RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489155.1

PFN2-211, Transcript of profilin 2, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PFN2, Length 636 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2-211ENST00000489155 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.63■■■■■ 4.09
PFN2-211ENST00000489155 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.63■■■■■ 4.09
PFN2-211ENST00000489155 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.63■■■■■ 4.09
PFN2-211ENST00000489155 SHROOM2Q13796 1616 aa40.61■■■■■ 4.09
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PFN2-211ENST00000489155 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
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PFN2-211ENST00000489155 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.25■■■■■ 4.03
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PFN2-211ENST00000489155 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.24■■■■□ 3.87
PFN2-211ENST00000489155 HECW1Q76N89 1606 aa39.23■■■■□ 3.87
PFN2-211ENST00000489155 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa39.2■■■■□ 3.87
PFN2-211ENST00000489155 ARID3CA6NKF2 412 aa39.19■■■■□ 3.86
PFN2-211ENST00000489155 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.16■■■■□ 3.86
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PFN2-211ENST00000489155 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP39.15■■■■□ 3.86
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PFN2-211ENST00000489155 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
PFN2-211ENST00000489155 PLEKHD1A6NEE1 506 aa39.03■■■■□ 3.84
PFN2-211ENST00000489155 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.02■■■■□ 3.84
PFN2-211ENST00000489155 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa39■■■■□ 3.83
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PFN2-211ENST00000489155 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.97■■■■□ 3.83
PFN2-211ENST00000489155 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.87■■■■□ 3.81
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PFN2-211ENST00000489155 ABCA9Q8IUA7 1624 aa38.81■■■■□ 3.8
PFN2-211ENST00000489155 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP38.8■■■■□ 3.8
PFN2-211ENST00000489155 TSPOAP1O95153 1857 aa38.79■■■■□ 3.8
PFN2-211ENST00000489155 CD109Q6YHK3 1445 aa38.78■■■■□ 3.8
PFN2-211ENST00000489155 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
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PFN2-211ENST00000489155 KIF14Q15058 1648 aa38.68■■■■□ 3.78
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PFN2-211ENST00000489155 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
PFN2-211ENST00000489155 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
PFN2-211ENST00000489155 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa38.38■■■■□ 3.73
PFN2-211ENST00000489155 PREX2Q70Z35 1606 aa38.37■■■■□ 3.73
PFN2-211ENST00000489155 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.35■■■■□ 3.73
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