RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533903.1

ZBED5-208, Transcript of zinc finger BED-type containing 5, human

TSL 1 (best)

Gene ZBED5, Length 3,214 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZBED5-208	ENST00000533903	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
ZBED5-208	ENST00000533903	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.68
ZBED5-208	ENST00000533903	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	10.76	□□□□□ -0.69
ZBED5-208	ENST00000533903	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ZBED5-208	ENST00000533903	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ZBED5-208	ENST00000533903	CUL7	Q14999	1698 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ZBED5-208	ENST00000533903	PBRM1	Q86U86	1689 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ZBED5-208	ENST00000533903	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ZBED5-208	ENST00000533903	IGF1R	P08069	1367 aa		10.72	□□□□□ -0.69
ZBED5-208	ENST00000533903	SYNJ2	O15056	1496 aa		10.71	□□□□□ -0.69
ZBED5-208	ENST00000533903	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ZBED5-208	ENST00000533903	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		10.69	□□□□□ -0.7
ZBED5-208	ENST00000533903	ADAMTS12	P58397	1594 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZBED5-208	ENST00000533903	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ZBED5-208	ENST00000533903	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
ZBED5-208	ENST00000533903	PLEKHG5	O94827	1062 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ZBED5-208	ENST00000533903	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZBED5-208	ENST00000533903	PRX	Q9BXM0	1461 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ZBED5-208	ENST00000533903	GRIN2A	Q12879	1464 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ZBED5-208	ENST00000533903	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZBED5-208	ENST00000533903	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ZBED5-208	ENST00000533903	KIF21B	O75037	1637 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ZBED5-208	ENST00000533903	NUP160	Q12769	1436 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ZBED5-208	ENST00000533903	FBLN2	P98095	1184 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZBED5-208	ENST00000533903	BCAN	Q96GW7	911 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZBED5-208	ENST00000533903	CHD1	O14646	1710 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ZBED5-208	ENST00000533903	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
ZBED5-208	ENST00000533903	GOLGA3	Q08378	1498 aa		10.58	□□□□□ -0.72
ZBED5-208	ENST00000533903	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ZBED5-208	ENST00000533903	ZBTB22	O15209	634 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ZBED5-208	ENST00000533903	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ZBED5-208	ENST00000533903	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	10.54	□□□□□ -0.72
ZBED5-208	ENST00000533903	CEP170	Q5SW79	1584 aa		10.52	□□□□□ -0.72
ZBED5-208	ENST00000533903	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		10.52	□□□□□ -0.73
ZBED5-208	ENST00000533903	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ZBED5-208	ENST00000533903	IQGAP2	Q13576	1575 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ZBED5-208	ENST00000533903	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
ZBED5-208	ENST00000533903	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ZBED5-208	ENST00000533903	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
ZBED5-208	ENST00000533903	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ZBED5-208	ENST00000533903	SHROOM2	Q13796	1616 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ZBED5-208	ENST00000533903	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ZBED5-208	ENST00000533903	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ZBED5-208	ENST00000533903	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
ZBED5-208	ENST00000533903	JPH4	Q96JJ6	628 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ZBED5-208	ENST00000533903	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ZBED5-208	ENST00000533903	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ZBED5-208	ENST00000533903	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ZBED5-208	ENST00000533903	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ZBED5-208	ENST00000533903	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ZBED5-208	ENST00000533903	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ZBED5-208	ENST00000533903	ARHGEF11	O15085	1522 aa		10.4	□□□□□ -0.75
ZBED5-208	ENST00000533903	SAMD9	Q5K651	1589 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ZBED5-208	ENST00000533903	KIAA0556	O60303	1618 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ZBED5-208	ENST00000533903	DISP1	Q96F81	1524 aa		10.38	□□□□□ -0.75
ZBED5-208	ENST00000533903	C14orf37	Q86TY3	774 aa		10.38	□□□□□ -0.75
ZBED5-208	ENST00000533903	PTPRG	P23470	1445 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ZBED5-208	ENST00000533903	CLIP1	P30622	1438 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ZBED5-208	ENST00000533903	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ZBED5-208	ENST00000533903	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ZBED5-208	ENST00000533903	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ZBED5-208	ENST00000533903	FMN1	Q68DA7	1419 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ZBED5-208	ENST00000533903	CEP162	Q5TB80	1403 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ZBED5-208	ENST00000533903	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZBED5-208	ENST00000533903	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ZBED5-208	ENST00000533903	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		10.32	□□□□□ -0.76
ZBED5-208	ENST00000533903	ARAP1	Q96P48	1450 aa		10.31	□□□□□ -0.76
ZBED5-208	ENST00000533903	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
ZBED5-208	ENST00000533903	UACA	Q9BZF9	1416 aa		10.3	□□□□□ -0.76
ZBED5-208	ENST00000533903	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		10.29	□□□□□ -0.76
ZBED5-208	ENST00000533903	FKBP8	Q14318	412 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZBED5-208	ENST00000533903	ABCC2	Q92887	1545 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZBED5-208	ENST00000533903	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		10.28	□□□□□ -0.76
ZBED5-208	ENST00000533903	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	10.28	□□□□□ -0.76
ZBED5-208	ENST00000533903	ABCA8	O94911	1581 aa		10.27	□□□□□ -0.76
ZBED5-208	ENST00000533903	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ZBED5-208	ENST00000533903	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ZBED5-208	ENST00000533903	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		10.26	□□□□□ -0.77
ZBED5-208	ENST00000533903	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		10.25	□□□□□ -0.77
ZBED5-208	ENST00000533903	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		10.25	□□□□□ -0.77
ZBED5-208	ENST00000533903	P3H3	Q8IVL6	736 aa		10.25	□□□□□ -0.77
ZBED5-208	ENST00000533903	HECW1	Q76N89	1606 aa		10.25	□□□□□ -0.77
ZBED5-208	ENST00000533903	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ZBED5-208	ENST00000533903	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		10.24	□□□□□ -0.77
ZBED5-208	ENST00000533903	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		10.23	□□□□□ -0.77
ZBED5-208	ENST00000533903	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
ZBED5-208	ENST00000533903	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		10.21	□□□□□ -0.77
ZBED5-208	ENST00000533903	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		10.21	□□□□□ -0.78
ZBED5-208	ENST00000533903	MAP3K1	Q13233	1512 aa		10.21	□□□□□ -0.78
ZBED5-208	ENST00000533903	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
ZBED5-208	ENST00000533903	MAPKBP1	O60336	1514 aa		10.2	□□□□□ -0.78
ZBED5-208	ENST00000533903	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
ZBED5-208	ENST00000533903	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		10.18	□□□□□ -0.78
ZBED5-208	ENST00000533903	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ZBED5-208	ENST00000533903	ATP10B	O94823	1461 aa		10.17	□□□□□ -0.78
ZBED5-208	ENST00000533903	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ZBED5-208	ENST00000533903	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
ZBED5-208	ENST00000533903	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZBED5-208	ENST00000533903	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		10.16	□□□□□ -0.78
ZBED5-208	ENST00000533903	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78

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