RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542322.5

GRAMD2B-218, Transcript of GRAM domain containing 2B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GRAMD2B, Length 2,977 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD2B-218ENST00000542322 PRDM2Q13029 1718 aa26.32■■□□□ 1.8
GRAMD2B-218ENST00000542322 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.32■■□□□ 1.8
GRAMD2B-218ENST00000542322 TOPBP1Q92547 1522 aa26.31■■□□□ 1.8
GRAMD2B-218ENST00000542322 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.22■■□□□ 1.79
GRAMD2B-218ENST00000542322 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.19■■□□□ 1.78
GRAMD2B-218ENST00000542322 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
GRAMD2B-218ENST00000542322 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.18■■□□□ 1.78
GRAMD2B-218ENST00000542322 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.17■■□□□ 1.78
GRAMD2B-218ENST00000542322 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
GRAMD2B-218ENST00000542322 TIAM1Q13009 1591 aa26.13■■□□□ 1.77
GRAMD2B-218ENST00000542322 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD2B-218ENST00000542322 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.11■■□□□ 1.77
GRAMD2B-218ENST00000542322 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
GRAMD2B-218ENST00000542322 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
GRAMD2B-218ENST00000542322 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.09■■□□□ 1.77
GRAMD2B-218ENST00000542322 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.03■■□□□ 1.76
GRAMD2B-218ENST00000542322 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.03■■□□□ 1.76
GRAMD2B-218ENST00000542322 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.02■■□□□ 1.76
GRAMD2B-218ENST00000542322 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.99■■□□□ 1.75
GRAMD2B-218ENST00000542322 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
GRAMD2B-218ENST00000542322 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.96■■□□□ 1.75
GRAMD2B-218ENST00000542322 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.94■■□□□ 1.74
GRAMD2B-218ENST00000542322 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.94■■□□□ 1.74
GRAMD2B-218ENST00000542322 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.93■■□□□ 1.74
GRAMD2B-218ENST00000542322 FBLN2P98095 1184 aa25.92■■□□□ 1.74
GRAMD2B-218ENST00000542322 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.87■■□□□ 1.73
GRAMD2B-218ENST00000542322 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.86■■□□□ 1.73
GRAMD2B-218ENST00000542322 FMN1Q68DA7 1419 aa25.85■■□□□ 1.73
GRAMD2B-218ENST00000542322 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
GRAMD2B-218ENST00000542322 CUL7Q14999 1698 aa25.83■■□□□ 1.73
GRAMD2B-218ENST00000542322 KCNH8Q96L42 1107 aa25.83■■□□□ 1.72
GRAMD2B-218ENST00000542322 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.82■■□□□ 1.72
GRAMD2B-218ENST00000542322 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.8■■□□□ 1.72
GRAMD2B-218ENST00000542322 MAPKBP1O60336 1514 aa25.8■■□□□ 1.72
GRAMD2B-218ENST00000542322 TRIM52Q96A61 297 aa25.78■■□□□ 1.72
GRAMD2B-218ENST00000542322 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.76■■□□□ 1.71
GRAMD2B-218ENST00000542322 MAP3K1Q13233 1512 aa25.76■■□□□ 1.71
GRAMD2B-218ENST00000542322 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.76■■□□□ 1.71
GRAMD2B-218ENST00000542322 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.75■■□□□ 1.71
GRAMD2B-218ENST00000542322 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.73■■□□□ 1.71
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
GRAMD2B-218ENST00000542322 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.71■■□□□ 1.71
GRAMD2B-218ENST00000542322 PTPRKQ15262 1439 aa25.7■■□□□ 1.7
GRAMD2B-218ENST00000542322 WDR97A6NE52 1622 aa25.69■■□□□ 1.7
GRAMD2B-218ENST00000542322 NCOA2Q15596 1464 aa25.68■■□□□ 1.7
GRAMD2B-218ENST00000542322 FOXD1Q16676 465 aa25.66■■□□□ 1.7
GRAMD2B-218ENST00000542322 TONSLQ96HA7 1378 aa25.63■■□□□ 1.69
