RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.03□□□□□ -1.12
SHQ1-208ENST00000482785 IFFO2Q5TF58 517 aa8.02□□□□□ -1.13
SHQ1-208ENST00000482785 FAM69CQ0P6D2 419 aa8.01□□□□□ -1.13
SHQ1-208ENST00000482785 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.01□□□□□ -1.13
SHQ1-208ENST00000482785 CADPSQ9ULU8 1353 aa8□□□□□ -1.13
SHQ1-208ENST00000482785 TSPOAP1O95153 1857 aa8□□□□□ -1.13
SHQ1-208ENST00000482785 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SHQ1-208ENST00000482785 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SHQ1-208ENST00000482785 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa7.97□□□□□ -1.13
SHQ1-208ENST00000482785 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SHQ1-208ENST00000482785 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SHQ1-208ENST00000482785 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.13
SHQ1-208ENST00000482785 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SHQ1-208ENST00000482785 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SHQ1-208ENST00000482785 ABCC10Q5T3U5 1492 aa7.93□□□□□ -1.14
SHQ1-208ENST00000482785 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.93□□□□□ -1.14
SHQ1-208ENST00000482785 APLP2Q06481 763 aa7.92□□□□□ -1.14
SHQ1-208ENST00000482785 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
SHQ1-208ENST00000482785 IFT140Q96RY7 1462 aa7.91□□□□□ -1.14
SHQ1-208ENST00000482785 TOP2BQ02880 1626 aa7.9□□□□□ -1.14
SHQ1-208ENST00000482785 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
SHQ1-208ENST00000482785 DIP2BQ9P265 1576 aa7.88□□□□□ -1.15
SHQ1-208ENST00000482785 CAPN15O75808 1086 aa7.88□□□□□ -1.15
SHQ1-208ENST00000482785 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SHQ1-208ENST00000482785 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
SHQ1-208ENST00000482785 SYNJ1O43426 1573 aa7.85□□□□□ -1.15
SHQ1-208ENST00000482785 DSG3P32926 999 aa7.85□□□□□ -1.15
SHQ1-208ENST00000482785 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.85□□□□□ -1.15
SHQ1-208ENST00000482785 HSPA2P54652 639 aa7.83□□□□□ -1.16
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
SHQ1-208ENST00000482785 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.82□□□□□ -1.16
SHQ1-208ENST00000482785 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
SHQ1-208ENST00000482785 PTPRMP28827 1452 aa7.77□□□□□ -1.17
SHQ1-208ENST00000482785 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
SHQ1-208ENST00000482785 MAPKBP1O60336 1514 aa7.74□□□□□ -1.17
SHQ1-208ENST00000482785 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
SHQ1-208ENST00000482785 PLCB2Q00722 1185 aa7.7□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 PEG3Q9GZU2 1588 aa7.69□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 KIF21BO75037 1637 aa7.68□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 ABCB7O75027 752 aa7.68□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.67□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 FBXO3Q9UK99 471 aa7.67□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.67□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 POLA2Q14181 598 aa7.66□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 CEP170Q5SW79 1584 aa7.66□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 HSPA1LP34931 641 aa7.65□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 TOPBP1Q92547 1522 aa7.65□□□□□ -1.18
SHQ1-208ENST00000482785 LTBP4Q8N2S1 1624 aa7.64□□□□□ -1.19
SHQ1-208ENST00000482785 CFTRP13569 1480 aa7.64□□□□□ -1.19
SHQ1-208ENST00000482785 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
SHQ1-208ENST00000482785 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.63□□□□□ -1.19
SHQ1-208ENST00000482785 IQSEC2Q5JU85 1478 aa7.62□□□□□ -1.19
SHQ1-208ENST00000482785 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
SHQ1-208ENST00000482785 STRCQ7RTU9 1775 aa7.61□□□□□ -1.19
SHQ1-208ENST00000482785 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
SHQ1-208ENST00000482785 PTPRTO14522 1441 aa7.59□□□□□ -1.19
SHQ1-208ENST00000482785 MROH2BQ7Z745 1585 aa7.59□□□□□ -1.2
SHQ1-208ENST00000482785 BCANQ96GW7 911 aa7.58□□□□□ -1.2
SHQ1-208ENST00000482785 MADDQ8WXG6 1647 aa7.58□□□□□ -1.2
SHQ1-208ENST00000482785 ADCY10Q96PN6 1610 aa7.58□□□□□ -1.2
SHQ1-208ENST00000482785 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-208ENST00000482785 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP7.56□□□□□ -1.2
SHQ1-208ENST00000482785 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-208ENST00000482785 SLC34A2O95436 690 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-208ENST00000482785 POTEAQ6S8J7 498 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-208ENST00000482785 SHROOM2Q13796 1616 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-208ENST00000482785 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.54□□□□□ -1.2
SHQ1-208ENST00000482785 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SHQ1-208ENST00000482785 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SHQ1-208ENST00000482785 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa7.52□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 GLI2P10070 1586 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 BCORL1Q5H9F3 1711 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 PROM2Q8N271 834 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 PRDM2Q13029 1718 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 PIP4K2BP78356 416 aa7.49□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 DNMBPQ6XZF7 1577 aa7.48□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 GRIN2BQ13224 1484 aa7.48□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.47□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa7.47□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 ABCC8Q09428 1581 aa7.46□□□□□ -1.21
SHQ1-208ENST00000482785 TEX14Q8IWB6 1497 aa7.46□□□□□ -1.22
SHQ1-208ENST00000482785 CFAP43Q8NDM7 1665 aa7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-208ENST00000482785 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SHQ1-208ENST00000482785 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-208ENST00000482785 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-208ENST00000482785 SOGA1O94964 1423 aa7.43□□□□□ -1.22
SHQ1-208ENST00000482785 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-208ENST00000482785 PKD2Q13563 968 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-208ENST00000482785 NUP160Q12769 1436 aa7.42□□□□□ -1.22
SHQ1-208ENST00000482785 ASXL2Q76L83 1435 aa7.42□□□□□ -1.22
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