RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475153.5

ZNF398-202, Transcript of zinc finger protein 398, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF398, Length 2,860 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398-202ENST00000475153 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.64■■■□□ 2.02
ZNF398-202ENST00000475153 CUX2O14529 1486 aa27.64■■■□□ 2.01
ZNF398-202ENST00000475153 P3H3Q8IVL6 736 aa27.62■■■□□ 2.01
ZNF398-202ENST00000475153 MSH5O43196 834 aa27.62■■■□□ 2.01
ZNF398-202ENST00000475153 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.58■■■□□ 2.01
ZNF398-202ENST00000475153 NCAPD3P42695 1498 aa27.57■■■□□ 2
ZNF398-202ENST00000475153 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.54■■■□□ 2
ZNF398-202ENST00000475153 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.53■■■□□ 2
ZNF398-202ENST00000475153 ANP32CO43423 234 aa27.51■■□□□ 1.99
ZNF398-202ENST00000475153 CUX1P39880 1505 aa27.49■■□□□ 1.99
ZNF398-202ENST00000475153 KIF27Q86VH2 1401 aa27.48■■□□□ 1.99
ZNF398-202ENST00000475153 HMGXB3Q12766 1538 aa27.48■■□□□ 1.99
ZNF398-202ENST00000475153 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.44■■□□□ 1.98
ZNF398-202ENST00000475153 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
ZNF398-202ENST00000475153 CCER2I3L3R5 266 aa27.34■■□□□ 1.97
ZNF398-202ENST00000475153 TIAM1Q13009 1591 aa27.32■■□□□ 1.96
ZNF398-202ENST00000475153 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa27.31■■□□□ 1.96
ZNF398-202ENST00000475153 IGF1RP08069 1367 aa27.28■■□□□ 1.96
ZNF398-202ENST00000475153 CFTRP13569 1480 aa27.27■■□□□ 1.96
ZNF398-202ENST00000475153 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.27■■□□□ 1.96
ZNF398-202ENST00000475153 CCDC184Q52MB2 194 aa27.22■■□□□ 1.95
ZNF398-202ENST00000475153 TONSLQ96HA7 1378 aa27.21■■□□□ 1.95
ZNF398-202ENST00000475153 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
ZNF398-202ENST00000475153 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.17■■□□□ 1.94
ZNF398-202ENST00000475153 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.17■■□□□ 1.94
ZNF398-202ENST00000475153 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.14■■□□□ 1.93
ZNF398-202ENST00000475153 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.11■■□□□ 1.93
ZNF398-202ENST00000475153 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.1■■□□□ 1.93
ZNF398-202ENST00000475153 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.1■■□□□ 1.93
ZNF398-202ENST00000475153 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.09■■□□□ 1.93
ZNF398-202ENST00000475153 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
ZNF398-202ENST00000475153 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
ZNF398-202ENST00000475153 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.07■■□□□ 1.92
ZNF398-202ENST00000475153 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.06■■□□□ 1.92
ZNF398-202ENST00000475153 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.05■■□□□ 1.92
ZNF398-202ENST00000475153 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.05■■□□□ 1.92
ZNF398-202ENST00000475153 PTPRKQ15262 1439 aa27.05■■□□□ 1.92
ZNF398-202ENST00000475153 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
ZNF398-202ENST00000475153 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.01■■□□□ 1.914e-8■■■□□ 16.3
ZNF398-202ENST00000475153 NESP48681 1621 aa27■■□□□ 1.91
ZNF398-202ENST00000475153 MAP3K1Q13233 1512 aa27■■□□□ 1.91
ZNF398-202ENST00000475153 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.99■■□□□ 1.91
ZNF398-202ENST00000475153 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.98■■□□□ 1.91
ZNF398-202ENST00000475153 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.96■■□□□ 1.91
ZNF398-202ENST00000475153 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.91
ZNF398-202ENST00000475153 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.95■■□□□ 1.91
ZNF398-202ENST00000475153 NBR1Q14596 966 aa26.94■■□□□ 1.9
ZNF398-202ENST00000475153 FOXD1Q16676 465 aa26.94■■□□□ 1.9
ZNF398-202ENST00000475153 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.91■■□□□ 1.9