GRAMD2B-218ENST00000542322 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
GRAMD2B-218ENST00000542322 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
GRAMD2B-218ENST00000542322 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.61■■□□□ 1.69
GRAMD2B-218ENST00000542322 ERCC6Q03468 1493 aa25.6■■□□□ 1.69
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
GRAMD2B-218ENST00000542322 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
GRAMD2B-218ENST00000542322 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.58■■□□□ 1.69
GRAMD2B-218ENST00000542322 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.58■■□□□ 1.69
GRAMD2B-218ENST00000542322 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.57■■□□□ 1.68
GRAMD2B-218ENST00000542322 GRIN2BQ13224 1484 aa25.57■■□□□ 1.68
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
GRAMD2B-218ENST00000542322 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
GRAMD2B-218ENST00000542322 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.55■■□□□ 1.68
GRAMD2B-218ENST00000542322 SAMD9Q5K651 1589 aa25.54■■□□□ 1.68
GRAMD2B-218ENST00000542322 PBRM1Q86U86 1689 aa25.5■■□□□ 1.67
GRAMD2B-218ENST00000542322 IQGAP2Q13576 1575 aa25.49■■□□□ 1.67
GRAMD2B-218ENST00000542322 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
GRAMD2B-218ENST00000542322 NAIPQ13075 1403 aa25.47■■□□□ 1.67
GRAMD2B-218ENST00000542322 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
GRAMD2B-218ENST00000542322 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
GRAMD2B-218ENST00000542322 BCANQ96GW7 911 aa25.43■■□□□ 1.66
GRAMD2B-218ENST00000542322 ADAMTS12P58397 1594 aa25.42■■□□□ 1.66
GRAMD2B-218ENST00000542322 HFM1A2PYH4 1435 aa25.42■■□□□ 1.66
GRAMD2B-218ENST00000542322 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.42■■□□□ 1.66
GRAMD2B-218ENST00000542322 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.41■■□□□ 1.66
GRAMD2B-218ENST00000542322 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
GRAMD2B-218ENST00000542322 UACAQ9BZF9 1416 aa25.39■■□□□ 1.65
GRAMD2B-218ENST00000542322 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
GRAMD2B-218ENST00000542322 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
GRAMD2B-218ENST00000542322 IFT140Q96RY7 1462 aa25.35■■□□□ 1.65
GRAMD2B-218ENST00000542322 ANP32CO43423 234 aa25.35■■□□□ 1.65
GRAMD2B-218ENST00000542322 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.35■■□□□ 1.65
GRAMD2B-218ENST00000542322 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.34■■□□□ 1.65
GRAMD2B-218ENST00000542322 HECW1Q76N89 1606 aa25.34■■□□□ 1.65
GRAMD2B-218ENST00000542322 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.32■■□□□ 1.64
GRAMD2B-218ENST00000542322 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
GRAMD2B-218ENST00000542322 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
GRAMD2B-218ENST00000542322 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
GRAMD2B-218ENST00000542322 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
GRAMD2B-218ENST00000542322 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
GRAMD2B-218ENST00000542322 KDM6BO15054 1643 aa25.29■■□□□ 1.64
GRAMD2B-218ENST00000542322 JPH4Q96JJ6 628 aa25.28■■□□□ 1.64
GRAMD2B-218ENST00000542322 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD2B-218ENST00000542322 GRIN2AQ12879 1464 aa25.27■■□□□ 1.64
GRAMD2B-218ENST00000542322 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
GRAMD2B-218ENST00000542322 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD2B-218ENST00000542322 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
GRAMD2B-218ENST00000542322 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.26■■□□□ 1.63
GRAMD2B-218ENST00000542322 WDR62O43379 1518 aa25.25■■□□□ 1.63
GRAMD2B-218ENST00000542322 DISP1Q96F81 1524 aa25.24■■□□□ 1.63
GRAMD2B-218ENST00000542322 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.24■■□□□ 1.63
GRAMD2B-218ENST00000542322 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
GRAMD2B-218ENST00000542322 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms