RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562205.1

RNPS1-206, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 2,223 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-206ENST00000562205 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RNPS1-206ENST00000562205 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.41■■□□□ 1.34
RNPS1-206ENST00000562205 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.4■■□□□ 1.34
RNPS1-206ENST00000562205 TOPBP1Q92547 1522 aa23.4■■□□□ 1.34
RNPS1-206ENST00000562205 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
RNPS1-206ENST00000562205 NESP48681 1621 aa23.4■■□□□ 1.34
RNPS1-206ENST00000562205 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.4■■□□□ 1.34
RNPS1-206ENST00000562205 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.39■■□□□ 1.33
RNPS1-206ENST00000562205 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.38■■□□□ 1.33
RNPS1-206ENST00000562205 P3H3Q8IVL6 736 aa23.38■■□□□ 1.33
RNPS1-206ENST00000562205 MAPKBP1O60336 1514 aa23.35■■□□□ 1.33
RNPS1-206ENST00000562205 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.34■■□□□ 1.33
RNPS1-206ENST00000562205 CUL7Q14999 1698 aa23.3■■□□□ 1.32
RNPS1-206ENST00000562205 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.29■■□□□ 1.32
RNPS1-206ENST00000562205 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.28■■□□□ 1.32
RNPS1-206ENST00000562205 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.27■■□□□ 1.32
RNPS1-206ENST00000562205 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.26■■□□□ 1.31
RNPS1-206ENST00000562205 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
RNPS1-206ENST00000562205 WDR97A6NE52 1622 aa23.25■■□□□ 1.31
RNPS1-206ENST00000562205 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
RNPS1-206ENST00000562205 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
RNPS1-206ENST00000562205 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.23■■□□□ 1.31
RNPS1-206ENST00000562205 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.312e-6■■■□□ 18.3
RNPS1-206ENST00000562205 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.18■■□□□ 1.3
RNPS1-206ENST00000562205 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-206ENST00000562205 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.14■■□□□ 1.3
RNPS1-206ENST00000562205 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-206ENST00000562205 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-206ENST00000562205 FMN1Q68DA7 1419 aa23.11■■□□□ 1.29
RNPS1-206ENST00000562205 SAMD9Q5K651 1589 aa23.09■■□□□ 1.29
RNPS1-206ENST00000562205 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.09■■□□□ 1.29
RNPS1-206ENST00000562205 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
RNPS1-206ENST00000562205 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.06■■□□□ 1.28
RNPS1-206ENST00000562205 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.06■■□□□ 1.28
RNPS1-206ENST00000562205 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.03■■□□□ 1.28
RNPS1-206ENST00000562205 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.02■■□□□ 1.28
RNPS1-206ENST00000562205 GRIN2BQ13224 1484 aa23■■□□□ 1.27
RNPS1-206ENST00000562205 MTUS2Q5JR59 1369 aa23■■□□□ 1.27
RNPS1-206ENST00000562205 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23■■□□□ 1.27
RNPS1-206ENST00000562205 PTPRKQ15262 1439 aa22.97■■□□□ 1.27
RNPS1-206ENST00000562205 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
RNPS1-206ENST00000562205 NCOA2Q15596 1464 aa22.94■■□□□ 1.26
RNPS1-206ENST00000562205 KCNH8Q96L42 1107 aa22.94■■□□□ 1.26
RNPS1-206ENST00000562205 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.93■■□□□ 1.26
RNPS1-206ENST00000562205 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
RNPS1-206ENST00000562205 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.93■■□□□ 1.26
RNPS1-206ENST00000562205 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.92■■□□□ 1.26
