RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522211.5

RIMS1-217, Transcript of regulating synaptic membrane exocytosis 1, humanhuman

TSL 2

Gene RIMS1, Length 2,285 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1-217ENST00000522211 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa8.54□□□□□ -1.04
RIMS1-217ENST00000522211 CUX1P39880 1505 aa8.53□□□□□ -1.04
RIMS1-217ENST00000522211 WDR97A6NE52 1622 aa8.53□□□□□ -1.04
RIMS1-217ENST00000522211 KIF27Q86VH2 1401 aa8.52□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 TIAM1Q13009 1591 aa8.52□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.51□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 FKBP8Q14318 412 aa8.5□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa8.49□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.49□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 CCER2I3L3R5 266 aa8.49□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 BCL11AQ9H165 835 aa8.49□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 BCANQ96GW7 911 aa8.47□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.47□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 PRDM2Q13029 1718 aa8.47□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.46□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 HMGXB3Q12766 1538 aa8.46□□□□□ -1.05
RIMS1-217ENST00000522211 ITGAEP38570 1179 aa8.46□□□□□ -1.06
RIMS1-217ENST00000522211 NEFLP07196 543 aa8.45□□□□□ -1.06
RIMS1-217ENST00000522211 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.44□□□□□ -1.06
RIMS1-217ENST00000522211 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.43□□□□□ -1.06
RIMS1-217ENST00000522211 NCAPD3P42695 1498 aa8.43□□□□□ -1.06
RIMS1-217ENST00000522211 CFTRP13569 1480 aa8.43□□□□□ -1.06
RIMS1-217ENST00000522211 IGF1RP08069 1367 aa8.41□□□□□ -1.06
RIMS1-217ENST00000522211 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
RIMS1-217ENST00000522211 ANP32CO43423 234 aa8.41□□□□□ -1.06
RIMS1-217ENST00000522211 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.4□□□□□ -1.06
RIMS1-217ENST00000522211 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
RIMS1-217ENST00000522211 TRIM52Q96A61 297 aa8.38□□□□□ -1.07
RIMS1-217ENST00000522211 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.38□□□□□ -1.07
RIMS1-217ENST00000522211 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.38□□□□□ -1.07
RIMS1-217ENST00000522211 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.37□□□□□ -1.07
RIMS1-217ENST00000522211 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RIMS1-217ENST00000522211 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RIMS1-217ENST00000522211 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
RIMS1-217ENST00000522211 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.35□□□□□ -1.07
RIMS1-217ENST00000522211 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.34□□□□□ -1.07
RIMS1-217ENST00000522211 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.34□□□□□ -1.07
RIMS1-217ENST00000522211 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.34□□□□□ -1.07
RIMS1-217ENST00000522211 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.34□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.33□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 TONSLQ96HA7 1378 aa8.33□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 UACAQ9BZF9 1416 aa8.33□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.33□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.32□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.31□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 HFM1A2PYH4 1435 aa8.31□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.31□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 PTPRKQ15262 1439 aa8.29□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.29□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 NCOA2Q15596 1464 aa8.29□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.29□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.28□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 NAIPQ13075 1403 aa8.28□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.28□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.28□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.27□□□□□ -1.08
RIMS1-217ENST00000522211 CUL7Q14999 1698 aa8.27□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.26□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.26□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 P3H3Q8IVL6 736 aa8.26□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 HECW1Q76N89 1606 aa8.26□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.26□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 FMN1Q68DA7 1419 aa8.25□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.25□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.25□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.24□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.24□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 SAMD9Q5K651 1589 aa8.24□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.24□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.23□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 ARHGEF11O15085 1522 aa8.22□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 GRIN2BQ13224 1484 aa8.22□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.22□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.22□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 CCDC184Q52MB2 194 aa8.22□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.21□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.21□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 NCOA1Q15788 1441 aa8.21□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.21□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.21□□□□□ -1.09
RIMS1-217ENST00000522211 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RIMS1-217ENST00000522211 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
RIMS1-217ENST00000522211 AKNAQ7Z591 1439 aa8.2□□□□□ -1.1
RIMS1-217ENST00000522211 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RIMS1-217ENST00000522211 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.2□□□□□ -1.1
RIMS1-217ENST00000522211 CCDC7Q96M83 1385 aa8.2□□□□□ -1.1
RIMS1-217ENST00000522211 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.19□□□□□ -1.1
RIMS1-217ENST00000522211 KDM6BO15054 1643 aa8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms