RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529655.5

ATG13-215, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ATG13, Length 2,566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-215ENST00000529655 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
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ATG13-215ENST00000529655 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.75■□□□□ 0.91
ATG13-215ENST00000529655 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
ATG13-215ENST00000529655 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
ATG13-215ENST00000529655 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.73■□□□□ 0.91
ATG13-215ENST00000529655 TOPBP1Q92547 1522 aa20.73■□□□□ 0.91
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ATG13-215ENST00000529655 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.62■□□□□ 0.89
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ATG13-215ENST00000529655 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.49■□□□□ 0.87
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ATG13-215ENST00000529655 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.32■□□□□ 0.84
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ATG13-215ENST00000529655 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
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ATG13-215ENST00000529655 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20■□□□□ 0.79
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ATG13-215ENST00000529655 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.94■□□□□ 0.78
ATG13-215ENST00000529655 KIAA0556O60303 1618 aa19.93■□□□□ 0.78
ATG13-215ENST00000529655 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.93■□□□□ 0.78
ATG13-215ENST00000529655 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.93■□□□□ 0.78
ATG13-215ENST00000529655 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
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ATG13-215ENST00000529655 ABCC5O15440 1437 aa19.9■□□□□ 0.78
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