RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GGA3-218ENST00000584243 SOGA1O94964 1423 aa14.83□□□□□ -0.03
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GGA3-218ENST00000584243 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.77□□□□□ -0.04
GGA3-218ENST00000584243 NUP160Q12769 1436 aa14.75□□□□□ -0.05
GGA3-218ENST00000584243 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GGA3-218ENST00000584243 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
GGA3-218ENST00000584243 PBRM1Q86U86 1689 aa14.71□□□□□ -0.05
GGA3-218ENST00000584243 GRIN2AQ12879 1464 aa14.71□□□□□ -0.05
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GGA3-218ENST00000584243 PTPRMP28827 1452 aa14.67□□□□□ -0.06
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GGA3-218ENST00000584243 KIF21BO75037 1637 aa14.58□□□□□ -0.08
GGA3-218ENST00000584243 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.56□□□□□ -0.08
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GGA3-218ENST00000584243 ASXL2Q76L83 1435 aa14.49□□□□□ -0.09
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GGA3-218ENST00000584243 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.44□□□□□ -0.1
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GGA3-218ENST00000584243 MADDQ8WXG6 1647 aa14.41□□□□□ -0.1
GGA3-218ENST00000584243 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
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GGA3-218ENST00000584243 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.34□□□□□ -0.11
GGA3-218ENST00000584243 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.32□□□□□ -0.12
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GGA3-218ENST00000584243 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
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GGA3-218ENST00000584243 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.16□□□□□ -0.14
GGA3-218ENST00000584243 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.15□□□□□ -0.14
GGA3-218ENST00000584243 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.15□□□□□ -0.14
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GGA3-218ENST00000584243 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
GGA3-218ENST00000584243 CD109Q6YHK3 1445 aa14.13□□□□□ -0.15
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GGA3-218ENST00000584243 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.08□□□□□ -0.16
GGA3-218ENST00000584243 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.08□□□□□ -0.16
GGA3-218ENST00000584243 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.08□□□□□ -0.16
GGA3-218ENST00000584243 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.07□□□□□ -0.16
GGA3-218ENST00000584243 RAPGEF3O95398 923 aa14.04□□□□□ -0.16
GGA3-218ENST00000584243 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.04□□□□□ -0.16
GGA3-218ENST00000584243 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.04□□□□□ -0.16
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GGA3-218ENST00000584243 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa13.93□□□□□ -0.18
GGA3-218ENST00000584243 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
GGA3-218ENST00000584243 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
GGA3-218ENST00000584243 KCNH8Q96L42 1107 aa13.92□□□□□ -0.18
GGA3-218ENST00000584243 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa13.9□□□□□ -0.18
GGA3-218ENST00000584243 POTEAQ6S8J7 498 aa13.9□□□□□ -0.18
GGA3-218ENST00000584243 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa13.9□□□□□ -0.19
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GGA3-218ENST00000584243 RICTORQ6R327 1708 aa13.78□□□□□ -0.2
GGA3-218ENST00000584243 AKNAQ7Z591 1439 aa13.77□□□□□ -0.21
GGA3-218ENST00000584243 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
GGA3-218ENST00000584243 KIAA0556O60303 1618 aa13.75□□□□□ -0.21
GGA3-218ENST00000584243 ABCA9Q8IUA7 1624 aa13.75□□□□□ -0.21
GGA3-218ENST00000584243 TOM1O60784 492 aa13.74□□□□□ -0.21
GGA3-218ENST00000584243 IFFO2Q5TF58 517 aa13.74□□□□□ -0.21
GGA3-218ENST00000584243 IQGAP2Q13576 1575 aa13.74□□□□□ -0.21
GGA3-218ENST00000584243 FHOD3Q2V2M9 1422 aa13.73□□□□□ -0.21
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