RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577001.1

PRPF8-216, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, human

TSL 5

Gene PRPF8, Length 3,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRPF8-216	ENST00000577001	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		21.2	■□□□□ 0.99
PRPF8-216	ENST00000577001	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		21.19	■□□□□ 0.98
PRPF8-216	ENST00000577001	IGF1R	P08069	1367 aa		21.18	■□□□□ 0.98
PRPF8-216	ENST00000577001	TOP2B	Q02880	1626 aa		21.17	■□□□□ 0.98
PRPF8-216	ENST00000577001	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		21.17	■□□□□ 0.98
PRPF8-216	ENST00000577001	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PRPF8-216	ENST00000577001	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PRPF8-216	ENST00000577001	CFTR	P13569	1480 aa		21.15	■□□□□ 0.98
PRPF8-216	ENST00000577001	FOXD1	Q16676	465 aa		21.13	■□□□□ 0.97
PRPF8-216	ENST00000577001	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		21.11	■□□□□ 0.97
PRPF8-216	ENST00000577001	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		21.1	■□□□□ 0.97
PRPF8-216	ENST00000577001	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	21.04	■□□□□ 0.96
PRPF8-216	ENST00000577001	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		21.04	■□□□□ 0.96
PRPF8-216	ENST00000577001	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		21.03	■□□□□ 0.96
PRPF8-216	ENST00000577001	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		21.02	■□□□□ 0.96
PRPF8-216	ENST00000577001	NES	P48681	1621 aa		21	■□□□□ 0.95
PRPF8-216	ENST00000577001	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		21	■□□□□ 0.95
PRPF8-216	ENST00000577001	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		21	■□□□□ 0.95
PRPF8-216	ENST00000577001	PRDM2	Q13029	1718 aa		21	■□□□□ 0.95
PRPF8-216	ENST00000577001	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	20.99	■□□□□ 0.95
PRPF8-216	ENST00000577001	ANP32C	O43423	234 aa		20.97	■□□□□ 0.95
PRPF8-216	ENST00000577001	WDR97	A6NE52	1622 aa		20.96	■□□□□ 0.95
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	20.95	■□□□□ 0.94
PRPF8-216	ENST00000577001	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		20.93	■□□□□ 0.94
PRPF8-216	ENST00000577001	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	20.92	■□□□□ 0.94
PRPF8-216	ENST00000577001	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		20.92	■□□□□ 0.94
PRPF8-216	ENST00000577001	TONSL	Q96HA7	1378 aa		20.92	■□□□□ 0.94
PRPF8-216	ENST00000577001	NEFL	P07196	543 aa		20.91	■□□□□ 0.94
PRPF8-216	ENST00000577001	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	20.91	■□□□□ 0.94
PRPF8-216	ENST00000577001	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		20.9	■□□□□ 0.94
PRPF8-216	ENST00000577001	MAPKBP1	O60336	1514 aa		20.88	■□□□□ 0.93
PRPF8-216	ENST00000577001	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		20.87	■□□□□ 0.93
PRPF8-216	ENST00000577001	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		20.86	■□□□□ 0.93
PRPF8-216	ENST00000577001	CCDC184	Q52MB2	194 aa		20.83	■□□□□ 0.93
PRPF8-216	ENST00000577001	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		20.83	■□□□□ 0.93
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	20.82	■□□□□ 0.92
PRPF8-216	ENST00000577001	FBLN2	P98095	1184 aa		20.81	■□□□□ 0.92
PRPF8-216	ENST00000577001	TIAM1	Q13009	1591 aa		20.77	■□□□□ 0.92
PRPF8-216	ENST00000577001	PTPRK	Q15262	1439 aa		20.75	■□□□□ 0.91
PRPF8-216	ENST00000577001	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	20.74	■□□□□ 0.91
PRPF8-216	ENST00000577001	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	20.73	■□□□□ 0.91
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	20.72	■□□□□ 0.91
PRPF8-216	ENST00000577001	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		20.69	■□□□□ 0.9
PRPF8-216	ENST00000577001	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	20.69	■□□□□ 0.9	5e-7	■■■■■ 33.2
PRPF8-216	ENST00000577001	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		20.68	■□□□□ 0.9
PRPF8-216	ENST00000577001	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	20.68	■□□□□ 0.9
PRPF8-216	ENST00000577001	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	20.68	■□□□□ 0.9
PRPF8-216	ENST00000577001	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	20.66	■□□□□ 0.9
PRPF8-216	ENST00000577001	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		20.65	■□□□□ 0.9
PRPF8-216	ENST00000577001	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	20.65	■□□□□ 0.9
PRPF8-216	ENST00000577001	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		20.64	■□□□□ 0.89
PRPF8-216	ENST00000577001	TOPBP1	Q92547	1522 aa		20.63	■□□□□ 0.89
PRPF8-216	ENST00000577001	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		20.62	■□□□□ 0.89
PRPF8-216	ENST00000577001	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		20.61	■□□□□ 0.89
PRPF8-216	ENST00000577001	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		20.6	■□□□□ 0.89
PRPF8-216	ENST00000577001	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		20.6	■□□□□ 0.89
PRPF8-216	ENST00000577001	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		20.59	■□□□□ 0.89
PRPF8-216	ENST00000577001	MRS2	Q9HD23	443 aa		20.59	■□□□□ 0.89
PRPF8-216	ENST00000577001	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		20.57	■□□□□ 0.88
PRPF8-216	ENST00000577001	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	20.56	■□□□□ 0.88
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	20.56	■□□□□ 0.88
PRPF8-216	ENST00000577001	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		20.56	■□□□□ 0.88
PRPF8-216	ENST00000577001	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		20.55	■□□□□ 0.88
PRPF8-216	ENST00000577001	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	20.54	■□□□□ 0.88
PRPF8-216	ENST00000577001	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		20.54	■□□□□ 0.88
PRPF8-216	ENST00000577001	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		20.53	■□□□□ 0.88
PRPF8-216	ENST00000577001	NCOA2	Q15596	1464 aa		20.51	■□□□□ 0.87
PRPF8-216	ENST00000577001	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PRPF8-216	ENST00000577001	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		20.48	■□□□□ 0.87
PRPF8-216	ENST00000577001	NAIP	Q13075	1403 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PRPF8-216	ENST00000577001	CCER2	I3L3R5	266 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PRPF8-216	ENST00000577001	FMN1	Q68DA7	1419 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PRPF8-216	ENST00000577001	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	20.43	■□□□□ 0.86
PRPF8-216	ENST00000577001	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PRPF8-216	ENST00000577001	MSH5	O43196	834 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PRPF8-216	ENST00000577001	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		20.41	■□□□□ 0.86
PRPF8-216	ENST00000577001	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		20.4	■□□□□ 0.86
PRPF8-216	ENST00000577001	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	20.4	■□□□□ 0.86
PRPF8-216	ENST00000577001	UACA	Q9BZF9	1416 aa		20.39	■□□□□ 0.86
PRPF8-216	ENST00000577001	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		20.39	■□□□□ 0.85
PRPF8-216	ENST00000577001	MYT1	Q01538	1121 aa		20.39	■□□□□ 0.85
PRPF8-216	ENST00000577001	RGL3	Q3MIN7	710 aa		20.38	■□□□□ 0.85
PRPF8-216	ENST00000577001	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	20.36	■□□□□ 0.85	1e-7	■■□□□ 11.7
PRPF8-216	ENST00000577001	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		20.36	■□□□□ 0.85
PRPF8-216	ENST00000577001	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	20.35	■□□□□ 0.85
PRPF8-216	ENST00000577001	HFM1	A2PYH4	1435 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PRPF8-216	ENST00000577001	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	20.35	■□□□□ 0.85
PRPF8-216	ENST00000577001	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		20.33	■□□□□ 0.85
PRPF8-216	ENST00000577001	KDM6B	O15054	1643 aa		20.33	■□□□□ 0.84
PRPF8-216	ENST00000577001	PKD2	Q13563	968 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PRPF8-216	ENST00000577001	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PRPF8-216	ENST00000577001	NBR1	Q14596	966 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PRPF8-216	ENST00000577001	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PRPF8-216	ENST00000577001	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	20.3	■□□□□ 0.84
PRPF8-216	ENST00000577001	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PRPF8-216	ENST00000577001	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		20.29	■□□□□ 0.84
PRPF8-216	ENST00000577001	CUL7	Q14999	1698 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PRPF8-216	ENST00000577001	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		20.28	■□□□□ 0.84
PRPF8-216	ENST00000577001	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	20.27	■□□□□ 0.84
PRPF8-216	ENST00000577001	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	20.27	■□□□□ 0.84

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