RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568955.1

RPL23AP97-201, Transcript of ribosomal protein L23a pseudogene 97, humanhuman

BASIC

Gene RPL23AP97, Length 471 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP97-201ENST00000568955 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.03□□□□□ -1.28
RPL23AP97-201ENST00000568955 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.02□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 IFT140Q96RY7 1462 aa7.02□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 CLIP1P30622 1438 aa7.01□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.01□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 ZBTB22O15209 634 aa7□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 GAPVD1Q14C86 1478 aa6.99□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 ARAP1Q96P48 1450 aa6.98□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.97□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 ADAMTS12P58397 1594 aa6.97□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 GRIN2BQ13224 1484 aa6.97□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.97□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 PBRM1Q86U86 1689 aa6.96□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 MAP3K1Q13233 1512 aa6.96□□□□□ -1.29
RPL23AP97-201ENST00000568955 FHAD1B1AJZ9 1412 aa6.96□□□□□ -1.3
RPL23AP97-201ENST00000568955 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.96□□□□□ -1.3
RPL23AP97-201ENST00000568955 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
RPL23AP97-201ENST00000568955 ERCC6Q03468 1493 aa6.94□□□□□ -1.3
RPL23AP97-201ENST00000568955 SAMD9Q5K651 1589 aa6.94□□□□□ -1.3
RPL23AP97-201ENST00000568955 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RPL23AP97-201ENST00000568955 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RPL23AP97-201ENST00000568955 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RPL23AP97-201ENST00000568955 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RPL23AP97-201ENST00000568955 UGGT2Q9NYU1 1516 aa6.9□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.89□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa6.88□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 SYNJ2O15056 1496 aa6.88□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 FYCO1Q9BQS8 1478 aa6.88□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.87□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 IQGAP2Q13576 1575 aa6.87□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 GRIN2AQ12879 1464 aa6.87□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa6.87□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 NUP160Q12769 1436 aa6.87□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa6.87□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.87□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 TIAM1Q13009 1591 aa6.86□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 FMN1Q68DA7 1419 aa6.86□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 SLC4A2P04920 1241 aa6.85□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RPL23AP97-201ENST00000568955 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 HRCP23327 699 aa6.83□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.83□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 CEP170Q5SW79 1584 aa6.82□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 DISP1Q96F81 1524 aa6.82□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.82□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 KIAA0556O60303 1618 aa6.82□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.8□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 ARHGEF11O15085 1522 aa6.8□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 HECW1Q76N89 1606 aa6.79□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 APLP2Q06481 763 aa6.79□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 SHROOM2Q13796 1616 aa6.79□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa6.78□□□□□ -1.32
RPL23AP97-201ENST00000568955 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.77□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.75□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa6.75□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 ABCA8O94911 1581 aa6.74□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.74□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.74□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 CHD1O14646 1710 aa6.73□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.73□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.72□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 ADCY10Q96PN6 1610 aa6.72□□□□□ -1.33
RPL23AP97-201ENST00000568955 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.71□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 MIA2Q96PC5 1412 aa6.71□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 JPH4Q96JJ6 628 aa6.71□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 NCOA2Q15596 1464 aa6.71□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.71□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.7□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 AKNAQ7Z591 1439 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 P3H3Q8IVL6 736 aa6.69□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa6.67□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 PLB1Q6P1J6 1458 aa6.66□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.65□□□□□ -1.34
RPL23AP97-201ENST00000568955 PTPRGP23470 1445 aa6.65□□□□□ -1.35
RPL23AP97-201ENST00000568955 ATP10BO94823 1461 aa6.65□□□□□ -1.35
RPL23AP97-201ENST00000568955 ABCC10Q5T3U5 1492 aa6.65□□□□□ -1.35
RPL23AP97-201ENST00000568955 ABCC2Q92887 1545 aa6.65□□□□□ -1.35
RPL23AP97-201ENST00000568955 ITSN2Q9NZM3 1697 aa6.65□□□□□ -1.35
RPL23AP97-201ENST00000568955 HFM1A2PYH4 1435 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms