RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579941.1

DCC-211, Transcript of DCC netrin 1 receptor, human

TSL 5

Gene DCC, Length 750 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCC-211	ENST00000579941	CEP162	Q5TB80	1403 aa		11.81	□□□□□ -0.52
DCC-211	ENST00000579941	PRX	Q9BXM0	1461 aa		11.8	□□□□□ -0.52
DCC-211	ENST00000579941	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		11.79	□□□□□ -0.52
DCC-211	ENST00000579941	CUX2	O14529	1486 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DCC-211	ENST00000579941	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DCC-211	ENST00000579941	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DCC-211	ENST00000579941	NES	P48681	1621 aa		11.78	□□□□□ -0.52
DCC-211	ENST00000579941	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		11.77	□□□□□ -0.52
DCC-211	ENST00000579941	TOPBP1	Q92547	1522 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DCC-211	ENST00000579941	IGF1R	P08069	1367 aa		11.76	□□□□□ -0.53
DCC-211	ENST00000579941	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		11.74	□□□□□ -0.53
DCC-211	ENST00000579941	CLIP1	P30622	1438 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DCC-211	ENST00000579941	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		11.73	□□□□□ -0.53
DCC-211	ENST00000579941	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
DCC-211	ENST00000579941	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		11.72	□□□□□ -0.53
DCC-211	ENST00000579941	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
DCC-211	ENST00000579941	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		11.67	□□□□□ -0.54
DCC-211	ENST00000579941	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DCC-211	ENST00000579941	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DCC-211	ENST00000579941	ERCC6	Q03468	1493 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DCC-211	ENST00000579941	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DCC-211	ENST00000579941	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DCC-211	ENST00000579941	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
DCC-211	ENST00000579941	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
DCC-211	ENST00000579941	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
DCC-211	ENST00000579941	IFT140	Q96RY7	1462 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DCC-211	ENST00000579941	HRC	P23327	699 aa		11.58	□□□□□ -0.56
DCC-211	ENST00000579941	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
DCC-211	ENST00000579941	WDR62	O43379	1518 aa		11.55	□□□□□ -0.56
DCC-211	ENST00000579941	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	11.55	□□□□□ -0.56
DCC-211	ENST00000579941	CUL7	Q14999	1698 aa		11.55	□□□□□ -0.56
DCC-211	ENST00000579941	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		11.53	□□□□□ -0.56
DCC-211	ENST00000579941	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
DCC-211	ENST00000579941	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		11.52	□□□□□ -0.56
DCC-211	ENST00000579941	WDR97	A6NE52	1622 aa		11.52	□□□□□ -0.57
DCC-211	ENST00000579941	GRIN2B	Q13224	1484 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DCC-211	ENST00000579941	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DCC-211	ENST00000579941	ARAP1	Q96P48	1450 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DCC-211	ENST00000579941	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		11.51	□□□□□ -0.57
DCC-211	ENST00000579941	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DCC-211	ENST00000579941	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
DCC-211	ENST00000579941	HAX1	O00165	279 aa		11.48	□□□□□ -0.57
DCC-211	ENST00000579941	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		11.47	□□□□□ -0.57
DCC-211	ENST00000579941	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	11.47	□□□□□ -0.57
DCC-211	ENST00000579941	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
DCC-211	ENST00000579941	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		11.45	□□□□□ -0.58
DCC-211	ENST00000579941	FMN1	Q68DA7	1419 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DCC-211	ENST00000579941	MAP3K1	Q13233	1512 aa		11.44	□□□□□ -0.58
DCC-211	ENST00000579941	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
DCC-211	ENST00000579941	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DCC-211	ENST00000579941	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.42	□□□□□ -0.58
DCC-211	ENST00000579941	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
DCC-211	ENST00000579941	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
DCC-211	ENST00000579941	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
DCC-211	ENST00000579941	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		11.39	□□□□□ -0.59
DCC-211	ENST00000579941	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
DCC-211	ENST00000579941	P3H3	Q8IVL6	736 aa		11.38	□□□□□ -0.59
DCC-211	ENST00000579941	ADAMTS12	P58397	1594 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DCC-211	ENST00000579941	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		11.37	□□□□□ -0.59
DCC-211	ENST00000579941	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DCC-211	ENST00000579941	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DCC-211	ENST00000579941	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
DCC-211	ENST00000579941	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		11.36	□□□□□ -0.59
DCC-211	ENST00000579941	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
DCC-211	ENST00000579941	SYNJ2	O15056	1496 aa		11.35	□□□□□ -0.59
DCC-211	ENST00000579941	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
DCC-211	ENST00000579941	GRIN2A	Q12879	1464 aa		11.33	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	POLA2	Q14181	598 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	PBRM1	Q86U86	1689 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		11.32	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	IQGAP2	Q13576	1575 aa		11.31	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	TIAM1	Q13009	1591 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	SAMD9	Q5K651	1589 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	FBLN2	P98095	1184 aa		11.3	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		11.27	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		11.27	□□□□□ -0.6
DCC-211	ENST00000579941	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
DCC-211	ENST00000579941	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		11.27	□□□□□ -0.61
DCC-211	ENST00000579941	NUP160	Q12769	1436 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DCC-211	ENST00000579941	JPH4	Q96JJ6	628 aa		11.26	□□□□□ -0.61
DCC-211	ENST00000579941	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
DCC-211	ENST00000579941	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61
DCC-211	ENST00000579941	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61
DCC-211	ENST00000579941	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
DCC-211	ENST00000579941	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		11.23	□□□□□ -0.61
DCC-211	ENST00000579941	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DCC-211	ENST00000579941	LHX8	Q68G74	356 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DCC-211	ENST00000579941	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DCC-211	ENST00000579941	EVX2	Q03828	476 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DCC-211	ENST00000579941	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
DCC-211	ENST00000579941	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DCC-211	ENST00000579941	DISP1	Q96F81	1524 aa		11.19	□□□□□ -0.62
DCC-211	ENST00000579941	HECW1	Q76N89	1606 aa		11.18	□□□□□ -0.62
DCC-211	ENST00000579941	PITPNM1	O00562	1244 aa		11.17	□□□□□ -0.62
DCC-211	ENST00000579941	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62

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