RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522042.1

MRPS27-211, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S27, humanhuman

TSL 4

Gene MRPS27, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS27-211ENST00000522042 SLC4A2P04920 1241 aa15.52■□□□□ 0.08
MRPS27-211ENST00000522042 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
MRPS27-211ENST00000522042 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.51■□□□□ 0.07
MRPS27-211ENST00000522042 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
MRPS27-211ENST00000522042 IGF1RP08069 1367 aa15.5■□□□□ 0.07
MRPS27-211ENST00000522042 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.48■□□□□ 0.07
MRPS27-211ENST00000522042 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.48■□□□□ 0.07
MRPS27-211ENST00000522042 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPS27-211ENST00000522042 DCAF8L1A6NGE4 600 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPS27-211ENST00000522042 CEP162Q5TB80 1403 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPS27-211ENST00000522042 GRIN2BQ13224 1484 aa15.4■□□□□ 0.06
MRPS27-211ENST00000522042 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
MRPS27-211ENST00000522042 PBRM1Q86U86 1689 aa15.4■□□□□ 0.06
MRPS27-211ENST00000522042 CLIP1P30622 1438 aa15.36■□□□□ 0.05
MRPS27-211ENST00000522042 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.35■□□□□ 0.05
MRPS27-211ENST00000522042 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
MRPS27-211ENST00000522042 ADAMTS12P58397 1594 aa15.32■□□□□ 0.04
MRPS27-211ENST00000522042 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.31■□□□□ 0.04
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MRPS27-211ENST00000522042 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.3■□□□□ 0.04
MRPS27-211ENST00000522042 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
MRPS27-211ENST00000522042 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.26■□□□□ 0.03
MRPS27-211ENST00000522042 VPS8Q8N3P4 1428 aa15.26■□□□□ 0.03
MRPS27-211ENST00000522042 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa15.24■□□□□ 0.03
MRPS27-211ENST00000522042 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
MRPS27-211ENST00000522042 SYNJ2O15056 1496 aa15.21■□□□□ 0.03
MRPS27-211ENST00000522042 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
MRPS27-211ENST00000522042 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa15.19■□□□□ 0.02
MRPS27-211ENST00000522042 GRIN2AQ12879 1464 aa15.18■□□□□ 0.02
MRPS27-211ENST00000522042 ARAP1Q96P48 1450 aa15.17■□□□□ 0.02
MRPS27-211ENST00000522042 IQGAP2Q13576 1575 aa15.16■□□□□ 0.02
MRPS27-211ENST00000522042 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
MRPS27-211ENST00000522042 APLP2Q06481 763 aa15.15■□□□□ 0.02
MRPS27-211ENST00000522042 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.14■□□□□ 0.01
MRPS27-211ENST00000522042 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
MRPS27-211ENST00000522042 SAMD9Q5K651 1589 aa15.12■□□□□ 0.01
MRPS27-211ENST00000522042 FMN1Q68DA7 1419 aa15.11■□□□□ 0.01
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MRPS27-211ENST00000522042 RNF39Q9H2S5 420 aa15.11■□□□□ 0.01
MRPS27-211ENST00000522042 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
MRPS27-211ENST00000522042 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.1■□□□□ 0.01
MRPS27-211ENST00000522042 NUP160Q12769 1436 aa15.09■□□□□ 0.01
MRPS27-211ENST00000522042 MAP3K1Q13233 1512 aa15.07■□□□□ 0
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MRPS27-211ENST00000522042 CEP170Q5SW79 1584 aa15.03■□□□□ -0
MRPS27-211ENST00000522042 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
MRPS27-211ENST00000522042 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.01□□□□□ -0.01
MRPS27-211ENST00000522042 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.01□□□□□ -0.01
MRPS27-211ENST00000522042 FBLN2P98095 1184 aa15.01□□□□□ -0.01
MRPS27-211ENST00000522042 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15□□□□□ -0.01
MRPS27-211ENST00000522042 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.99□□□□□ -0.01
MRPS27-211ENST00000522042 CHD1O14646 1710 aa14.99□□□□□ -0.01
MRPS27-211ENST00000522042 KIAA0556O60303 1618 aa14.99□□□□□ -0.01
MRPS27-211ENST00000522042 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
MRPS27-211ENST00000522042 TIAM1Q13009 1591 aa14.96□□□□□ -0.01
MRPS27-211ENST00000522042 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.96□□□□□ -0.01
MRPS27-211ENST00000522042 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.95□□□□□ -0.02
MRPS27-211ENST00000522042 DISP1Q96F81 1524 aa14.94□□□□□ -0.02
MRPS27-211ENST00000522042 HECW1Q76N89 1606 aa14.94□□□□□ -0.02
MRPS27-211ENST00000522042 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.94□□□□□ -0.02
MRPS27-211ENST00000522042 P3H3Q8IVL6 736 aa14.93□□□□□ -0.02
MRPS27-211ENST00000522042 JPH4Q96JJ6 628 aa14.91□□□□□ -0.02
MRPS27-211ENST00000522042 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
MRPS27-211ENST00000522042 SHROOM2Q13796 1616 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPS27-211ENST00000522042 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.88□□□□□ -0.03
MRPS27-211ENST00000522042 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
MRPS27-211ENST00000522042 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.86□□□□□ -0.03
MRPS27-211ENST00000522042 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
MRPS27-211ENST00000522042 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MRPS27-211ENST00000522042 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
MRPS27-211ENST00000522042 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
MRPS27-211ENST00000522042 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.84□□□□□ -0.03
MRPS27-211ENST00000522042 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
MRPS27-211ENST00000522042 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.83□□□□□ -0.04
MRPS27-211ENST00000522042 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
MRPS27-211ENST00000522042 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.81□□□□□ -0.04
MRPS27-211ENST00000522042 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
MRPS27-211ENST00000522042 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
MRPS27-211ENST00000522042 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
MRPS27-211ENST00000522042 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
MRPS27-211ENST00000522042 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
MRPS27-211ENST00000522042 PTPRGP23470 1445 aa14.77□□□□□ -0.04
MRPS27-211ENST00000522042 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
MRPS27-211ENST00000522042 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.76□□□□□ -0.05
MRPS27-211ENST00000522042 ABCA8O94911 1581 aa14.76□□□□□ -0.05
MRPS27-211ENST00000522042 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
MRPS27-211ENST00000522042 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.73□□□□□ -0.05
MRPS27-211ENST00000522042 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
MRPS27-211ENST00000522042 OSCARQ8IYS5 282 aa14.72□□□□□ -0.05
MRPS27-211ENST00000522042 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.71□□□□□ -0.05
MRPS27-211ENST00000522042 UACAQ9BZF9 1416 aa14.7□□□□□ -0.06
MRPS27-211ENST00000522042 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
MRPS27-211ENST00000522042 NCOA2Q15596 1464 aa14.69□□□□□ -0.06
MRPS27-211ENST00000522042 ARHGEF11O15085 1522 aa14.68□□□□□ -0.06
MRPS27-211ENST00000522042 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.68□□□□□ -0.06
MRPS27-211ENST00000522042 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
MRPS27-211ENST00000522042 ABCC2Q92887 1545 aa14.67□□□□□ -0.06
MRPS27-211ENST00000522042 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.67□□□□□ -0.06
MRPS27-211ENST00000522042 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.66□□□□□ -0.06
MRPS27-211ENST00000522042 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.66□□□□□ -0.06
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