RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 MYT1Q01538 1121 aa18.13■□□□□ 0.49
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.02■□□□□ 0.48
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.46
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 SAMD9Q5K651 1589 aa17.79■□□□□ 0.44
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 NCOA2Q15596 1464 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GRIN2BQ13224 1484 aa17.76■□□□□ 0.43
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 UACAQ9BZF9 1416 aa17.66■□□□□ 0.42
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 UGGT2Q9NYU1 1516 aa17.62■□□□□ 0.41
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP17.61■□□□□ 0.41
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HECW1Q76N89 1606 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARHGEF11O15085 1522 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IFT140Q96RY7 1462 aa17.56■□□□□ 0.4
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MPHOSPH9Q99550 1183 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ERCC6Q03468 1493 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MIA2Q96PC5 1412 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DISP1Q96F81 1524 aa17.47■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KDM6BO15054 1643 aa17.46■□□□□ 0.39
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GRIN2AQ12879 1464 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KIAA0556O60303 1618 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCER2I3L3R5 266 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AKNAQ7Z591 1439 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DAPK1P53355 1430 aa17.41■□□□□ 0.38
HOXC-AS3-204ENST00000567780 L3MBTL2Q969R5 705 aa17.41■□□□□ 0.38
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