RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.52■■■■□ 3.28
HOXD10-202ENST00000490088 GOLGA3Q08378 1498 aa35.45■■■■□ 3.27
HOXD10-202ENST00000490088 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.41■■■■□ 3.26
HOXD10-202ENST00000490088 IQGAP2Q13576 1575 aa35.4■■■■□ 3.26
HOXD10-202ENST00000490088 JPH4Q96JJ6 628 aa35.38■■■■□ 3.25
HOXD10-202ENST00000490088 SHROOM2Q13796 1616 aa35.38■■■■□ 3.25
HOXD10-202ENST00000490088 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
HOXD10-202ENST00000490088 ARHGEF11O15085 1522 aa35.32■■■■□ 3.25
HOXD10-202ENST00000490088 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
HOXD10-202ENST00000490088 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXD10-202ENST00000490088 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXD10-202ENST00000490088 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.27■■■■□ 3.24
HOXD10-202ENST00000490088 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.25■■■■□ 3.23
HOXD10-202ENST00000490088 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.22■■■■□ 3.23
HOXD10-202ENST00000490088 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.15■■■■□ 3.22
HOXD10-202ENST00000490088 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
HOXD10-202ENST00000490088 DISP1Q96F81 1524 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXD10-202ENST00000490088 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.11■■■■□ 3.21
HOXD10-202ENST00000490088 ARAP1Q96P48 1450 aa35.09■■■■□ 3.21
HOXD10-202ENST00000490088 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.09■■■■□ 3.21
HOXD10-202ENST00000490088 KIAA0556O60303 1618 aa35.06■■■■□ 3.2
HOXD10-202ENST00000490088 SAMD9Q5K651 1589 aa35■■■■□ 3.19
HOXD10-202ENST00000490088 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.99■■■■□ 3.19
HOXD10-202ENST00000490088 P3H3Q8IVL6 736 aa34.98■■■■□ 3.19
HOXD10-202ENST00000490088 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
HOXD10-202ENST00000490088 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXD10-202ENST00000490088 PTPRGP23470 1445 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXD10-202ENST00000490088 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.88■■■■□ 3.17
HOXD10-202ENST00000490088 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.87■■■■□ 3.17
HOXD10-202ENST00000490088 CLIP1P30622 1438 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXD10-202ENST00000490088 CEP162Q5TB80 1403 aa34.81■■■■□ 3.16
HOXD10-202ENST00000490088 UACAQ9BZF9 1416 aa34.7■■■■□ 3.15
HOXD10-202ENST00000490088 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.7■■■■□ 3.15
HOXD10-202ENST00000490088 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.67■■■■□ 3.14
HOXD10-202ENST00000490088 ABCA8O94911 1581 aa34.65■■■■□ 3.14
HOXD10-202ENST00000490088 ABCC2Q92887 1545 aa34.62■■■■□ 3.13
HOXD10-202ENST00000490088 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.61■■■■□ 3.13
HOXD10-202ENST00000490088 FMN1Q68DA7 1419 aa34.6■■■■□ 3.13
HOXD10-202ENST00000490088 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.56■■■■□ 3.12
HOXD10-202ENST00000490088 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.49■■■■□ 3.11
HOXD10-202ENST00000490088 ARID3CA6NKF2 412 aa34.46■■■■□ 3.11
HOXD10-202ENST00000490088 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
HOXD10-202ENST00000490088 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.45■■■■□ 3.11
HOXD10-202ENST00000490088 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
HOXD10-202ENST00000490088 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
HOXD10-202ENST00000490088 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
HOXD10-202ENST00000490088 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.4■■■■□ 3.1
HOXD10-202ENST00000490088 HECW1Q76N89 1606 aa34.39■■■■□ 3.1
HOXD10-202ENST00000490088 ATP10BO94823 1461 aa34.38■■■■□ 3.09
HOXD10-202ENST00000490088 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.35■■■■□ 3.09
HOXD10-202ENST00000490088 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.34■■■■□ 3.09
HOXD10-202ENST00000490088 MAPKBP1O60336 1514 aa34.31■■■■□ 3.08
HOXD10-202ENST00000490088 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
HOXD10-202ENST00000490088 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
HOXD10-202ENST00000490088 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
HOXD10-202ENST00000490088 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
HOXD10-202ENST00000490088 ASXL2Q76L83 1435 aa34.28■■■■□ 3.08
HOXD10-202ENST00000490088 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.25■■■■□ 3.07
HOXD10-202ENST00000490088 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.2■■■■□ 3.06
HOXD10-202ENST00000490088 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.18■■■■□ 3.06
HOXD10-202ENST00000490088 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXD10-202ENST00000490088 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
HOXD10-202ENST00000490088 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXD10-202ENST00000490088 DIP2BQ9P265 1576 aa34.08■■■■□ 3.05
HOXD10-202ENST00000490088 KCNH8Q96L42 1107 aa34.08■■■■□ 3.05
HOXD10-202ENST00000490088 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
HOXD10-202ENST00000490088 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.04■■■■□ 3.04
HOXD10-202ENST00000490088 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.01■■■■□ 3.04
HOXD10-202ENST00000490088 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34■■■■□ 3.03
HOXD10-202ENST00000490088 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34■■■■□ 3.03
HOXD10-202ENST00000490088 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
HOXD10-202ENST00000490088 TIAM1Q13009 1591 aa34■■■■□ 3.03
HOXD10-202ENST00000490088 GLI2P10070 1586 aa33.97■■■■□ 3.03
HOXD10-202ENST00000490088 APLP2Q06481 763 aa33.94■■■■□ 3.02
HOXD10-202ENST00000490088 MAP3K1Q13233 1512 aa33.93■■■■□ 3.02
HOXD10-202ENST00000490088 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.92■■■■□ 3.02
HOXD10-202ENST00000490088 KIF14Q15058 1648 aa33.89■■■■□ 3.02
HOXD10-202ENST00000490088 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.87■■■■□ 3.01
HOXD10-202ENST00000490088 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.86■■■■□ 3.01
HOXD10-202ENST00000490088 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.01
HOXD10-202ENST00000490088 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.85■■■■□ 3.01
HOXD10-202ENST00000490088 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
HOXD10-202ENST00000490088 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.84■■■■□ 3.01
HOXD10-202ENST00000490088 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.82■■■■□ 3
HOXD10-202ENST00000490088 CD109Q6YHK3 1445 aa33.81■■■■□ 3
HOXD10-202ENST00000490088 TSPOAP1O95153 1857 aa33.77■■■■□ 3
HOXD10-202ENST00000490088 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
HOXD10-202ENST00000490088 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
HOXD10-202ENST00000490088 NCOA2Q15596 1464 aa33.68■■■□□ 2.98
HOXD10-202ENST00000490088 PLCH2O75038 1416 aa33.65■■■□□ 2.98
HOXD10-202ENST00000490088 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.65■■■□□ 2.98
HOXD10-202ENST00000490088 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.64■■■□□ 2.98
HOXD10-202ENST00000490088 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
HOXD10-202ENST00000490088 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.62■■■□□ 2.97
HOXD10-202ENST00000490088 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
HOXD10-202ENST00000490088 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.59■■■□□ 2.97
HOXD10-202ENST00000490088 PREX2Q70Z35 1606 aa33.59■■■□□ 2.97
HOXD10-202ENST00000490088 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.57■■■□□ 2.96
HOXD10-202ENST00000490088 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.57■■■□□ 2.96
HOXD10-202ENST00000490088 FANCAO15360 1455 aa33.56■■■□□ 2.96
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