□ 1.35
CTDP1-207ENST00000591598 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CTDP1-207ENST00000591598 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTDP1-207ENST00000591598 ARHGEF11O15085 1522 aa23.45■■□□□ 1.35
CTDP1-207ENST00000591598 WDR62O43379 1518 aa23.45■■□□□ 1.35
CTDP1-207ENST00000591598 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
CTDP1-207ENST00000591598 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDP1-207ENST00000591598 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-207ENST00000591598 CCER2I3L3R5 266 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-207ENST00000591598 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDP1-207ENST00000591598 NEFLP07196 543 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDP1-207ENST00000591598 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.41■■□□□ 1.34
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