RNPS1-206ENST00000562205 HFM1A2PYH4 1435 aa22.91■■□□□ 1.26
RNPS1-206ENST00000562205 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.91■■□□□ 1.26
RNPS1-206ENST00000562205 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
RNPS1-206ENST00000562205 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
RNPS1-206ENST00000562205 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.89■■□□□ 1.25
RNPS1-206ENST00000562205 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RNPS1-206ENST00000562205 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.88■■□□□ 1.25
RNPS1-206ENST00000562205 PBRM1Q86U86 1689 aa22.86■■□□□ 1.25
RNPS1-206ENST00000562205 UACAQ9BZF9 1416 aa22.85■■□□□ 1.25
RNPS1-206ENST00000562205 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.85■■□□□ 1.25
RNPS1-206ENST00000562205 NAIPQ13075 1403 aa22.85■■□□□ 1.25
RNPS1-206ENST00000562205 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RNPS1-206ENST00000562205 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RNPS1-206ENST00000562205 ARHGEF11O15085 1522 aa22.84■■□□□ 1.25
RNPS1-206ENST00000562205 TONSLQ96HA7 1378 aa22.78■■□□□ 1.24
RNPS1-206ENST00000562205 ADAMTS12P58397 1594 aa22.77■■□□□ 1.24
RNPS1-206ENST00000562205 IQGAP2Q13576 1575 aa22.77■■□□□ 1.24
RNPS1-206ENST00000562205 HECW1Q76N89 1606 aa22.77■■□□□ 1.24
RNPS1-206ENST00000562205 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RNPS1-206ENST00000562205 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
RNPS1-206ENST00000562205 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.71■■□□□ 1.23
RNPS1-206ENST00000562205 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RNPS1-206ENST00000562205 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.7■■□□□ 1.22
RNPS1-206ENST00000562205 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.69■■□□□ 1.22
RNPS1-206ENST00000562205 WDR62O43379 1518 aa22.69■■□□□ 1.22
RNPS1-206ENST00000562205 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.68■■□□□ 1.22
RNPS1-206ENST00000562205 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.67■■□□□ 1.22
RNPS1-206ENST00000562205 KDM6BO15054 1643 aa22.67■■□□□ 1.22
RNPS1-206ENST00000562205 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
RNPS1-206ENST00000562205 ARID3CA6NKF2 412 aa22.63■■□□□ 1.21
RNPS1-206ENST00000562205 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
RNPS1-206ENST00000562205 ANP32CO43423 234 aa22.61■■□□□ 1.21
RNPS1-206ENST00000562205 AKNAQ7Z591 1439 aa22.61■■□□□ 1.21
RNPS1-206ENST00000562205 CCER2I3L3R5 266 aa22.6■■□□□ 1.21
RNPS1-206ENST00000562205 MIA2Q96PC5 1412 aa22.6■■□□□ 1.21
RNPS1-206ENST00000562205 TRIM52Q96A61 297 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-206ENST00000562205 IFT140Q96RY7 1462 aa22.55■■□□□ 1.2
RNPS1-206ENST00000562205 KIAA0556O60303 1618 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-206ENST00000562205 DISP1Q96F81 1524 aa22.54■■□□□ 1.2
RNPS1-206ENST00000562205 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.51■■□□□ 1.19
RNPS1-206ENST00000562205 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
RNPS1-206ENST00000562205 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.49■■□□□ 1.19
RNPS1-206ENST00000562205 DAPK1P53355 1430 aa22.48■■□□□ 1.19
RNPS1-206ENST00000562205 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RNPS1-206ENST00000562205 FOXD1Q16676 465 aa22.46■■□□□ 1.19
RNPS1-206ENST00000562205 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.46■■□□□ 1.19
RNPS1-206ENST00000562205 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RNPS1-206ENST00000562205 FKBP8Q14318 412 aa22.46■■□□□ 1.19
RNPS1-206ENST00000562205 BCANQ96GW7 911 aa22.46■■□□□ 1.19
RNPS1-206ENST00000562205 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RNPS1-206ENST00000562205 GRIN2AQ12879 1464 aa22.45■■□□□ 1.18
RNPS1-206ENST00000562205 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.45■■□□□ 1.18
RNPS1-206ENST00000562205 ABCC5O15440 1437 aa22.44■■□□□ 1.18
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