RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482902.5

SSR4-209, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene SSR4, Length 2,409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-209ENST00000482902 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.12■■□□□ 1.77
SSR4-209ENST00000482902 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.1■■□□□ 1.77
SSR4-209ENST00000482902 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.1■■□□□ 1.77
SSR4-209ENST00000482902 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.08■■□□□ 1.77
SSR4-209ENST00000482902 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.07■■□□□ 1.76
SSR4-209ENST00000482902 P3H3Q8IVL6 736 aa26.07■■□□□ 1.76
SSR4-209ENST00000482902 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.07■■□□□ 1.76
SSR4-209ENST00000482902 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.06■■□□□ 1.76
SSR4-209ENST00000482902 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.04■■□□□ 1.76
SSR4-209ENST00000482902 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SSR4-209ENST00000482902 TOPBP1Q92547 1522 aa26.02■■□□□ 1.76
SSR4-209ENST00000482902 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.76
SSR4-209ENST00000482902 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.01■■□□□ 1.75
SSR4-209ENST00000482902 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SSR4-209ENST00000482902 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.99■■□□□ 1.75
SSR4-209ENST00000482902 MAPKBP1O60336 1514 aa25.98■■□□□ 1.75
SSR4-209ENST00000482902 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.98■■□□□ 1.75
SSR4-209ENST00000482902 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SSR4-209ENST00000482902 NESP48681 1621 aa25.96■■□□□ 1.75
SSR4-209ENST00000482902 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.93■■□□□ 1.74
SSR4-209ENST00000482902 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.91■■□□□ 1.74
SSR4-209ENST00000482902 CUL7Q14999 1698 aa25.9■■□□□ 1.74
SSR4-209ENST00000482902 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.89■■□□□ 1.74
SSR4-209ENST00000482902 BCL11AQ9H165 835 aa25.88■■□□□ 1.73
SSR4-209ENST00000482902 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.731e-7■■■■■ 36.9
SSR4-209ENST00000482902 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.82■■□□□ 1.72
SSR4-209ENST00000482902 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.8■■□□□ 1.72
SSR4-209ENST00000482902 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SSR4-209ENST00000482902 FMN1Q68DA7 1419 aa25.79■■□□□ 1.72
SSR4-209ENST00000482902 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.726e-8■■□□□ 11.8
SSR4-209ENST00000482902 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.76■■□□□ 1.71
SSR4-209ENST00000482902 WDR97A6NE52 1622 aa25.75■■□□□ 1.71
SSR4-209ENST00000482902 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SSR4-209ENST00000482902 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.73■■□□□ 1.71
SSR4-209ENST00000482902 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.7■■□□□ 1.71
SSR4-209ENST00000482902 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.69■■□□□ 1.7
SSR4-209ENST00000482902 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.69■■□□□ 1.7
SSR4-209ENST00000482902 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.68■■□□□ 1.7
SSR4-209ENST00000482902 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.68■■□□□ 1.7
SSR4-209ENST00000482902 KCNH8Q96L42 1107 aa25.66■■□□□ 1.7
SSR4-209ENST00000482902 SAMD9Q5K651 1589 aa25.65■■□□□ 1.7
SSR4-209ENST00000482902 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.63■■□□□ 1.69
SSR4-209ENST00000482902 BCANQ96GW7 911 aa25.61■■□□□ 1.69
SSR4-209ENST00000482902 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SSR4-209ENST00000482902 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SSR4-209ENST00000482902 GRIN2BQ13224 1484 aa25.58■■□□□ 1.69
SSR4-209ENST00000482902 PTPRKQ15262 1439 aa25.57■■□□□ 1.68
