RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492265.1

GRB10-223, Transcript of growth factor receptor bound protein 10, human

TSL 3

Gene GRB10, Length 447 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRB10-223	ENST00000492265	WDR62	O43379	1518 aa		7.54	□□□□□ -1.2
GRB10-223	ENST00000492265	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
GRB10-223	ENST00000492265	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GRB10-223	ENST00000492265	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		7.52	□□□□□ -1.21
GRB10-223	ENST00000492265	CUL7	Q14999	1698 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GRB10-223	ENST00000492265	CUX2	O14529	1486 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GRB10-223	ENST00000492265	CEP162	Q5TB80	1403 aa		7.51	□□□□□ -1.21
GRB10-223	ENST00000492265	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		7.5	□□□□□ -1.21
GRB10-223	ENST00000492265	PBRM1	Q86U86	1689 aa		7.49	□□□□□ -1.21
GRB10-223	ENST00000492265	IGF1R	P08069	1367 aa		7.47	□□□□□ -1.21
GRB10-223	ENST00000492265	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		7.46	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	ABCB7	O75027	752 aa		7.44	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		7.43	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	IFT140	Q96RY7	1462 aa		7.43	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	ADAMTS12	P58397	1594 aa		7.43	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		7.42	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	CLIP1	P30622	1438 aa		7.42	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	ERCC6	Q03468	1493 aa		7.41	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	ARAP1	Q96P48	1450 aa		7.41	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		7.4	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		7.4	□□□□□ -1.22
GRB10-223	ENST00000492265	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	SAMD9	Q5K651	1589 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	GRIN2B	Q13224	1484 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	SLC4A2	P04920	1241 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	APLP2	Q06481	763 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GRB10-223	ENST00000492265	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	IQGAP2	Q13576	1575 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	MAP3K1	Q13233	1512 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		7.32	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	GRIN2A	Q12879	1464 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	SYNJ2	O15056	1496 aa		7.3	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	TIAM1	Q13009	1591 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	CEP170	Q5SW79	1584 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		7.29	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	HRC	P23327	699 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	NUP160	Q12769	1436 aa		7.27	□□□□□ -1.24
GRB10-223	ENST00000492265	KIAA0556	O60303	1618 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GRB10-223	ENST00000492265	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GRB10-223	ENST00000492265	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
GRB10-223	ENST00000492265	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
GRB10-223	ENST00000492265	CHD1	O14646	1710 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GRB10-223	ENST00000492265	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GRB10-223	ENST00000492265	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		7.26	□□□□□ -1.25
GRB10-223	ENST00000492265	DISP1	Q96F81	1524 aa		7.25	□□□□□ -1.25
GRB10-223	ENST00000492265	FMN1	Q68DA7	1419 aa		7.24	□□□□□ -1.25
GRB10-223	ENST00000492265	SHROOM2	Q13796	1616 aa		7.23	□□□□□ -1.25
GRB10-223	ENST00000492265	HECW1	Q76N89	1606 aa		7.23	□□□□□ -1.25
GRB10-223	ENST00000492265	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		7.22	□□□□□ -1.25
GRB10-223	ENST00000492265	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.25
GRB10-223	ENST00000492265	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		7.19	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	ARHGEF11	O15085	1522 aa		7.19	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		7.19	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		7.18	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		7.18	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		7.17	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	ABCA8	O94911	1581 aa		7.16	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	POLA2	Q14181	598 aa		7.15	□□□□□ -1.26
GRB10-223	ENST00000492265	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		7.15	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	AKT1S1	Q96B36	256 aa		7.14	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	P3H3	Q8IVL6	736 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		7.13	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		7.12	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	7.12	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	NCOA2	Q15596	1464 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		7.11	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		7.1	□□□□□ -1.27
GRB10-223	ENST00000492265	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27

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