ZNF398-202ENST00000475153 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.91■■□□□ 1.9
ZNF398-202ENST00000475153 PRDM2Q13029 1718 aa26.9■■□□□ 1.9
ZNF398-202ENST00000475153 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.89■■□□□ 1.9
ZNF398-202ENST00000475153 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
ZNF398-202ENST00000475153 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.88■■□□□ 1.89
ZNF398-202ENST00000475153 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
ZNF398-202ENST00000475153 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.86■■□□□ 1.89
ZNF398-202ENST00000475153 MRS2Q9HD23 443 aa26.85■■□□□ 1.89
ZNF398-202ENST00000475153 UACAQ9BZF9 1416 aa26.84■■□□□ 1.89
ZNF398-202ENST00000475153 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.84■■□□□ 1.89
ZNF398-202ENST00000475153 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.83■■□□□ 1.89
ZNF398-202ENST00000475153 NAIPQ13075 1403 aa26.8■■□□□ 1.88
ZNF398-202ENST00000475153 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.79■■□□□ 1.88
ZNF398-202ENST00000475153 ARID3CA6NKF2 412 aa26.79■■□□□ 1.88
ZNF398-202ENST00000475153 HFM1A2PYH4 1435 aa26.78■■□□□ 1.88
ZNF398-202ENST00000475153 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
ZNF398-202ENST00000475153 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
ZNF398-202ENST00000475153 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.76■■□□□ 1.87
ZNF398-202ENST00000475153 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.75■■□□□ 1.87
ZNF398-202ENST00000475153 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.75■■□□□ 1.87
ZNF398-202ENST00000475153 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.73■■□□□ 1.87
ZNF398-202ENST00000475153 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.71■■□□□ 1.87
ZNF398-202ENST00000475153 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
ZNF398-202ENST00000475153 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
ZNF398-202ENST00000475153 AKNAQ7Z591 1439 aa26.68■■□□□ 1.86
ZNF398-202ENST00000475153 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.67■■□□□ 1.86
ZNF398-202ENST00000475153 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.67■■□□□ 1.86
ZNF398-202ENST00000475153 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
ZNF398-202ENST00000475153 NCOA2Q15596 1464 aa26.64■■□□□ 1.86
ZNF398-202ENST00000475153 TOPBP1Q92547 1522 aa26.64■■□□□ 1.85
ZNF398-202ENST00000475153 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
ZNF398-202ENST00000475153 FMN1Q68DA7 1419 aa26.63■■□□□ 1.85
ZNF398-202ENST00000475153 CCDC7Q96M83 1385 aa26.62■■□□□ 1.85
ZNF398-202ENST00000475153 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.62■■□□□ 1.85
ZNF398-202ENST00000475153 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.6■■□□□ 1.85
ZNF398-202ENST00000475153 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.6■■□□□ 1.85
ZNF398-202ENST00000475153 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.59■■□□□ 1.85
ZNF398-202ENST00000475153 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.59■■□□□ 1.85
ZNF398-202ENST00000475153 KDM6BO15054 1643 aa26.58■■□□□ 1.85
ZNF398-202ENST00000475153 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.57■■□□□ 1.84
ZNF398-202ENST00000475153 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.57■■□□□ 1.84
ZNF398-202ENST00000475153 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.54■■□□□ 1.84
ZNF398-202ENST00000475153 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
ZNF398-202ENST00000475153 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
ZNF398-202ENST00000475153 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
ZNF398-202ENST00000475153 NCOA1Q15788 1441 aa26.51■■□□□ 1.83
ZNF398-202ENST00000475153 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.5■■□□□ 1.83
ZNF398-202ENST00000475153 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
ZNF398-202ENST00000475153 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.47■■□□□ 1.83
ZNF398-202ENST00000475153 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.45■■□□□ 1.83
ZNF398-202ENST00000475153 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms