RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542167.2

PUS1-208, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PUS1, Length 2,151 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-208ENST00000542167 PRXQ9BXM0 1461 aa24.26■■□□□ 1.47
PUS1-208ENST00000542167 WDR97A6NE52 1622 aa24.23■■□□□ 1.47
PUS1-208ENST00000542167 WDR62O43379 1518 aa24.22■■□□□ 1.47
PUS1-208ENST00000542167 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PUS1-208ENST00000542167 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
PUS1-208ENST00000542167 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PUS1-208ENST00000542167 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
PUS1-208ENST00000542167 IGF1RP08069 1367 aa24.15■■□□□ 1.46
PUS1-208ENST00000542167 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PUS1-208ENST00000542167 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PUS1-208ENST00000542167 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.09■■□□□ 1.45
PUS1-208ENST00000542167 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PUS1-208ENST00000542167 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.04■■□□□ 1.44
PUS1-208ENST00000542167 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.04■■□□□ 1.44
PUS1-208ENST00000542167 IFT140Q96RY7 1462 aa24.03■■□□□ 1.44
PUS1-208ENST00000542167 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.02■■□□□ 1.43
PUS1-208ENST00000542167 CUL7Q14999 1698 aa24■■□□□ 1.43
PUS1-208ENST00000542167 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.99■■□□□ 1.43
PUS1-208ENST00000542167 PBRM1Q86U86 1689 aa23.95■■□□□ 1.43
PUS1-208ENST00000542167 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.95■■□□□ 1.429e-7■■■■■ 27.5
PUS1-208ENST00000542167 MAPKBP1O60336 1514 aa23.95■■□□□ 1.42
PUS1-208ENST00000542167 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PUS1-208ENST00000542167 MAP3K1Q13233 1512 aa23.86■■□□□ 1.41
PUS1-208ENST00000542167 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.86■■□□□ 1.41
PUS1-208ENST00000542167 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PUS1-208ENST00000542167 TIAM1Q13009 1591 aa23.86■■□□□ 1.41
PUS1-208ENST00000542167 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.86■■□□□ 1.41
PUS1-208ENST00000542167 GRIN2BQ13224 1484 aa23.85■■□□□ 1.41
PUS1-208ENST00000542167 ADAMTS12P58397 1594 aa23.79■■□□□ 1.4
PUS1-208ENST00000542167 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.77■■□□□ 1.4
PUS1-208ENST00000542167 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.77■■□□□ 1.39
PUS1-208ENST00000542167 KCNH8Q96L42 1107 aa23.76■■□□□ 1.39
PUS1-208ENST00000542167 ITGAEP38570 1179 aa23.75■■□□□ 1.39
PUS1-208ENST00000542167 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.74■■□□□ 1.39
PUS1-208ENST00000542167 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.73■■□□□ 1.39
PUS1-208ENST00000542167 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.72■■□□□ 1.39
PUS1-208ENST00000542167 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.72■■□□□ 1.39
PUS1-208ENST00000542167 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.66■■□□□ 1.38
PUS1-208ENST00000542167 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
PUS1-208ENST00000542167 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.63■■□□□ 1.37
PUS1-208ENST00000542167 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PUS1-208ENST00000542167 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PUS1-208ENST00000542167 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.36
PUS1-208ENST00000542167 GRIN2AQ12879 1464 aa23.57■■□□□ 1.36
PUS1-208ENST00000542167 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PUS1-208ENST00000542167 SYNJ2O15056 1496 aa23.56■■□□□ 1.36
PUS1-208ENST00000542167 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.56■■□□□ 1.36
PUS1-208ENST00000542167 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.54■■□□□ 1.36
