RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
TRPS1-211ENST00000520276 MIER1Q8N108 512 aa14.98□□□□□ -0.01
TRPS1-211ENST00000520276 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPS1-211ENST00000520276 P3H3Q8IVL6 736 aa14.97□□□□□ -0.01
TRPS1-211ENST00000520276 IGF1RP08069 1367 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
TRPS1-211ENST00000520276 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
TRPS1-211ENST00000520276 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.93□□□□□ -0.02
TRPS1-211ENST00000520276 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.92□□□□□ -0.02
TRPS1-211ENST00000520276 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.91□□□□□ -0.02
TRPS1-211ENST00000520276 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.91□□□□□ -0.02
TRPS1-211ENST00000520276 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRPS1-211ENST00000520276 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.88□□□□□ -0.03
TRPS1-211ENST00000520276 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.87□□□□□ -0.03
TRPS1-211ENST00000520276 JPH4Q96JJ6 628 aa14.87□□□□□ -0.03
TRPS1-211ENST00000520276 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
TRPS1-211ENST00000520276 GOLGA3Q08378 1498 aa14.84□□□□□ -0.03
TRPS1-211ENST00000520276 SYNJ2O15056 1496 aa14.82□□□□□ -0.04
TRPS1-211ENST00000520276 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TRPS1-211ENST00000520276 ARID3CA6NKF2 412 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPS1-211ENST00000520276 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.81□□□□□ -0.04
TRPS1-211ENST00000520276 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.8□□□□□ -0.04
TRPS1-211ENST00000520276 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.79□□□□□ -0.04
TRPS1-211ENST00000520276 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TRPS1-211ENST00000520276 GRIN2AQ12879 1464 aa14.74□□□□□ -0.05
TRPS1-211ENST00000520276 WDR97A6NE52 1622 aa14.72□□□□□ -0.05
TRPS1-211ENST00000520276 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TRPS1-211ENST00000520276 CLIP1P30622 1438 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPS1-211ENST00000520276 CUL7Q14999 1698 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPS1-211ENST00000520276 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPS1-211ENST00000520276 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRPS1-211ENST00000520276 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRPS1-211ENST00000520276 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.66□□□□□ -0.06
TRPS1-211ENST00000520276 PTPRGP23470 1445 aa14.66□□□□□ -0.06
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TRPS1-211ENST00000520276 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.65□□□□□ -0.06
TRPS1-211ENST00000520276 PBRM1Q86U86 1689 aa14.64□□□□□ -0.07
TRPS1-211ENST00000520276 ADAMTS12P58397 1594 aa14.63□□□□□ -0.07
TRPS1-211ENST00000520276 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.62□□□□□ -0.07
TRPS1-211ENST00000520276 KCNH8Q96L42 1107 aa14.61□□□□□ -0.07
TRPS1-211ENST00000520276 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.61□□□□□ -0.07
TRPS1-211ENST00000520276 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.61□□□□□ -0.07
TRPS1-211ENST00000520276 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.61□□□□□ -0.07
TRPS1-211ENST00000520276 BCANQ96GW7 911 aa14.6□□□□□ -0.07
TRPS1-211ENST00000520276 CEP162Q5TB80 1403 aa14.59□□□□□ -0.07
TRPS1-211ENST00000520276 KIF21BO75037 1637 aa14.55□□□□□ -0.08
TRPS1-211ENST00000520276 NUP160Q12769 1436 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPS1-211ENST00000520276 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.54□□□□□ -0.08
TRPS1-211ENST00000520276 IQGAP2Q13576 1575 aa14.54□□□□□ -0.08
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TRPS1-211ENST00000520276 FMN1Q68DA7 1419 aa14.52□□□□□ -0.08
TRPS1-211ENST00000520276 CHD1O14646 1710 aa14.51□□□□□ -0.09
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TRPS1-211ENST00000520276 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.49□□□□□ -0.09
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TRPS1-211ENST00000520276 CEP170Q5SW79 1584 aa14.44□□□□□ -0.1
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TRPS1-211ENST00000520276 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
TRPS1-211ENST00000520276 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.39□□□□□ -0.11
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGEF11O15085 1522 aa14.39□□□□□ -0.11
TRPS1-211ENST00000520276 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.36□□□□□ -0.11
TRPS1-211ENST00000520276 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.35□□□□□ -0.11
TRPS1-211ENST00000520276 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.35□□□□□ -0.11
TRPS1-211ENST00000520276 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.34□□□□□ -0.11
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TRPS1-211ENST00000520276 KIAA0556O60303 1618 aa14.29□□□□□ -0.12
TRPS1-211ENST00000520276 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
TRPS1-211ENST00000520276 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.28□□□□□ -0.12
TRPS1-211ENST00000520276 DISP1Q96F81 1524 aa14.28□□□□□ -0.12
TRPS1-211ENST00000520276 ARAP1Q96P48 1450 aa14.28□□□□□ -0.12
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TRPS1-211ENST00000520276 TSPY10P0CW01 314 aa14.26□□□□□ -0.13
TRPS1-211ENST00000520276 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.26□□□□□ -0.13
TRPS1-211ENST00000520276 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
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TRPS1-211ENST00000520276 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.23□□□□□ -0.13
TRPS1-211ENST00000520276 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.23□□□□□ -0.13
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.22□□□□□ -0.13
TRPS1-211ENST00000520276 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
TRPS1-211ENST00000520276 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
TRPS1-211ENST00000520276 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.2□□□□□ -0.14
TRPS1-211ENST00000520276 HECW1Q76N89 1606 aa14.2□□□□□ -0.14
TRPS1-211ENST00000520276 ABCC2Q92887 1545 aa14.19□□□□□ -0.14
TRPS1-211ENST00000520276 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.19□□□□□ -0.14
TRPS1-211ENST00000520276 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
TRPS1-211ENST00000520276 ASXL2Q76L83 1435 aa14.18□□□□□ -0.14
TRPS1-211ENST00000520276 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
TRPS1-211ENST00000520276 NEFLP07196 543 aa14.16□□□□□ -0.14
TRPS1-211ENST00000520276 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.16□□□□□ -0.14
TRPS1-211ENST00000520276 ATP10BO94823 1461 aa14.15□□□□□ -0.14
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