RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557444.5

AFG3L1P-217, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, humanhuman

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Gene AFG3L1P, Length 2,447 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L1P-217ENST00000557444 TOPBP1Q92547 1522 aa29.41■■■□□ 2.3
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.36■■■□□ 2.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa29.34■■■□□ 2.29
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAP3K1Q13233 1512 aa29.32■■■□□ 2.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.31■■■□□ 2.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.31■■■□□ 2.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.28■■■□□ 2.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.28■■■□□ 2.28
AFG3L1P-217ENST00000557444 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.22■■■□□ 2.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
AFG3L1P-217ENST00000557444 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.2■■■□□ 2.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 CUL7Q14999 1698 aa29.16■■■□□ 2.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAPKBP1O60336 1514 aa29.14■■■□□ 2.26
AFG3L1P-217ENST00000557444 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.13■■■□□ 2.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.12■■■□□ 2.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.12■■■□□ 2.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.1■■■□□ 2.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.1■■■□□ 2.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 WDR97A6NE52 1622 aa29.1■■■□□ 2.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.08■■■□□ 2.25
AFG3L1P-217ENST00000557444 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.01■■■□□ 2.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.232e-8■■■■□ 23.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 GAPVD1Q14C86 1478 aa29■■■□□ 2.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 SIN3AQ96ST3 1273 aa29■■■□□ 2.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.97■■■□□ 2.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 FMN1Q68DA7 1419 aa28.96■■■□□ 2.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.96■■■□□ 2.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.95■■■□□ 2.23
AFG3L1P-217ENST00000557444 SAMD9Q5K651 1589 aa28.89■■■□□ 2.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.88■■■□□ 2.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.88■■■□□ 2.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.87■■■□□ 2.21
AFG3L1P-217ENST00000557444 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 GRIN2BQ13224 1484 aa28.79■■■□□ 2.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPRKQ15262 1439 aa28.79■■■□□ 2.2
AFG3L1P-217ENST00000557444 NCOA2Q15596 1464 aa28.75■■■□□ 2.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 KCNH8Q96L42 1107 aa28.7■■■□□ 2.19
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.69■■■□□ 2.18
AFG3L1P-217ENST00000557444 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
AFG3L1P-217ENST00000557444 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.68■■■□□ 2.18
AFG3L1P-217ENST00000557444 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa28.67■■■□□ 2.18
AFG3L1P-217ENST00000557444 PBRM1Q86U86 1689 aa28.66■■■□□ 2.18
AFG3L1P-217ENST00000557444 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
AFG3L1P-217ENST00000557444 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
AFG3L1P-217ENST00000557444 HFM1A2PYH4 1435 aa28.64■■■□□ 2.18
AFG3L1P-217ENST00000557444 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
AFG3L1P-217ENST00000557444 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
AFG3L1P-217ENST00000557444 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.63■■■□□ 2.17
AFG3L1P-217ENST00000557444 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.62■■■□□ 2.17
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARID3CA6NKF2 412 aa28.61■■■□□ 2.17
AFG3L1P-217ENST00000557444 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.61■■■□□ 2.17
AFG3L1P-217ENST00000557444 NAIPQ13075 1403 aa28.6■■■□□ 2.17
AFG3L1P-217ENST00000557444 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.58■■■□□ 2.17
AFG3L1P-217ENST00000557444 IQGAP2Q13576 1575 aa28.57■■■□□ 2.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 UACAQ9BZF9 1416 aa28.56■■■□□ 2.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 ADAMTS12P58397 1594 aa28.56■■■□□ 2.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.54■■■□□ 2.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.54■■■□□ 2.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 ARHGEF11O15085 1522 aa28.53■■■□□ 2.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.53■■■□□ 2.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 TONSLQ96HA7 1378 aa28.53■■■□□ 2.16
AFG3L1P-217ENST00000557444 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 HECW1Q76N89 1606 aa28.49■■■□□ 2.15
AFG3L1P-217ENST00000557444 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 WDR62O43379 1518 aa28.41■■■□□ 2.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
AFG3L1P-217ENST00000557444 KDM6BO15054 1643 aa28.37■■■□□ 2.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 TRIM52Q96A61 297 aa28.35■■■□□ 2.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 IFT140Q96RY7 1462 aa28.35■■■□□ 2.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
AFG3L1P-217ENST00000557444 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.32■■■□□ 2.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.31■■■□□ 2.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 DISP1Q96F81 1524 aa28.3■■■□□ 2.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 MIA2Q96PC5 1412 aa28.28■■■□□ 2.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIAA0556O60303 1618 aa28.27■■■□□ 2.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.27■■■□□ 2.12
AFG3L1P-217ENST00000557444 FOXD1Q16676 465 aa28.26■■■□□ 2.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 ANP32CO43423 234 aa28.25■■■□□ 2.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 GRIN2AQ12879 1464 aa28.22■■■□□ 2.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.22■■■□□ 2.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 AKNAQ7Z591 1439 aa28.21■■■□□ 2.11
AFG3L1P-217ENST00000557444 CCER2I3L3R5 266 aa28.16■■■□□ 2.1
AFG3L1P-217ENST00000557444 DAPK1P53355 1430 aa28.16■■■□□ 2.1
AFG3L1P-217ENST00000557444 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa28.15■■■□□ 2.1
AFG3L1P-217ENST00000557444 ABCC5O15440 1437 aa28.13■■■□□ 2.09
AFG3L1P-217ENST00000557444 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
AFG3L1P-217ENST00000557444 FBLN2P98095 1184 aa28.12■■■□□ 2.09
AFG3L1P-217ENST00000557444 ERCC6Q03468 1493 aa28.11■■■□□ 2.09
AFG3L1P-217ENST00000557444 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
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