RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTIF-205ENST00000587860 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTIF-205ENST00000587860 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.13■■□□□ 1.13
CTIF-205ENST00000587860 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTIF-205ENST00000587860 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.08■■□□□ 1.12
CTIF-205ENST00000587860 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-205ENST00000587860 ARID3CA6NKF2 412 aa22.07■■□□□ 1.12
CTIF-205ENST00000587860 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CTIF-205ENST00000587860 TOPBP1Q92547 1522 aa22.02■■□□□ 1.12
CTIF-205ENST00000587860 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.99■■□□□ 1.11
CTIF-205ENST00000587860 PRDM2Q13029 1718 aa21.96■■□□□ 1.11
CTIF-205ENST00000587860 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.96■■□□□ 1.11
CTIF-205ENST00000587860 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
CTIF-205ENST00000587860 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.93■■□□□ 1.1
CTIF-205ENST00000587860 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CTIF-205ENST00000587860 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CTIF-205ENST00000587860 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.89■■□□□ 1.1
CTIF-205ENST00000587860 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.87■■□□□ 1.09
CTIF-205ENST00000587860 TIAM1Q13009 1591 aa21.86■■□□□ 1.09
CTIF-205ENST00000587860 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.86■■□□□ 1.09
CTIF-205ENST00000587860 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CTIF-205ENST00000587860 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.8■■□□□ 1.08
CTIF-205ENST00000587860 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.79■■□□□ 1.08
CTIF-205ENST00000587860 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.79■■□□□ 1.08
CTIF-205ENST00000587860 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
CTIF-205ENST00000587860 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.76■■□□□ 1.07
CTIF-205ENST00000587860 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.76■■□□□ 1.07
CTIF-205ENST00000587860 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.74■■□□□ 1.07
CTIF-205ENST00000587860 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.74■■□□□ 1.07
CTIF-205ENST00000587860 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.74■■□□□ 1.07
CTIF-205ENST00000587860 KCNH8Q96L42 1107 aa21.73■■□□□ 1.07
CTIF-205ENST00000587860 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.71■■□□□ 1.07
CTIF-205ENST00000587860 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.67■■□□□ 1.06
CTIF-205ENST00000587860 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.67■■□□□ 1.06
CTIF-205ENST00000587860 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.66■■□□□ 1.06
CTIF-205ENST00000587860 MAPKBP1O60336 1514 aa21.65■■□□□ 1.06
CTIF-205ENST00000587860 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CTIF-205ENST00000587860 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.65■■□□□ 1.06
CTIF-205ENST00000587860 FBLN2P98095 1184 aa21.64■■□□□ 1.05
CTIF-205ENST00000587860 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
CTIF-205ENST00000587860 PTPRKQ15262 1439 aa21.6■■□□□ 1.05
CTIF-205ENST00000587860 FMN1Q68DA7 1419 aa21.59■■□□□ 1.05
CTIF-205ENST00000587860 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.59■■□□□ 1.05
CTIF-205ENST00000587860 MAP3K1Q13233 1512 aa21.57■■□□□ 1.04
CTIF-205ENST00000587860 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CTIF-205ENST00000587860 CUL7Q14999 1698 aa21.56■■□□□ 1.04
CTIF-205ENST00000587860 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTIF-205ENST00000587860 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-205ENST00000587860 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.55■■□□□ 1.04
CTIF-205ENST00000587860 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.54■■□□□ 1.04
CTIF-205ENST00000587860 WDR97A6NE52 1622 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-205ENST00000587860 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-205ENST00000587860 FOXD1Q16676 465 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-205ENST00000587860 TRIM52Q96A61 297 aa21.53■■□□□ 1.04
CTIF-205ENST00000587860 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.52■■□□□ 1.04
CTIF-205ENST00000587860 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.52■■□□□ 1.04
CTIF-205ENST00000587860 NCOA2Q15596 1464 aa21.5■■□□□ 1.03
CTIF-205ENST00000587860 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.45■■□□□ 1.02
CTIF-205ENST00000587860 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTIF-205ENST00000587860 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CTIF-205ENST00000587860 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTIF-205ENST00000587860 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.44■■□□□ 1.02
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CTIF-205ENST00000587860 GRIN2BQ13224 1484 aa21.42■■□□□ 1.02
CTIF-205ENST00000587860 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.41■■□□□ 1.02
CTIF-205ENST00000587860 TONSLQ96HA7 1378 aa21.4■■□□□ 1.02
CTIF-205ENST00000587860 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.4■■□□□ 1.02
CTIF-205ENST00000587860 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CTIF-205ENST00000587860 SAMD9Q5K651 1589 aa21.38■■□□□ 1.01
CTIF-205ENST00000587860 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
CTIF-205ENST00000587860 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.37■■□□□ 1.01
CTIF-205ENST00000587860 NAIPQ13075 1403 aa21.35■■□□□ 1.01
CTIF-205ENST00000587860 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.34■■□□□ 1.01
CTIF-205ENST00000587860 ERCC6Q03468 1493 aa21.33■■□□□ 1.01
CTIF-205ENST00000587860 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CTIF-205ENST00000587860 IQGAP2Q13576 1575 aa21.3■■□□□ 1
CTIF-205ENST00000587860 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
CTIF-205ENST00000587860 PBRM1Q86U86 1689 aa21.3■■□□□ 1
CTIF-205ENST00000587860 HFM1A2PYH4 1435 aa21.29■■□□□ 1
CTIF-205ENST00000587860 BCANQ96GW7 911 aa21.29■■□□□ 1
CTIF-205ENST00000587860 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CTIF-205ENST00000587860 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.26■□□□□ 0.99
CTIF-205ENST00000587860 ADAMTS12P58397 1594 aa21.25■□□□□ 0.99
CTIF-205ENST00000587860 UACAQ9BZF9 1416 aa21.25■□□□□ 0.99
CTIF-205ENST00000587860 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
CTIF-205ENST00000587860 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
CTIF-205ENST00000587860 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.23■□□□□ 0.99
CTIF-205ENST00000587860 KDM6BO15054 1643 aa21.23■□□□□ 0.99
CTIF-205ENST00000587860 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.22■□□□□ 0.99
CTIF-205ENST00000587860 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.22■□□□□ 0.99
CTIF-205ENST00000587860 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.18■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 IFT140Q96RY7 1462 aa21.18■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.17■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 ANP32CO43423 234 aa21.17■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 JPH4Q96JJ6 628 aa21.17■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 DISP1Q96F81 1524 aa21.16■□□□□ 0.98
CTIF-205ENST00000587860 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
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