RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.49■■■■■ 4.71
SH3BP2-212ENST00000508338 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.49■■■■■ 4.71
SH3BP2-212ENST00000508338 SHROOM2Q13796 1616 aa44.46■■■■■ 4.71
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP44.42■■■■■ 4.7
SH3BP2-212ENST00000508338 JPH4Q96JJ6 628 aa44.37■■■■■ 4.69
SH3BP2-212ENST00000508338 KIF21BO75037 1637 aa44.32■■■■■ 4.68
SH3BP2-212ENST00000508338 IQGAP2Q13576 1575 aa44.31■■■■■ 4.68
SH3BP2-212ENST00000508338 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.26■■■■■ 4.68
SH3BP2-212ENST00000508338 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.24■■■■■ 4.67
SH3BP2-212ENST00000508338 ARAP1Q96P48 1450 aa44.17■■■■■ 4.66
SH3BP2-212ENST00000508338 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.1■■■■■ 4.65
SH3BP2-212ENST00000508338 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa44.1■■■■■ 4.65
SH3BP2-212ENST00000508338 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.09■■■■■ 4.65
SH3BP2-212ENST00000508338 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.07■■■■■ 4.65
SH3BP2-212ENST00000508338 GOLGA3Q08378 1498 aa44.07■■■■■ 4.65
SH3BP2-212ENST00000508338 DISP1Q96F81 1524 aa43.91■■■■■ 4.62
SH3BP2-212ENST00000508338 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.89■■■■■ 4.62
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SH3BP2-212ENST00000508338 KIAA0556O60303 1618 aa43.86■■■■■ 4.61
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPRGP23470 1445 aa43.8■■■■■ 4.6
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SH3BP2-212ENST00000508338 SAMD9Q5K651 1589 aa43.7■■■■■ 4.59
SH3BP2-212ENST00000508338 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.66■■■■■ 4.58
SH3BP2-212ENST00000508338 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
SH3BP2-212ENST00000508338 UACAQ9BZF9 1416 aa43.52■■■■■ 4.56
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SH3BP2-212ENST00000508338 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.51■■■■■ 4.56
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SH3BP2-212ENST00000508338 ABCA8O94911 1581 aa43.36■■■■■ 4.53
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SH3BP2-212ENST00000508338 FMN1Q68DA7 1419 aa43.25■■■■■ 4.51
SH3BP2-212ENST00000508338 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.25■■■■■ 4.51
SH3BP2-212ENST00000508338 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.22■■■■■ 4.51
SH3BP2-212ENST00000508338 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.2■■■■■ 4.51
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SH3BP2-212ENST00000508338 CEP162Q5TB80 1403 aa43.12■■■■■ 4.49
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SH3BP2-212ENST00000508338 ASXL2Q76L83 1435 aa43.02■■■■■ 4.48
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SH3BP2-212ENST00000508338 HECW1Q76N89 1606 aa42.97■■■■■ 4.47
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.89■■■■■ 4.46
SH3BP2-212ENST00000508338 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.88■■■■■ 4.46
SH3BP2-212ENST00000508338 DIP2BQ9P265 1576 aa42.88■■■■■ 4.45
SH3BP2-212ENST00000508338 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.87■■■■■ 4.45
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SH3BP2-212ENST00000508338 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.83■■■■■ 4.45
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
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SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.74■■■■■ 4.43
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SH3BP2-212ENST00000508338 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
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SH3BP2-212ENST00000508338 KCNH8Q96L42 1107 aa42.62■■■■■ 4.41
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SH3BP2-212ENST00000508338 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.57■■■■■ 4.4
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SH3BP2-212ENST00000508338 CD109Q6YHK3 1445 aa42.46■■■■■ 4.39
SH3BP2-212ENST00000508338 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.44■■■■■ 4.38
SH3BP2-212ENST00000508338 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.4■■■■■ 4.38
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SH3BP2-212ENST00000508338 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 PREX2Q70Z35 1606 aa42■■■■■ 4.31
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SH3BP2-212ENST00000508338 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.97■■■■■ 4.31
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