PUS1-208ENST00000542167 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.54■■□□□ 1.36
PUS1-208ENST00000542167 FKBP8Q14318 412 aa23.53■■□□□ 1.36
PUS1-208ENST00000542167 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
PUS1-208ENST00000542167 BCANQ96GW7 911 aa23.52■■□□□ 1.36
PUS1-208ENST00000542167 P3H3Q8IVL6 736 aa23.52■■□□□ 1.36
PUS1-208ENST00000542167 IQGAP2Q13576 1575 aa23.51■■□□□ 1.35
PUS1-208ENST00000542167 FBLN2P98095 1184 aa23.5■■□□□ 1.35
PUS1-208ENST00000542167 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PUS1-208ENST00000542167 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.48■■□□□ 1.35
PUS1-208ENST00000542167 CCER2I3L3R5 266 aa23.48■■□□□ 1.35
PUS1-208ENST00000542167 SAMD9Q5K651 1589 aa23.48■■□□□ 1.35
PUS1-208ENST00000542167 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
PUS1-208ENST00000542167 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.46■■□□□ 1.35
PUS1-208ENST00000542167 CEP170Q5SW79 1584 aa23.44■■□□□ 1.34
PUS1-208ENST00000542167 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.44■■□□□ 1.34
PUS1-208ENST00000542167 NEFLP07196 543 aa23.38■■□□□ 1.33
PUS1-208ENST00000542167 CHD1O14646 1710 aa23.38■■□□□ 1.33
PUS1-208ENST00000542167 NUP160Q12769 1436 aa23.38■■□□□ 1.33
PUS1-208ENST00000542167 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.38■■□□□ 1.33
PUS1-208ENST00000542167 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.37■■□□□ 1.33
PUS1-208ENST00000542167 ANP32CO43423 234 aa23.37■■□□□ 1.33
PUS1-208ENST00000542167 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PUS1-208ENST00000542167 TRIM52Q96A61 297 aa23.34■■□□□ 1.33
PUS1-208ENST00000542167 FMN1Q68DA7 1419 aa23.33■■□□□ 1.33
PUS1-208ENST00000542167 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-208ENST00000542167 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.32■■□□□ 1.32
PUS1-208ENST00000542167 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PUS1-208ENST00000542167 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.3■■□□□ 1.32
PUS1-208ENST00000542167 TONSLQ96HA7 1378 aa23.29■■□□□ 1.32
PUS1-208ENST00000542167 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PUS1-208ENST00000542167 KIAA0556O60303 1618 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-208ENST00000542167 HFM1A2PYH4 1435 aa23.28■■□□□ 1.32
PUS1-208ENST00000542167 UACAQ9BZF9 1416 aa23.27■■□□□ 1.32
PUS1-208ENST00000542167 DISP1Q96F81 1524 aa23.27■■□□□ 1.32
PUS1-208ENST00000542167 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.26■■□□□ 1.31
PUS1-208ENST00000542167 PTPRKQ15262 1439 aa23.23■■□□□ 1.31
PUS1-208ENST00000542167 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.22■■□□□ 1.31
PUS1-208ENST00000542167 JPH4Q96JJ6 628 aa23.21■■□□□ 1.31
PUS1-208ENST00000542167 NAIPQ13075 1403 aa23.17■■□□□ 1.3
PUS1-208ENST00000542167 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.15■■□□□ 1.3
PUS1-208ENST00000542167 BCL11AQ9H165 835 aa23.14■■□□□ 1.3
PUS1-208ENST00000542167 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.12■■□□□ 1.29
PUS1-208ENST00000542167 HECW1Q76N89 1606 aa23.12■■□□□ 1.29
PUS1-208ENST00000542167 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PUS1-208ENST00000542167 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.11■■□□□ 1.29
PUS1-208ENST00000542167 NCOA2Q15596 1464 aa23.11■■□□□ 1.29
PUS1-208ENST00000542167 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
PUS1-208ENST00000542167 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-208ENST00000542167 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.08■■□□□ 1.29
PUS1-208ENST00000542167 SHROOM2Q13796 1616 aa23.08■■□□□ 1.28
PUS1-208ENST00000542167 MSH5O43196 834 aa23.07■■□□□ 1.28
PUS1-208ENST00000542167 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.06■■□□□ 1.28
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