SSR4-209ENST00000482902 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.56■■□□□ 1.68
SSR4-209ENST00000482902 NCOA2Q15596 1464 aa25.56■■□□□ 1.68
SSR4-209ENST00000482902 FKBP8Q14318 412 aa25.55■■□□□ 1.68
SSR4-209ENST00000482902 HFM1A2PYH4 1435 aa25.55■■□□□ 1.68
SSR4-209ENST00000482902 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.54■■□□□ 1.68
SSR4-209ENST00000482902 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.53■■□□□ 1.68
SSR4-209ENST00000482902 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.53■■□□□ 1.68
SSR4-209ENST00000482902 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
SSR4-209ENST00000482902 UACAQ9BZF9 1416 aa25.5■■□□□ 1.67
SSR4-209ENST00000482902 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.49■■□□□ 1.67
SSR4-209ENST00000482902 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SSR4-209ENST00000482902 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.49■■□□□ 1.67
SSR4-209ENST00000482902 TONSLQ96HA7 1378 aa25.48■■□□□ 1.67
SSR4-209ENST00000482902 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SSR4-209ENST00000482902 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.48■■□□□ 1.67
SSR4-209ENST00000482902 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SSR4-209ENST00000482902 NAIPQ13075 1403 aa25.46■■□□□ 1.67
SSR4-209ENST00000482902 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SSR4-209ENST00000482902 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.42■■□□□ 1.66
SSR4-209ENST00000482902 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.4■■□□□ 1.66
SSR4-209ENST00000482902 ARHGEF11O15085 1522 aa25.39■■□□□ 1.66
SSR4-209ENST00000482902 NEFLP07196 543 aa25.34■■□□□ 1.65
SSR4-209ENST00000482902 HECW1Q76N89 1606 aa25.33■■□□□ 1.65
SSR4-209ENST00000482902 ANP32CO43423 234 aa25.33■■□□□ 1.65
SSR4-209ENST00000482902 PBRM1Q86U86 1689 aa25.33■■□□□ 1.64
SSR4-209ENST00000482902 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.32■■□□□ 1.64
SSR4-209ENST00000482902 IQGAP2Q13576 1575 aa25.32■■□□□ 1.64
SSR4-209ENST00000482902 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SSR4-209ENST00000482902 CCER2I3L3R5 266 aa25.31■■□□□ 1.64
SSR4-209ENST00000482902 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.31■■□□□ 1.64
SSR4-209ENST00000482902 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SSR4-209ENST00000482902 ADAMTS12P58397 1594 aa25.29■■□□□ 1.64
SSR4-209ENST00000482902 MSH5O43196 834 aa25.27■■□□□ 1.64
SSR4-209ENST00000482902 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SSR4-209ENST00000482902 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.24■■□□□ 1.63
SSR4-209ENST00000482902 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.23■■□□□ 1.63
SSR4-209ENST00000482902 TRIM52Q96A61 297 aa25.23■■□□□ 1.63
SSR4-209ENST00000482902 ARID3CA6NKF2 412 aa25.22■■□□□ 1.63
SSR4-209ENST00000482902 AKNAQ7Z591 1439 aa25.22■■□□□ 1.63
SSR4-209ENST00000482902 MIA2Q96PC5 1412 aa25.22■■□□□ 1.63
SSR4-209ENST00000482902 WDR62O43379 1518 aa25.21■■□□□ 1.63
SSR4-209ENST00000482902 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.21■■□□□ 1.63
SSR4-209ENST00000482902 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SSR4-209ENST00000482902 KDM6BO15054 1643 aa25.16■■□□□ 1.62
SSR4-209ENST00000482902 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.13■■□□□ 1.61
SSR4-209ENST00000482902 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.13■■□□□ 1.61
SSR4-209ENST00000482902 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SSR4-209ENST00000482902 IFT140Q96RY7 1462 aa25.1■■□□□ 1.61
SSR4-209ENST00000482902 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SSR4-209ENST00000482902 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.07■■□□□ 1.6
SSR4-209ENST00000482902 DISP1Q96F81 1524 aa25.06■■□□□ 1.6
SSR4-209ENST00000482902 KIAA0556O60303 1618 aa25.05■■□□□ 1.6
SSR4-209ENST00000482902 DAPK1P53355 1430 aa25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms