RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 MSH5O43196 834 aa12.19□□□□□ -0.46
TRPS1-209ENST00000519674 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.19□□□□□ -0.46
TRPS1-209ENST00000519674 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.19□□□□□ -0.46
TRPS1-209ENST00000519674 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.19□□□□□ -0.46
TRPS1-209ENST00000519674 ERICH6BQ5W0A0 696 aa12.18□□□□□ -0.46
TRPS1-209ENST00000519674 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.18□□□□□ -0.46
TRPS1-209ENST00000519674 TOPBP1Q92547 1522 aa12.17□□□□□ -0.46
TRPS1-209ENST00000519674 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
TRPS1-209ENST00000519674 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.16□□□□□ -0.46
TRPS1-209ENST00000519674 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
TRPS1-209ENST00000519674 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
TRPS1-209ENST00000519674 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.14□□□□□ -0.47
TRPS1-209ENST00000519674 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.13□□□□□ -0.47
TRPS1-209ENST00000519674 SLC24A1O60721 1099 aa12.11□□□□□ -0.47
TRPS1-209ENST00000519674 DEKP35659 375 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TRPS1-209ENST00000519674 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TRPS1-209ENST00000519674 FANCIQ9NVI1 1328 aa12.09□□□□□ -0.47
TRPS1-209ENST00000519674 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
TRPS1-209ENST00000519674 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.07□□□□□ -0.48
TRPS1-209ENST00000519674 P3H3Q8IVL6 736 aa12.06□□□□□ -0.48
TRPS1-209ENST00000519674 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.06□□□□□ -0.48
TRPS1-209ENST00000519674 CUL7Q14999 1698 aa12.05□□□□□ -0.48
TRPS1-209ENST00000519674 WDR97A6NE52 1622 aa12.05□□□□□ -0.48
TRPS1-209ENST00000519674 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC136Q96JN2 1154 aa12.03□□□□□ -0.48
TRPS1-209ENST00000519674 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
TRPS1-209ENST00000519674 TIAM1Q13009 1591 aa12.03□□□□□ -0.48
TRPS1-209ENST00000519674 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-209ENST00000519674 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-209ENST00000519674 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-209ENST00000519674 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-209ENST00000519674 CCNB3Q8WWL7 1395 aa12□□□□□ -0.49
TRPS1-209ENST00000519674 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TRPS1-209ENST00000519674 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TRPS1-209ENST00000519674 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-209ENST00000519674 ITGAEP38570 1179 aa11.99□□□□□ -0.49
TRPS1-209ENST00000519674 BCANQ96GW7 911 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-209ENST00000519674 MAP3K1Q13233 1512 aa11.98□□□□□ -0.49
TRPS1-209ENST00000519674 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-209ENST00000519674 EFCAB5A4FU69 1503 aa11.97□□□□□ -0.49
TRPS1-209ENST00000519674 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-209ENST00000519674 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-209ENST00000519674 FKBP8Q14318 412 aa11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-209ENST00000519674 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
TRPS1-209ENST00000519674 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TRPS1-209ENST00000519674 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-209ENST00000519674 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-209ENST00000519674 PKNOX2Q96KN3 472 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-209ENST00000519674 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.91□□□□□ -0.5
TRPS1-209ENST00000519674 FMN1Q68DA7 1419 aa11.9□□□□□ -0.5
TRPS1-209ENST00000519674 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-209ENST00000519674 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-209ENST00000519674 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-209ENST00000519674 PBRM1Q86U86 1689 aa11.89□□□□□ -0.51
TRPS1-209ENST00000519674 SAMD9Q5K651 1589 aa11.88□□□□□ -0.51
TRPS1-209ENST00000519674 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-209ENST00000519674 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TRPS1-209ENST00000519674 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa11.86□□□□□ -0.51
TRPS1-209ENST00000519674 IL27Q8NEV9 243 aa11.85□□□□□ -0.51
TRPS1-209ENST00000519674 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.84□□□□□ -0.51
TRPS1-209ENST00000519674 ADAMTS12P58397 1594 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-209ENST00000519674 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.83□□□□□ -0.52
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TRPS1-209ENST00000519674 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.82□□□□□ -0.52
TRPS1-209ENST00000519674 GRIN2BQ13224 1484 aa11.81□□□□□ -0.52
TRPS1-209ENST00000519674 NEFLP07196 543 aa11.81□□□□□ -0.52
TRPS1-209ENST00000519674 WDR62O43379 1518 aa11.8□□□□□ -0.52
TRPS1-209ENST00000519674 IQGAP2Q13576 1575 aa11.8□□□□□ -0.52
TRPS1-209ENST00000519674 PLEKHG5O94827 1062 aa11.79□□□□□ -0.52
TRPS1-209ENST00000519674 IFT140Q96RY7 1462 aa11.79□□□□□ -0.52
TRPS1-209ENST00000519674 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.78□□□□□ -0.52
TRPS1-209ENST00000519674 MAPKBP1O60336 1514 aa11.78□□□□□ -0.52
TRPS1-209ENST00000519674 ERCC6Q03468 1493 aa11.77□□□□□ -0.52
TRPS1-209ENST00000519674 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 NCOA2Q15596 1464 aa11.76□□□□□ -0.53
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TRPS1-209ENST00000519674 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 KCNH8Q96L42 1107 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 PODXL2Q9NZ53 605 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.73□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 ARID3CA6NKF2 412 aa11.73□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 HECW1Q76N89 1606 aa11.73□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.73□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 NBR1Q14596 966 aa11.73□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.72□□□□□ -0.53
TRPS1-209ENST00000519674 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-209ENST00000519674 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-209ENST00000519674 UGGT2Q9NYU1 1516 aa11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-209ENST00000519674 PTPRKQ15262 1439 aa11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-209ENST00000519674 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-209ENST00000519674 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-209ENST00000519674 GRIN2AQ12879 1464 aa11.69□□□□□ -0.54
TRPS1-209ENST00000519674 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.69□□□□□ -0.54
TRPS1-209ENST00000519674 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-209ENST00000519674 ARHGEF11O15085 1522 aa11.68□□□□□ -0.54
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